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Cross-Pathway Control of the Pathogenic Fungus Aspergillus fumigatus: a Manifold Stress Response System

dc.contributor.advisorKrappmann, Sven PD Dr.de
dc.contributor.authorSasse, Christophde
dc.date.accessioned2012-04-16T14:51:39Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:29Zde
dc.date.issued2008-11-10de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AD14-Fde
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-291
dc.description.abstractIn dieser Arbeit wurde die Cross-Pathway Control (CPC) des opportunistisch pathogenen Pilzes A. fumigatus im Hinblick auf mögliche Faktoren untersucht, die eine Anpassung des Organismus innerhalb des Wirtes ermöglichen. Aus vorherigen Studien war bereits bekannt, dass der transkriptionelle Regulator CpcA dieses Systems Einfluss auf die Virulenz hat.Im ersten Teil dieser Arbeit wurden mittels Transkriptomanalyse der Wildtyp und eine cpcA-Deletionsmutante unter Aminosäuremangelbedingungen miteinander verglichen. Dabei wurden 377 Gene identifiziert, deren Expression unter diesen Bedingungen induziert wurde, während die Expression von 146 Genen reprimiert wurde. Die Klassifizierung dieser Gene zeigte, dass die Mehrheit in Wege des primären und sekundären Metabolismus involviert ist. Darüber hinaus wurden eine Vielzahl an Transportern und Permeasen sowie Transkriptionsfaktoren gefunden, als auch ein Dutzend relevanter Gene bzgl. Stressantworten wie z. B. der Neutralisierung oxidativer Moleküle oder Resistenzmechanismen. Unter anderem wurden dabei zwei sog. AAA-ATPasen entdeckt, die aufgrund der Tatsache, dass sie Teil des CpcA-abhängigen Transkriptoms sind, als cdaA und cdaB bezeichnet wurden. Entsprechende Mutantenstämme zeigten als Phänotyp eine ausgeprägte Sensitivität gegenüber dem Zellwandstress induzierenden Wirkstoff Calcofluor White. Diese Ergebnisse zeigen schließlich die Anpassungsfähigkeit des Pilzes auf unterschiedliche Stresseinflüsse mittels des transkriptionellen Regulators CpcA. Das zweite Projekt beinhaltete die Untersuchung der Sensor Kinase CpcC und deren Einfluss auf die Pathogenität von A. fumigatus. Die hierfür konstruierte Mutante zeigte unter Mangelbedingungen nur eine begrenzte Induktion von CpcA im Vergleich zum Wildtyp, was zu einem verminderten Wachstum unter Aminosäuremangelbedingungen führte. Trotz dieser geringeren Menge an CpcA zeigte der CpcC Deletionsstamm keine verringerte Virulenz im Mausmodel. Daraus wurde die Schlussfolgerung gezogen, daß die basale Expressionsrate von CpcA ausreichend für die Pathogenität von A. fumigatus ist. Dies wird durch die Tatsache unterstützt, dass während der frühen Infektionsphase keine Induktion der CpcA-Expression stattfindet, wie mit Hilfe eines gfp::cpcA Reporterstammes festgestellt werden konnte.Entsprechend dieser Ergebnisse war es das Ziel, das vom basalen Expressionslevel abhängige Proteome zu charakterisieren. Dieses wurde mittels DIGE-Experimenten untersucht, was zur Identifizierung von 22 Proteinen führte, von denen 14 in einer delta cpcA-Mutante eine verminderte Expression aufwiesen. Die weitere Klassifizierung in Funktionsgruppen zeigte, dass drei dieser 14 Proteine gegebenenfalls eine Rolle für die Pathogenität von A. fumigatus spielen. Des Weiteren wurde ein Kandidatenprotein gefunden, dessen Funktion in der Neutralisierung von oxidativen Substanzen liegt.Diese Arbeiten charakterisieren dementsprechend das Netzwerk der Cross-Pathway Control des Humanpathogens A. fumigatus als umfassendes regulatorisches System.de
dc.format.mimetypetext/htmlde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/2.0/de/de
dc.titleCross-Pathway Control of the Pathogenic Fungus <i>Aspergillus fumigatus</i>: a Manifold Stress Response Systemde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedCross-Pathway Control des pathogenen Pilzes <i>Aspergillus fumigatus</i>: Ein vielfältiges Stress-Antwort-Systemde
dc.contributor.refereeKrappmann, Sven PD Dr.de
dc.date.examination2008-04-29de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaften, Biologiede
dc.description.abstractengIn this study the Cross-Pathway Control (CPC) of the opportunistic pathogenic fungus Aspergillus fumigatus was analysed in view of putative stress response genes, which enables the fungus to adapt within the host. Previous works displayed that the transcriptional regulator CpcA of the CPC is required for full virulence of A. fumigatus. In the first part of this work an A. fumigatus wild-type and its delta cpcA derivative were compared under conditions of amino acid starvation via transcriptome profiling. 377 genes were detected that are induced under starvation, and 146 displayed a reduced transcriptional level in comparison to the delta cpcA deletion strain. Classification pointed out that most of the genes are involved in primary and secondary metabolism. In addition, expression of numerous genes encoding transporters and permeases was increased as well as that of some genes coding for transcriptional regulators. Further, twelve regulated genes involved in any kind of stress response like detoxification of oxidative molecules and drug resistance were found. Within these genes, two encoding so-called CpcA-dependent AAA-ATPases (cdaA and cdaB) could be identified. Deletion of these genes led to an increased sensitivity towards Calcofluor White, which is a cell wall stress-inducing drug. These results clarify the flexibility of the fungus to react on different kind of stress signals via activation of the transcriptional regulator CpcA.The second chapter describes the CPC sensor kinase CpcC and its influence on pathogenicity of A. fumigatus. A delta cpcC deletion mutant is unable to induce the expression of CpcA under amino acid starvation conditions. Moreover, the deletion strain displayed no decreased pathogenicity in a murine model of pulmonary aspergillosis. Therefore, it is suggested that the basal level of CpcA seems to be sufficient for full virulence. This finding is supported by the fact that during the early phase of infection no induction of CpcA expression occurs as validated by a GFP-CpcA reporter strain.Resulting from these data a deeper insight into the proteome depending on the basal expression level of CpcA was sought. Therefore, DIGE experiments were performed to compare the wild-type with the delta cpcA strain under non-starvation conditions, which resulted in identification of 22 different proteins. 14 of them displayed an increased level in the wild-type in comparison to the deletion strain. Functional classification pointed out that three of the up-regulated proteins might play a role in pathogenicity; in addition, one protein was identified that appears to be required for detoxification of reactive oxidative species.Accordingly, this study characterises the Cross-Pathway Control system of A. fumigatus as a wide-domain regulatory system of this human pathogen.de
dc.contributor.coRefereeBraus, Gerhard Prof. Dr.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.ger<i>A. fumigatus</i>de
dc.subject.gerCPCde
dc.subject.gerPathogenität;CpcAde
dc.subject.gerAAA-ATPasende
dc.subject.eng<i>A. fumigatus</i>de
dc.subject.engCPCde
dc.subject.engpathogenicity;CpcAde
dc.subject.engAAA-ATPasesde
dc.subject.bk42.13de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-1932-0de
dc.identifier.purlwebdoc-1932de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWF610de
dc.subject.gokfullWF200de
dc.identifier.ppn596075170de


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