Detection and effects of latent contamination of potato tubers by soft rot bacteria, and investigations on the effect of hydrogen peroxide on lipopolysaccharides of Erwinia carotovora in relation to acquired resistance against biocides

Nachweis und Auswirkungen des latenten Befalls von Kartoffelknollen durch Weichfäule-Bakterien und Untersuchungen zum Einfluss von Wasserstoffperoxid auf die Lipopolysaccharide von Erwinia carotovora im Hinblick auf die erworbene Resistenz gegen Biozide.

by Mamdoh Ewis Esmael Ahmed
Doctoral thesis
Date of Examination:2001-11-22
Date of issue:2001-11-16
Advisor:Dr. Klaus Rudolph
Referee:Prof. Dr. Hans-Heinrich Hoppe
Referee:Prof. Dr. Ulrich Eberhardt
Persistent Address: http://dx.doi.org/10.53846/goediss-1702

 

 

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Description:Dissertation

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Abstract

English

For a sensitive detection of latent contamination of potato tubers by soft rot causing erwinias [Erwinia carotovora subsp. atroseptica (Eca), and Erwinia carotovora subsp. carotovora (Ecc)], the semi-selective double layer medium of Bdliya (1995) was improved resulting in a detection limit as low as 2 X 10 1 cfu/ml. Field experiments proved that seed potato lots assessed as moderately or strongly contaminated by Ecc gave lower yields and less quality than potato lots assessed as weakly contaminated. By applying PCR and the primer setsY1/ Y2 or Eca1f /Eca2r the detection limit of Eca in potato peel extract was 10 2 cfu/ml. Field experiments with seed potatoes treated with Degaclean revealed a reduced germination rate of the treated potatoes and increased percentage of tubers with soft rot, so that yields after treatment of seed potatoes were reduced. The repeating unit of the LPS-O-chain of Ecc 436 was elucidated as a tetrasaccharide of the following structure:
Keywords: Investigations; potato; tubers; Erwinia; carotovora

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Fur einen empfindlichen Nachweis der latenten Kontamination von Kartoffelknollen mit Weichfaule erregenden Erwinien [Erwinia carotovora subsp. atroseptica (Eca) und Erwinia carotovora subsp. carotovora (Ecc)] wurde das semi-selektive Zweischichten-Medium von Bdliya (1995) so verbessert, dass die Nachweisgrenze nur 2 X 10 1 cfu/ml betrug. Feldversuche ergaben, dass Saatkartoffel-Partien, die als mittel oder stark mit Ecc kontaminiert eingestuft worden waren, nach der Ernte niedrigere Ertrage von schlechterer Qualitat ergaben als schwach kontaminierte Partien. Bei Anwendung der PCR mit den Primer-Paaren Y1/Y2 oder Eca1f /Eca2r betrug die Nachweisgrenze von Eca in Kartoffelschalen-Extrakten 10 2 cfu/ml. Feldversuche mit Saatkartoffeln, die mit Degaclean behandelt worden waren, ergaben eine verminderte Keimungsrate der behandelten Kartoffeln und einen erhohten Anteil von Kartoffeln mit Weichfaule, so dass die Ernteertrage deutlich reduziert waren. Die Wiederholungseinheit der LPS-O-Kette von Ecc 436 wurde als ein Tetrasaccharid mit folgender Strukturformel aufgeklart:
Schlagwörter: Kartoffelknollen; Erwinia; carotovora
 
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