Metagenomanalyse eines hydrolytischen Konsortiums: Identifizierung und biochemische Charakterisierung von Polysaccharid-abbauenden Biokatalysatoren aus nicht kultivierten Mikroorganismen

Voget, Sonja

dc.contributor.advisor	Streit, Wolfgang Prof. Dr.	de
dc.contributor.author	Voget, Sonja	de
dc.date.accessioned	2012-04-16T14:56:46Z	de
dc.date.available	2013-01-30T23:50:40Z	de
dc.date.issued	2006-05-23	de
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-ABC2-6	de
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.53846/goediss-639
dc.description.abstract	Die Durchmusterung von Umweltgenbanken hat sich in den letzten Jahren als effektive Technik erwiesen, auf den stetig wachsenden Bedarf der Industrie an neuen Biokatalysatoren zu reagieren. Im Rahmen dieser Arbeit wurde eine Umwelt-Genbank eines Boden-Konsortiums durch die Kombination unterschiedlicher metagenomischer Methoden analysiert und darüber hinaus der Nutzen von Anreicherungen zur Erhöhung der Anzahl positiver Klone untersucht.Um diese Ziele zu erreichen wurden folgende Strategien verfolgt:Zum anderen wurde die vorhandene Cosmid-Genbank nach biotechnologisch interessanten Enzymen unter Verwendung unterschiedlicher Durchmusterungsmethoden durchsucht. Um die Wahrscheinlichkeit zu erhöhen biotechnologisch interessante Enzyme zu finden wurde sowohl das klassische, aktivitätsbasierende, als auch die auf Sequenzähnlichkeiten basierende Durchmusterung genutzt. Insgesamt wurden 36 biotechnologisch interessante Gene bzw. deren Produkte aus unterschiedlichen Enzymklassen gefunden.Eine neuartige, äußerst stabile und halotolerante Cellulase wurde zudem einer genauen biochemischen Charakterisierung unterzogen.	de
dc.format.mimetype	application/pdf	de
dc.language.iso	ger	de
dc.rights.uri	http://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.html	de
dc.title	Metagenomanalyse eines hydrolytischen Konsortiums: Identifizierung und biochemische Charakterisierung von Polysaccharid-abbauenden Biokatalysatoren aus nicht kultivierten Mikroorganismen	de
dc.type	doctoralThesis	de
dc.title.translated	Metagenomic analysis of a hydrolytic community: Identification and biochemically characterisation of polysaccharide degrading biocatalysts from non-cultured microorganisms	de
dc.contributor.referee	Streit, Wolfgang Prof. Dr.	de
dc.date.examination	2006-01-17	de
dc.subject.dnb	570 Biowissenschaften, Biologie	de
dc.description.abstracteng	In the past few years, the screening of environmental gene libraries proved to be an effective method to satisfy the constantly increasing demand of the industry for new biocatalysts. During this process the DNA-library of a soil metagenome was analysed by using a combination of different metagenomic methods. Furthermore, the use of enrichment cultures in order to increase the number of positive clones was analysed.To reach theses goals, the following strategies were followed:On the one hand the diversity of the enriched soil metagenome was analysed by comparing the 16S rDNA analysis of the total DNA with the cultivable organisms. The analysis revealed that the soil metagenome consists of at least ten different organisms.On the other hand the cosmid library was then screened for novel biocatalysts by using different screening methods. To increase the chance to find biotechnologically interesting enzymes, both the classical activity-based screening and the screening method based on sequence similarity were used. A total of 36 novel genes or enzymes from different classes were found.Also, a new type of cellulase being extremely stable and halotolerant was subjected to a detailed biochemical characterisation.	de
dc.contributor.coReferee	Daniel, Rolf PD Dr.	de
dc.subject.topic	Mathematics and Computer Science	de
dc.subject.ger	Metagenomik	de
dc.subject.ger	Konsortium	de
dc.subject.ger	Genbanken	de
dc.subject.ger	Screening	de
dc.subject.ger	Cellulase	de
dc.subject.ger	halotolerant	de
dc.subject.eng	Metagenomic	de
dc.subject.eng	soil community	de
dc.subject.eng	screening	de
dc.subject.eng	cellulase	de
dc.subject.eng	halotolerant	de
dc.subject.eng	ph profile	de
dc.subject.bk	42.30	de
dc.subject.bk	42.13	de
dc.identifier.urn	urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-729-8	de
dc.identifier.purl	webdoc-729	de
dc.affiliation.institute	Biologische Fakultät inkl. Psychologie	de
dc.subject.gokfull	WUE 000: Biochemie und Physiologie der Mikroorganismen {Mikrobiologie}	de
dc.subject.gokfull	WUZ 000: Systematische Mikrobiologie	de
dc.subject.gokfull	WUO 400: Bodenmikrobiologie {Mikrobiologie}	de
dc.identifier.ppn	514937874	de

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Fakultät für Biologie und Psychologie (inkl. GAUSS) [1621]

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