dc.contributor.advisor | Sheldrick, George M. Prof. Dr. | de |
dc.contributor.author | Krätzner, Ralph | de |
dc.date.accessioned | 2001-08-15T12:08:11Z | de |
dc.date.accessioned | 2013-01-18T10:39:35Z | de |
dc.date.available | 2013-01-30T23:51:25Z | de |
dc.date.issued | 2001-08-15 | de |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B5F8-E | de |
dc.identifier.uri | http://dx.doi.org/10.53846/goediss-2196 | |
dc.description.abstract | Die Inhibitor-Cystinknoten-Familie enthält eine
große Anzahl von kleinen, nur ca. 30 Aminosäuren
umfassenden Mikroproteinen, die eine hohe Diversität
hinsichtlich ihrer inhibitorischen Eigenschaften
zeigen. Das charakteristische Strukturmerkmal dieser
Naturstoffe ist der sogenannte Cystinknoten, durch den
die Polypeptidkette über drei Cystinbrücken fixiert
wird. Er ersetzt den hydrophoben Kern größerer Proteine
und ermöglicht somit eine Faltung im konformationellen
Sinne. Hierbei ist das erste Cystein mit dem vierten,
das zweite mit dem fünften und das dritte mit dem
sechsten Cysteinrest der Polypeptidsequenz verknüpft.
Der 30 Aminosäuren lange Ecballium elaterium Trypsin
Inhibitor-II (EETI-II) ist ein typischer Vertreter
dieser Proteinfamilie. EETI-II wurde erstmals aus Samen
des Kürbisgewächses Ecballium elaterium isoliert und
hemmt Trypsin mit einer nanomolaren
Dissoziationskonstante. Die hohe strukturelle Toleranz
des Inhibitor-Cystinknotenmotivs gegenüber Nicht-
Cystein Substitutionen macht EETI-II zu einem idealen
Rahmenwerk für die Generierung von konformationell
eingeschränkten Peptid-Bibliotheken, aus denen
Varianten mit neuen Eigenschaften isoliert werden
können. In diesem Projekt wurden Einkristalle von
EETI-II gezüchtet, die mit Methoden der
Röntgenstrukturanalyse vermessen wurden. Zur
Untersuchung der nativen inhibitorischen Funktion wurde
EETI-II im Komplex mit Trypsin aus dem Schweinepankreas
kristallisiert, die Röntgenstruktur wurde bei einer
Auflösung von 1.6 Å bestimmt. Die Strukturen von drei
Faltungs-Varianten von EETI-II, die im c-terminalen
loop mutiert waren, wurden ebenfalls im Komplex mit
Trypsin untersucht. Ihre Röntgenstrukturen wurden mit
denen des Wildtyps und ähnlichen Strukturen anderer
Inhibitoren verglichen. | de |
dc.format.mimetype | application/pdf | de |
dc.language.iso | ger | de |
dc.rights.uri | http://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyrdiss.htm | de |
dc.title | Strukturelle Untersuchungen an Varianten des Ecballium elaterium Trypsin Inhibitors-II (EETI-II) | de |
dc.type | doctoralThesis | de |
dc.title.translated | Structural characterization of variants of the Ecballium elaterium trypsin inhibitor EETI-II | de |
dc.contributor.referee | Sheldrick, George M. Prof. Dr. | de |
dc.date.examination | 2001-06-27 | de |
dc.subject.dnb | 500 Naturwissenschaften allgemein | de |
dc.description.abstracteng | The inhibitor cystine-knot family is composed of a
large number of small, around 30 amino acids long
proteins, that show a diversity of inhibitory
functions. The characteristic structural feature of
these microproteins is the so called cystine-knot
motif, which fixes the polypeptide chain by 3 cystine
bridges and compensates for the lack of a hydrophobic
core region present in larger proteins. Typically the
first cysteine binds to the fourth, the second to the
fifth and the third to the sixth cysteine residue in
the polypeptide chain. The 30 amino acids long
Ecballium elaterium Trypsin Inhibitor (II), EETI-II, is
a typical member of this family. It was first isolated
from squash seeds and inhibits trypsin with a nanomolar
dissociation constant. Given the very high tolerance of
its fold for non-cysteine amino acid substitutions,
EETI-II is an ideal framework for the generation of a
constrained peptide library, from which variants of new
properties can be isolated by repertoire techniques. In
this work crystals of EETI-II were grown and X-ray
diffraction data measured. To study the native
inhibitory function the complex of EETI-II wildtype
with porcine trypsin was crystallized and the X-ray
structure was determined at 1.6 Å resolution. The
crystal structures of three folding variants of this
inhibitor, carrying mutations in the c-terminal loop,
were also studied in complex with porcine trypsin.
Their X-ray structures were compared to the wildtype
and related structures of other inhibitors. | de |
dc.contributor.coReferee | Susse, Peter Prof. Dr. | de |
dc.subject.topic | Mathematics and Computer Science | de |
dc.subject.ger | EETI-II | de |
dc.subject.ger | Cystinknoten | de |
dc.subject.ger | Mikroprotein | de |
dc.subject.ger | Trypsin | de |
dc.subject.ger | Protease | de |
dc.subject.ger | Inhibitor | de |
dc.subject.ger | squash | de |
dc.subject.ger | Röntgenstruktur | de |
dc.subject.eng | EETI-II | de |
dc.subject.eng | cystine-knot | de |
dc.subject.eng | microprotein | de |
dc.subject.eng | trypsin | de |
dc.subject.eng | protease | de |
dc.subject.eng | inhibitor | de |
dc.subject.eng | squash | de |
dc.subject.eng | X-ray structure | de |
dc.subject.bk | 35.25 | de |
dc.subject.bk | 35.70 | de |
dc.identifier.urn | urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-1027-9 | de |
dc.identifier.purl | webdoc-1027 | de |
dc.affiliation.institute | Fakultät für Chemie | de |
dc.subject.gokfull | SP 000: Strukturchemie | de |
dc.identifier.ppn | 33402370X | |