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Der Syntaxin 1-Cluster - Organisation und Dynamik einer supramolekularen Struktur der Plasmamembran

dc.contributor.advisorJahn, Reinhard Prof. Dr.de
dc.contributor.authorSieber, Jochen Josefde
dc.date.accessioned2012-04-16T14:47:48Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:48Zde
dc.date.issued2007-06-27de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AC62-5de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-217
dc.description.abstractDie Plasmamembran einer eukaryotischen Zelle zeigt weit mehr laterale Heterogenität als man aufgrund des 1972 von Singer und Nicolson vorgeschlagenen Fluid-Mosaic-Modells erwarten würde. Viele Proteine sind nicht uniform verteilt, sondern in sogenannten Membran-Domänen angereichert. Die Frage, wie die Heterogenität der Plasmamembran zustande kommt und über die Zeit erhalten bleibt, ist nicht abschließend geklärt und die diesbezüglich aufgestellten Hypothesen und Theorien sind zum Teil widersprüchlich. Ein Beispiel eines Typ-IV Membranproteins, das keine uniforme Verteilung zeigt, ist das SNARE-Protein Syntaxin 1, von dem bekannt ist, dass es in sogenannten Clustern aufkonzentriert vorkommt, an denen sekretorische Vesikel bevorzugt docken und mit der Plasmamembran verschmelzen. Mittels STED-Mikroskopie wurde in Zusammenarbeit mit der Abteilung NanoBiophotonik (Leiter Prof. Dr. Stefan Hell) des Max-Planck-Instituts (MPI) für biophysikalische Chemie (Göttingen) die Größe und Dichte des Syntaxin 1-Clusters bestimmt und gezeigt, dass sich auf einem Quadratmikrometer PC12-Plasmamembran durchschnittlich etwa 20 dieser im Mittel 50 60 nm großen Strukturen befinden. Darüber hinaus wurde ein Verhältnis von Syntaxin-Molekülen zu Clustern von ca. 90:1 ermittelt. Auch wurde der Mechanismus untersucht, über den sich diese Strukturen bilden. Der Clustering-Prozess scheint höchst spezifisch abzulaufen und zwischen nahe verwandten Syntaxinen zu unterscheiden. So wurden Syntaxin 1 und Syntaxin 4 in der PC12-Zellmembran in getrennten Clustern organisiert gefunden. Des Weiteren wurde gezeigt, dass die Fähigkeit, sich in Syntaxin 1-Clustern zu organisieren, eine intrinsische Eigenschaft des Proteins selbst ist, und dass höchstwahrscheinlich keine weiteren Ko-Faktoren, außer vielleicht Lipide, für diesen Prozess benötigt werden. Im Detail scheint der Vorgang durch eine über die SNARE-Motive vermittelte Homo-Oligomerisierung abzulaufen, die auch für die beobachtete eingeschränkte Mobilität des Proteins in der Plasmamembran verantwortlich ist. In diesem Zusammenhang ist anzumerken, dass Syntaxin 1-Cluster über einen Zeitraum von 5 Minuten scheinbar immobil sind. Die in FRAP-Experimenten im selben Zeitrahmen beobachtete eingeschränkte Mobilität ist demnach das Ergebnis eines Austauschs von einzelnen Molekülen oder niedrigen Oligomeren zwischen den Clustern. Eine auf diesen Daten basierende in der Abteilung Theoretische und computergestützte Biophysik (Leiter: Dr. Helmut Grubmüller; MPI für biophysikalische Chemie, Göttingen) durchgeführte Computer-Simulation der FRAP-Experimente ergab, dass sich im thermodynamischen Gleichgewicht im Mittel 5/6 der Syntaxin 1-Moleküle innerhalb der stationären Cluster befinden und 1/6 außerhalb frei beweglich ist. Es ergibt sich demnach folgendes Gesamtbild der Organisation und Dynamik des Syntaxin 1-Clusters: Im Mittel liegen je etwa 75 Syntaxin 1-Moleküle in einem stationären Cluster temporär immobilisiert vor (Diffusional-Trapping). Diese Moleküle stehen in einem dynamischen Austausch mit freien (nicht Cluster-assoziierten) Molekülen, die vermittelt über homophile Interaktionen der SNARE-Motive vom Cluster eingefangen werden können. Im Gegenzug ist es auch möglich, dass sich Moleküle aus dem Cluster lösen. Syntaxin 1-Clustering stellt in diesem Szenario ein dynamisches selbstorganisierendes System dar. Abschließend wird ein auf den in dieser Arbeit gewonnenen Erkenntnissen basierendes, spekulatives Modell des Syntaxin 1-Clusters vorgestellt und diskutiert.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isogerde
dc.rights.urihttp://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.htmlde
dc.titleDer Syntaxin 1-Cluster - Organisation und Dynamik einer supramolekularen Struktur der Plasmamembrande
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedThe Syntaxin 1 Cluster - Organisation and Dynamics of a plasmalemmal supramolecular structurede
dc.contributor.refereeJahn, Reinhard Prof. Dr.de
dc.date.examination2007-05-04de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaften, Biologiede
dc.description.abstractengThe plasma membrane of a eukaryotic cell shows much more lateral heterogeneity as would be expected according to the fluid mosaic model proposed by Singer and Nicolson in 1972. Many proteins are not uniformly distributed but enrich in so-called membrane domains. How this heterogeneity of the plasma membrane is achieved has not been finally clarified yet, and hypothesis and theories addressing this topic at least partially contradict each other. The SNARE protein syntaxin 1, that concentrates in so-called clusters, at which secretory vesicles preferentially dock and fuse, is an example of a Type-IV membrane protein that is not uniformly distributed. In this thesis density and size of Syntaxin 1 clusters were determined by STED microscopy in collaboration with department of NanoBiophotonics (head Prof. Dr. Stefan Hell) of the Max-Planck-Institute (MPI) of biophysical chemistry (Göttingen). On average 20 of these 50 60 nm sized structures were found per micrometer of plasma membrane in PC12 cells. Furthermore a ratio of syntaxin molecules to clusters of ca. 90:1 was determined. Also the mechanism of formation and maintenance of these structures was investigated. Clustering seems to occur in a highly specific manner and to distinguish between closely related syntaxins, as syntaxin 1 and 4 were found in strictly separated clusters within the plasma membrane of PC12 cells. Further the ability to form syntaxin 1 clusters was shown to be intrinsic to the protein itself and most likely independent of further cofactors, besides maybe lipids. In detail the process seems to occur via homo-oligomerisation mediated by the SNARE motifs. This oligomerisation also seems to be the reason for the restricted mobility of the protein within the plasma membrane. In this context it has to be mentioned that syntaxin 1 clusters appear immobile over 5 min time. Therefore the restricted mobility observed in FRAP experiments at the same time scale is the result of an exchange of single molecules or small oligomers between clusters. Based on the acquired data a computer simulation of the FRAP experiments was performed in the department of Theoretical and Computational Biophysics (head Prof. Dr. Helmut Grubmüller) at the MPI of Biophysical Chemistry (Göttingen). The obtained results suggest, that in thermodynamic equilibrium 5/6 of the syntaxin 1 molecules are located inside clusters whereas 1/6 is outside of them and freely mobile. The following overall picture regarding organization and dynamics of the syntaxin 1 cluster emerged: On average 75 syntaxin 1 molecules are temporarily immobilized within a stationary cluster (diffusional trapping). A dynamic exchange of these molecules with freely moving ones, which could be captured by the cluster via homophilic interactions of the SNARE-motifs, takes place. On the other hand it is also possible for cluster-associated proteins to dissociate from this structure. In this scenario clustering of syntaxin 1 represents a dynamic self-organizing process. Finally a speculative model, based on the results of this work is introduced and discussed.de
dc.contributor.coRefereeWimmer, Ernst A. Prof. Dr.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.gerSyntaxinde
dc.subject.gerMembrande
dc.subject.gerPlasmamembrande
dc.subject.gerMikrodomänede
dc.subject.gerMembrane-Patterningde
dc.subject.gerMembrane-Raftde
dc.subject.gerSNAREde
dc.subject.engsyntaxinde
dc.subject.engmembranede
dc.subject.engplasma membranede
dc.subject.engmicrodomainde
dc.subject.engmembrane patterningde
dc.subject.engmembrane raftde
dc.subject.engSNAREde
dc.subject.bk42.15de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-1510-1de
dc.identifier.purlwebdoc-1510de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWHC 100: Zellmembranen, Zelloberfläche, Zellwand, intrazelluläre Membranen {Cytologie}de
dc.identifier.ppn579211002de


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