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Expressionsanalyse des humanen Histonsubtyps H1x

dc.contributor.advisorDoenecke, Detlef Prof. Dr.de
dc.contributor.authorWarneboldt, Juliade
dc.date.accessioned2012-04-16T14:51:08Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:28Zde
dc.date.issued2008-06-02de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-ACF3-1de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-258
dc.description.abstractDie Organisation der DNA im Zellkern wird durch Chromatin und Proteine ermöglicht. Die strukturelle Grundeinheit des Chromatins ist das Nukleosom, das aus dem Nukleosomenkernpartikel, der Linker-DNA und den H1-Histonen besteht. H1-Histone sind chromosomale Proteine, die nicht nur an der Kondensierung der DNA beteiligt sind, sondern auch eine entscheidende Rolle bei der Steuerung der Genexpression, der DNA-Replikation und der DNA-Reparatur spielen. Bisher wurden im Menschen elf homologe H1-Proteine beschrieben, darunter das ubiquitär exprimierte H1x. Ein Vergleich der biochemischen Eigenschaften von H1x und anderen H1 Subtypen zeigte Gemeinsamkeiten, aber auch Unterschiede zwischen H1x und den übrigen H1-Subtypen, die auf spezielle Funktionen von H1x hindeuten. In der vorliegenden Arbeit konnte gezeigt werden, daß H1x replikationsunabhängig exprimiert wird. Eine Promotoranalyse der genomischen Sequenz von H1x ergab, daß der Promotor von H1x in Bezug auf Art und Position der regulatorischen Elemente Ähnlichkeit mit dem Promotor des replikationsunabhängig exprimierten H1.0 aufweist. Beide Gene enthalten ein upstream positive element und eine TATA-Box, aber keine funktionelle CCAAT-Box. Dennoch unterscheidet sich das Expressionsmuster von H1x vom ebenfalls replikationsunabhängig exprimierten Replacementhiston H1.0. Dies wird durch Zellzyklusuntersuchungen und der vergleichenden Analyse der mRNA-Mengen von H1x in adultem und fötalem Gewebe in Proben aus Lunge und Dickdarm gestützt. Hier zeigen sich nur geringe Unterschiede zwischen den H1x-mRNA-Mengen. Damit bestätigt sich, daß keine generelle Korrelation zwischen der vermehrten Expression von H1x und Zellproliferation besteht. Aufgrund des Ergebnisses einer BLAST-Datenbankrecherche, die eine erhöhte Trefferrate von H1x-ESTs (expressed sequence tags) in Tumordatenbanken neuroendokriner Tumore (NETs) ergeben hatte, untersuchte ich die Expression von H1x in NETs aus Lunge und Gastrointestinaltrakt. Immunhistochemie, Western Blot-Analyse und real-time RT-PCR zeigen eine vermehrte Expression sowohl von H1x-mRNA als auch von H1x-Protein in wenig differenzierten neuroendokrinen Karzinomen im Vergleich zu nicht-neoplastischem Gewebe. Diese Ergebnisse machen deutlich, daß H1x eventuell zur Klassifizierung der vielfältigen und schlecht charakterisierten neuroendokrinen Tumore oder zur Beurteilung ihrer Dignität beitragen könnte.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isogerde
dc.rights.urihttp://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.htmlde
dc.titleExpressionsanalyse des humanen Histonsubtyps H1xde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedExpression analysis of human histone subtype H1xde
dc.contributor.refereeDoenecke, Detlef Prof. Dr.de
dc.date.examination2007-07-05de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaften, Biologiede
dc.description.abstractengNuclear eukaryotic DNA is organised as chromatin in conjunction with proteins. The basal structural organisation unit of chromatin is the nucleosome consisting of the nucleosome core particle, linker DNA and histone H1. The H1 proteins are not only chromosomal proteins important for condensation of DNA but also play a role in gene expression, DNA replication and DNA repair. To date, eleven H1 homologous proteins have been described in humans, including the ubiquitously expressed subtype H1x. Comparison of the biochemical behaviour of H1x with other H1 subtypes reveals similarities but also shows characteristic variations, which suggest special functions of H1x. In the present work I can show that H1x is expressed replication-independent. A promoter analysis of the genomic sequence of H1x unfold a similarity concerning nature and position between the regulatory elements of the H1x and the promoter of the replication-independently expressed histone H1.0. Both genes have a positive upstream element and a TATA box, but no functional CCAAT box. Nevertheless, the cell cycle analysis as well as the comparison of H1x mRNA from foetal and adult tissue reveals that its expression pattern differs from that of H1.0. There is no general correlation between a higher expression of H1x and cell proliferation detectable. Based on results of a Blast data base search which shows an accumulation of expressed sequence tags (ESTs) of H1x in libraries from neuroendocrine tumours (NETs), I evaluated the expression of H1x in NET from lung and the gastrointestinal tract. Immunohistochemistry, western blot analysis and real-time RT-PCR demonstrate an increased expression of H1x in poorly differentiated neuroendocrine carcinomas compared to corresponding non-neoplastic tissue. These results reveal that H1x could be useful for the classification of the multifaceted neuroendocrine tumours or for the analysis of their dignity.de
dc.contributor.coRefereeHardeland, Rüdiger Prof. Dr.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.gerH1 Histonde
dc.subject.gerH1xde
dc.subject.gerH1.0de
dc.subject.gerneuroendokriner Tumorde
dc.subject.gerZellzyklusde
dc.subject.gerPromotorde
dc.subject.engH1 histonede
dc.subject.engH1xde
dc.subject.engH1.0de
dc.subject.engneuroendocrine tumourde
dc.subject.engcell cyclede
dc.subject.engpromoterde
dc.subject.bk42.15de
dc.subject.bk42.13de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-1808-7de
dc.identifier.purlwebdoc-1808de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWHde
dc.subject.gokfullWFde
dc.identifier.ppn591104199de


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