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Genome Sequence Analysis and Characterization of Recombinant Enzymes from the Thermoacidophilic Archaeon Picrophilus torridus

dc.contributor.advisorLiebl, Wolfgang Prof. Dr.de
dc.contributor.authorAngelov, Angelde
dc.date.accessioned2012-04-16T14:50:44Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:48Zde
dc.date.issued2004-09-16de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-ACD9-Ede
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-232
dc.description.abstractPicrophilus torridus ist ein thermo- und acidophiles Archaebacterium, welches mit seinen Wachstumsoptimum bei 60 °C und pH 0,7 den bislang acidophilsten bekannten Organismus repräsentiert. Im Rahmen dieser Arbeit wurde das komplette Genom von P. torridus sequenziert und im Anschluss die identifizierten Gene und die von ihnen potenziell codierten Stoffwechselwege analysiert. Die durch das Genom gewonnenen Informationen wurden im Hinblick auf die einzigartigen Eigenschaften des Organismus interpretiert. Insbesondere war zu erwarten, dass die Genomsequenz von P. torridus eine intensivere Untersuchung der evolutionären Verwandtschaft und des lateralen Gentransfers von Organismen ermöglichen würde, die ähnlich extreme Wachstumsbedingungen haben. Um die Anpassungsmechanismen, die dem Organismus das Überleben bei niedrigen pH Werten erlauben, näher zu untersuchen, wurden mehrere P. torridus Leserahmen zur heterologen Expression ausgewählt. Dabei wurden Standard- (E. coli) und alternative Expressionssysteme (S. solfataricus und S. cerevisiae) verwendet. Zwei rekombinante Enzyme, eine α-Glucosidase (MalP) und eine Glucose-1-Dehydrogenase (GdhA), wurden produziert, aufgereinigt und biochemisch charakterisiert.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.htmlde
dc.titleGenome Sequence Analysis and Characterization of Recombinant Enzymes from the Thermoacidophilic Archaeon Picrophilus torridusde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedSequenzierung und Analyse des Genoms des thermoacidophilen Archaeons Picrophilus torridus und Charakterisierung von rekombinant hergestellten Enzymen dieses Organismusde
dc.contributor.refereeGottschalk, Gerhard Prof. Dr.de
dc.date.examination2004-06-29de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaften, Biologiede
dc.description.abstractengPicrophilus torridus is a thermo- and acidophilic archaeon which grows optimally at 60°C and pH 0.7 and thus represents the most acidophilic organism known so far. In the frame of the current work the complete genome sequence of P. torridus was determined followed by analysis of the identified genes and the possible metabolic pathways which they possibly encode. The information obtained from the genome was further interpreted with respect to the unique characteristics of the organism. In particular, it was anticipated that the genome sequence of P.torridus would allow a more intense examination of the evolutionary relations among organisms that share similar extreme growth conditions under the special consideration of lateral gene transfer. In order to further investigate the adaptation mechanisms allowing the organism to survive at low pH values, several P. torridus open reading frames were selected for heterologous expression. Standard (E. coli) as well as alternative (S. solfataricus and S. cerevisiae) expression systems were used. Two recombinant enzymes were produced and purified, i.e., α-glucosidase (MalP) and glucose-1-dehydrogenase (GdhA), and biochemically characterised.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.gerarchaeade
dc.subject.geracidophilede
dc.subject.gergenomde
dc.subject.gerglucose dehydrogenasede
dc.subject.germaltasede
dc.subject.engarchaeade
dc.subject.engacidophilede
dc.subject.enggenomede
dc.subject.engglucose dehydrogenasede
dc.subject.engmaltasede
dc.subject.bk42.30de
dc.subject.bk42.13de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-160-4de
dc.identifier.purlwebdoc-160de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWUZ 100: Archaebakterien, Archaea {Mikrobiologie}de
dc.subject.gokfullWUE 200: Stoffwechsel und Biochemie der Mikroorganismen {Mikrobiologie}de
dc.identifier.ppn478983050de


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