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Analysis of Tribolium head patterning by forward and reverse genetics and transgenic techniques

dc.contributor.advisorBucher, Gregor Prof. Dr.de
dc.contributor.authorSchinko, Johannes Bennode
dc.date.accessioned2012-04-16T14:52:38Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:25Zde
dc.date.issued2009-09-09de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AD6E-5de
dc.description.abstractIn dieser Doktorarbeit wurden verschiedene Methoden angewandt um ein besseres Verständnis der Insektenkopfentwicklung zu erlangen. Als Modellorganismus wurde der Rotbraune Reismehlkäfer Tribolium castaneum ausgewählt. Dieser Organismus ist für die Analyse dieses Prozesses gut geeignet, da Larven von Tribolium im Gegensatz zu Drosophilalarven einen Insektentypischen Kopf mit allen Kopfanhängen aufweisen. Erstens habe ich eine Karte des Kopfhärchenmusters erstellt, das als Marker für Kopfdefekte dient. Zweitens habe ich die so genannten Kopf-Lücken-Gene orthodenticle, empty spiracles und buttonhead in Tribolium analysiert. Es ist bekannt, dass diese Gene eine wichtige Rolle in der Kopfentwicklung bei Drosophila spielen. Ich habe das Expressionsmuster und den Phänotyp, der durch den knock down mittels RNA Interferenz verursacht wurde analysiert und mit den Drosophila Daten verglichen. Dabei wurde herausgefunden, dass abhängig von der Injektionszeit der dsRNA zwei Funktionen von Tc-orthodenticle1 unterschieden werden können. Die frühe Regionalisierungsfunktion betrifft alle Segmente die während des Blastodermstadiums angelegt werden, wohingegen die spätere Musterbildungsfunktion zu Drosophila ähnlich ist. Dagegen ist sowohl die Expression als auch die Funktion von Tc-empty spiracles auf den posterioren Teil das okularen und anterioren Teil des antennalen Segments beschränkt und Tc-buttonhead wird für die Bildung der Kopfkutikula nicht benötigt. Daraus folgere ich, dass die Kopflückengen ähnlichen Rollen von ems und btd nicht konserviert sind wohingegen zumindest die Kopf-Musterbildungsfunktion von otd zwischen Fliege und Käfer ähnlich zu sein scheint. Drittens habe ich neue Gene identifiziert die bei der Kopfentwicklung beteiligt sind, da durch die Rückwärtsgenetik keine Gene gefunden werden können, von denen nicht bekannt ist, dass sie bei der Kopfentwicklung in anderen Organismen eine Rolle spielen. Ich habe 2612 Insertionslinien die in Göttingen hergestellt wurden auf enhancer traps gescreent und den Kutikula Phänotyp aller lethalen Linien analysiert. Die Insertionsstelle des Mutator Konstruktes wurde bestimmt und dem wahrscheinlich betroffenen Gen zugeordnet. Sieben interessante Linien der 328 (238 aus Göttingen und 90 aus Kansas) lethalen Linien wurden genauer analysiert. Dies identifizierte drei sehr interessante Linien die die Kopfentwicklung betreffen und in Zukunft genau analysiert werden. Um Genfunktionen genauer analysieren zu können wird nicht nur die Herunterregulation sondern auch Misexpression benötigt. Daher war das vierte Ziel meiner Arbeit das binäre Expressionssystem GAL4/UAS für Tribolium zu etablieren. GAL4 wird durch Hitzeschock aktiviert, indem der Tribolium hsp68 promotor verwendet wird. Nach dem Hitzeschock wird das Reportergen über das UAS Konstrukt sowohl während allen Stadien der Triboliumentwicklung als auch in verschiedenen Geweben exprimiert. Diese Arbeit zeigt auch, dass es essentiell ist Tribolium spezifische basale Promotoren in den GAL4 als auch UAS Konstrukten zu verwenden.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/2.0/de/de
dc.titleAnalysis of Tribolium head patterning by forward and reverse genetics and transgenic techniquesde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedAnalyse der Kopfmusterung in Tribolium castaneum durch Vorwärts- und Rückwärtsgenetik und transgene Technikende
dc.contributor.refereeBucher, Gregor Prof. Dr.de
dc.date.examination2009-09-04de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaften, Biologiede
dc.description.abstractengIn this thesis several different methods have been applied to get deeper insights into the complex process of head development in insects. As model organism the red flour beetle Tribolium castaneum was chosen. This is a well suited organism for analyzing this process, as in contrast to Drosophila Tribolium larvae exhibit an insect typical head with all head appendages. First, I established a map of head bristles that serve as landmarks for head defects. Second, I analyzed the so called head gap-like genes orthodenticle, empty spiracles and buttonhead in Tribolium. These genes are known to play a crucial role in Drosophila head patterning. I analyzed the expression pattern and the phenotype caused by knock down via RNA interference and compared this to Drosophila data. I find that depending on dsRNA injection time, two functions of Tc-orthodenticle1 can be distinguished. The early regionalization function affects all segments formed during the blastoderm stage while the later head patterning function is similar to Drosophila. In contrast, both expression and function of Tc-empty spiracles are restricted to the posterior part of the ocular and the anterior part of the antennal segment and Tc-buttonhead is not required for head cuticle formation at all. I conclude that the gap gene like roles of ems and btd are not conserved while at least the head patterning function of otd appears to be similar in fly and beetle. Third, I set out to identify novel genes involved in head development because by the reverse genetics approach genes that are not known to be involved in head patterning in other organisms will not be found. I screened the 2612 insertion lines generated in the Göttingen part of the insertional mutagenesis screen for enhancer traps and analyzed the cuticle phenotype of all lethal lines. The insertion site of the mutator was determined and assigned to the probably affected gene. Seven interesting lines of the 328 (238 from Göttingen and 90 from Kansas) lethal lines were analyzed in more detail. This led to three very interesting lines affecting head development that will be matter of future analysis. In order to analyze gene function in more detail, not only knock down but also misexpression is needed. Hence, the fourth aim of this thesis was to establish the binary expression system GAL4/UAS in Tribolium. GAL4 is activated via heat shock by using the Tribolium hsp68 promoter. Upon heat shock the reporter gene is expressed via the UAS construct in all stages of Tribolium development and different tissues as well. This work also revealed that it is essential to make use of Tribolium specific basal promoters in the GAL4 as well as in the UAS construct.de
dc.contributor.coRefereePieler, Tomas Prof. Dr.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.gerTribolium castaneumde
dc.subject.gerInsertionsmutagenesede
dc.subject.gerUASde
dc.subject.gerGAL4de
dc.subject.gerbinäres expressionssystemde
dc.subject.gerKopflückengenede
dc.subject.gerMisexpressionde
dc.subject.gerüberexpressionde
dc.subject.engTribolium castaneumde
dc.subject.engUASde
dc.subject.engGAL4de
dc.subject.engbinary expression systemde
dc.subject.engInsertional mutagenesisde
dc.subject.enghead gap genesde
dc.subject.engmisexpressionde
dc.subject.engoverexpressionde
dc.subject.bk42.23de
dc.subject.bk42.13de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2215-8de
dc.identifier.purlwebdoc-2215de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWKL 000: Evolution, Phylogenie {Entwicklungsbiologie}de
dc.subject.gokfullWF 650: Genomik / Tiere {Molekularbiologie, Gentechnologie}de
dc.identifier.ppn617780560de


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