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High-bandwidth microrheology of cytoskeletal networks

dc.contributor.advisorSchmidt, Christoph F. Prof. Dr.de
dc.contributor.authorBremerich, Marcelde
dc.date.accessioned2012-02-08T06:55:05Zde
dc.date.accessioned2013-01-18T14:21:42Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:17Zde
dc.date.issued2012-02-08de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B5DA-3de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-3147
dc.description.abstractDie Materialeigenschaften, die Organisation und der Aufbau des Zytoskeletts sind immer noch weitgehend unverstanden. In dieser Arbeit werden die viskoelastischen Eigenschaften von Zytoskelett-Netzwerken mit Hilfe der Mikrorheologie untersucht. Es wurde ein kompakter, rauscharmer, auf optischen Fallen basierender Mikrorheologieaufbau mit großer Frequenzbandbreite konstruiert, der passive und aktive Ein- und Zwei-Partikel Mikrorheologiemessungen erlaubt. Zwei unabhängige optischen Fallen verschiedener Wellenlänge sind implementiert, die sich akusto- und elektrooptisch mit hoher Präzision und großem Frequenzbereich verfahren lassen. Das speziell angefertigte Mikroskop beinhaltet Differentialinterferenzkontrast, sowie Fluoreszenzbeleuchtung und die Probe kann piezoelektrisch mit hoher Präzision in 3D positioniert werden. Die optische Justage, Drift und das Rauschverhalten des Aufbaus wird in einer einfachen viskosen Flüssigkeit, sowie in lebenden Zellen getestet. Mikrorheologiemessungen mit hoher Frequenzbandbreite werden in einer Vielzahl von Modelsystemen durchgeführt. Es werden einfache Netzwerke aus Mikrotubuli und Nichtgleichgewichtsnetzwerke aus Mikrotubuli und Motorproteinen untersucht. Ein Kompositnetzwerk aus Mikrotubuli und F-Aktin mit und ohne Quervernetzung wird beschrieben und die viskoelastischen Eigenschaften über eine große Frequenzbandbreite ermittelt. Weiterhin wird ein Nichtgleichgewichtssystem mit Mikrotubuli, F-Aktin und Mikrotubuli assoziierten Motorproteinen charakterisiert. Eine neue Mikrorheologietechnik, die steife Filamente verwendet wird entwickelt und in einem F-Aktin Netzwerk getestet. Mikrotubuli werden in einem verschlauften F-Aktin Netzwerk eingebettet. Nanometergroße Goldkugeln werden an die Mikrotubuli gebunden und deren Bewegung mit einer optischen Falle gemessen. Die Kontur des Filaments ist eine Superposition aus Fouriermoden und die Fluktuationen an einer Stelle entlang des Filaments beinhaltet bereits die gesamte Biegedynamik, die wiederum Rückschlüsse auf das umgebende Material zulässt, welches die Bewegung des Filaments einschränkt. Erste Resultate für den komplexen Schermodul des F-Aktin Netzwerks sind in Übereinstimmung mit theoretischen Beschreibungen und herkömmlichen Mikrorheologiemessungen des gleichen Probensystems.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/de
dc.titleHigh-bandwidth microrheology of cytoskeletal networksde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedMikrorheologie mit hoher Bandbreite in Zytoskelett-Netzwerkende
dc.contributor.refereeSchmidt, Christoph F. Prof. Dr.de
dc.date.examination2012-01-18de
dc.subject.dnb530 Physikde
dc.description.abstractengThe understanding of the material properties, the organization and the assembly of the cytoskeleton remains challenging. In this thesis the viscoelastic properties of cytoskeletal networks were investigated using microrheology. An optical trapping based microrheology setup has been constructed, which is more compact and less sensitive to noise, while allowing sampling with higher bandwidth compared to existing setups. Passive and active one- and two-particle microrheology can be performed using two independent optical traps with different wavelengths, which are steerable with high precision using acousto- as well as electro-optical deflection. The custom-built microscope includes DIC and fluorescence illumination and high-precision three-dimensional positioning of the sample is achieved by a piezoelectric stage. The alignment, drift and noise performance of the setup has been tested in a simple viscous fluid and in living cells. High-bandwidth microrheological measurements in a variety of model systems were performed. Simple microtubule networks were investigated, as well as a nonequilibrium system of microtubules together with motor proteins. A composite network consisting of microtubules and F-actin with and without cross-linkers is described and its viscoelastic properties were measured over a wide range of frequencies. Furthermore, a nonequilibrium system involving microtubules and F-actin as well as microtubule-associated motor proteins has been characterized. A novel technique called stiff filament microrheology has been developed and tested in a network of F-actin. Microtubules were embedded in an entangled solution of F-actin. Nanometer-sized gold beads were attached to the microtubules and their motion has been tracked by an optical trap. The shape of the filament is analyzed as a superposition of Fourier modes and the fluctuations at a point along the filament already comprises the whole bending dynamics, which can be related to the material properties of the surrounding network restricting the filament s motion. First results for the complex shear modulus of F-actin were in agreement with the theoretical expectation and standard microrheology measurements of the same sample system.de
dc.contributor.coRefereeBodenschatz, Eberhard Prof. Dr.de
dc.contributor.thirdRefereeZippelius, Annette Prof. Dr.de
dc.subject.topicGöttingen Graduate School for Neurosciences and Molecular Biosciences (GGNB)de
dc.subject.gerMikrorheologiede
dc.subject.gerOptische Fallede
dc.subject.gerZytoskelettde
dc.subject.gersemiflexible Polymerede
dc.subject.engMicrorheologyde
dc.subject.engoptical trapde
dc.subject.engcytoskeletonde
dc.subject.engsemiflexible polymersde
dc.subject.bk42.12de
dc.subject.bk33.90de
dc.subject.bk33.79de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-3360-9de
dc.identifier.purlwebdoc-3360de
dc.affiliation.instituteGöttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften und molekulare Biowissenschaften (GGNB)de
dc.subject.gokfullWC 000: Biophysikde
dc.subject.gokfullRVI 300: Polymere {Physik: Nichtkristalline Festkörper}de
dc.subject.gokfullRPV 280: Mikroskop {Physik: Optik}de
dc.subject.gokfullRFK 000: Rheologie {Physik: Mechanik}de
dc.identifier.ppn688581595de


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