Molecular evolution of primates - featuring mobile elements

Abstract

Mit mindestens 66 Gattungen und über 350 Spezies ist die Diversität der Ordnung der Primaten eine der größten innerhalb der Säugetiere. Obwohl die phylogenetischen Beziehungen von den Hauptlinien geklärt sind, finden sich innerhalb der Familien immer noch viele ungeklärte und umstrittene Fälle. In den letzten Jahren wurden vermehrt SINE-Integrationen als phylogenetischer Marker verwendet. Die primatenspezifischen SINE-Integrationen (Alu-Elemente) sind Retroposons, die sich erfolgreich im Genom vermehrt und integriert haben. Mehr als 10 % des menschlichen Genoms bestehen aus diesen Elementen. Die Integration eines Alu-Elementes in einen neuen Lokus ist unidirektional, und die präzise Exzision oder Homoplasien sind sehr unwahrscheinlich. Daher stellen Alu-Elemente äußerst aussagekräftige kladistische Marker dar, um phylogenetische Beziehungen zu rekonstruieren. Es konnten bereits einige evolutionäre Fragestellungen mit Hilfe der SINE-Integrationen innerhalb verschiedenster Vertebratengruppen geklärt werden. In dieser Arbeit wurden Fragestellungen innerhalb der Colobinen und Neuweltaffen bearbeitet. Es gibt nach wie vor kontroverse Diskussionen über die phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Colobinen, z.B. ob die asiatischen und afrikanischen Stellvertreter oder die "odd-nosed"-Gruppe monophyletische Gruppen darstellen. Die phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse wurden basierend auf Alu-Elementen, mitochondrialen, Y-chromosomalen und autosomalen Sequenzen erstellt. Alu-Elemente zeigen, dass die afrikanischen Vetreter eine paraphyletische Gruppe darstellen. Das evolutionäre Szenario bei den asiatischen Vertretern scheint komplexer zu sein. Darüber hinaus, vertieft die Arbeit unser Wissen im Bezug auf die phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse der Neuweltaffen. Die Ergebnisse dieser Arbeit zeigen, dass die drei Hauptfamilien Cebidae, Atelidae und Pitheciidae monophyletische Gruppen darstellen und dass Cebidae und Atelidae Schwesterfamilien sind.