Aktivität endogener Retroviren in Tumorgeweben von Primaten
Activity of endogenous retroviruses in tumour tissues of primates
by Nadine Keiner
Date of Examination:2009-06-29
Date of issue:2009-09-14
Advisor:Prof. Dr. Gerhard Hunsmann
Referee:Prof. Dr. Hans-Joachim Fritz
Referee:Prof. Dr. Wolfgang Liebl
Persistent Address:
http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AD71-C
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Format:PDF
Description:Dissertation
Abstract
English
The human endogenous retroviruses of the family K (HERV-K) is an evolutionary young group of retroviral sequences. In comparison with other endogenous retroviruses, some HERV-K proviruses are able to replicate and possess complete open reading frames for retroviral structural and enzymatic proteins. They are brought frequently in connection with the occurrence of various types of cancer and autoimmune diseases. Furthermore, specific members of HERV-K seem to promote the etiopathology of some infectious diseases. The focus of this work was the analysis of the HERV-K in melanoma. The incidence of melanoma rises continuously and turns out to be one of the most prevalent cancers in many countries around the world. In this context an increased expression of members of the HERV-K (HML-6) family has been described several times before. The thesis deals with the development of a system for the amplification of the HML-6 specific LTR regions by 5´-RACE PCR, which permitted an analysis of differential expressed transcripts in melanoma cells. The used melanoma cell lines SK-Mel-28 and A-375 showed specific expression patterns in comparison with the melanocytic cells NHEM-M2 and among each other. A further analysis of individual expressed transcripts could be a method for the identification of potentially new tumor markers. Moreover, the role of a specific HML-6 member, the so-called HERV-K- MEL, in melanoma was examined. HERV-K-MEL has been described earlier as a potential tumor marker, as the expression of this retrovirus increases in melanoma and naevi compared to normal skin tissues. These results were confirmed in this thesis for the used melanoma and melanocyte cell lines. Furthermore, the usage of RNA interference showed that a silencing of HERV-K-MEL led to smaller growth density and a decreased expression of the apoptosis associated genes Bcl2 and Caspase 8 in the melanoma cell line SK-Mel-28. Additionally, the HERV-K expression during an infectious disease was investigated. Since the development of melanoma is affected by many factors, the analysis during a virus infection was chosen. As a model the SIV infection of rhesus macaques (Macaca mulatta) was used. An increased expression of the HERV-K (HML-2) and (HML-3) groups has been described for HIV-1 on RNA and protein level. In this thesis it was shown that an SIV infection does not effect the HML-2 transcription in rhesus macaques. Comparative analyses of an SIV-infected human T-cell line due to microarray and qRT-PCR could not show a correlation between the HML-2 expression and the SIV infection. However, first results indicate an increased HML-3 expression in vitro. The results of this work support the theory of a role of various groups of HERV-K members in the development and/or progression of some diseases using the example of melanoma and SIV infection. A further analysis of these findings could lead to a method for diagnosis and prediction of the etiopathology of these diseases.
Keywords: HERV-K; HERV-K-MEL; HML-6; HML-2; HML-3; melanoma; SIV; RNAi; Bcl-2; Caspase 8; SK-Mel-28; A-375; NHEM-M2
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Die humanen endogenen Retroviren der Familie K (HERV-K) sind eine evolutionär junge Gruppe von retroviralen Sequenzen. Im Gegensatz zu anderen endogenen Retroviren sind einige der HERV-K Proviren replikationskompetent und besitzen komplette offene Leserahmen für retrovirale strukturelle und enzymatische Proteine. Sie werden häufig in Verbindung mit dem Auftreten verschiedener Tumor- und Autoimmunerkrankungen gebracht. Zudem scheinen einzelne HERV-K Mitglieder den Krankheitsverlauf diverser Infektionskrankheiten zu begünstigen. Der Schwerpunkt dieser Arbeit lag auf der Untersuchung von HERV-K in Melanomen. Da die Inzidenz von Melanomen kontinuierlich steigt, entwickeln sie sich zu einer der häufigsten Krebserkrankungen weltweit. In diesem Zusammenhang konnte eine erhöhte Expression einzelner Mitglieder der HERV-K (HML-6) mehrfach beobachtet werden. Diese Arbeit befasst sich mit der Entwicklung eines Systems zur Amplifikation HML-6 spezifischer LTR-Regionen mittels 5´-RACE PCR, die eine Analyse differenziell exprimierter Transkripte in Melanomzellen erlaubt. Die verwendeten Melanomzelllinien SK-Mel-28 und A-375 zeigten dabei spezifische Expressionsprofile sowohl im Vergleich mit der Melanozytenzelllinie NHEM-M2 als auch untereinander. Eine weitere Untersuchung individuell exprimierter Transkripte könnte eine Methode zur Identifikation potenzieller neuer Tumormarker darstellen. Darüber hinaus wurde die Rolle eines speziellen HML-6 Mitglieds, des so genannten HERV-K-MEL, in Melanomen genauer betrachtet. Bereits zuvor wurde HERV-K-MEL als potenzieller Tumormarker beschrieben, da eine erhöhte Expression dieses Retrovirus in Melanomzellen und Muttermalen im Vergleich zu normalen Hautproben festzustellen war. Diese Ergebnisse konnten im Rahmen der vorliegenden Arbeit für die verwendeten Zelllinien bestätigt werden. Mittels RNA-Interferenz konnte gezeigt werden, dass ein Silencing von HERV-K-MEL zu einer geringeren Zellwachstumsdichte und einer verminderten Expression der apoptose-assoziierten Gene Bcl2 und Caspase 8 in der Melanomzelllinie SK-Mel-28 führt. Zudem wurde die HERV-K Expression während einer infektiösen Erkrankung untersucht. Da die Entstehung von Melanomen von vielen Faktoren beeinflusst wird, wurde die Analyse im Verlauf einer Virusinfektion präferiert. Als Modell wurde die SIV-Infektion bei Rhesus-Makaken (Macaca mulatta) gewählt. Eine erhöhte Expression der HERV-K (HML-2) und (HML-3) Gruppen auf RNA- und Proteinebene wurde bereits im Zusammenhang mit HIV-1 Infektionen beschrieben. In dieser Arbeit konnte gezeigt werden, dass eine SIV-Infektion keinen Einfluss auf die HML-2 Transkription in Rhesus-Makaken hatte. Vergleichende Analysen einer SIV-infizierten humanen T-Zelllinie mittels Microarray und qRT-PCR konnten zudem eine Korrelation zwischen der HML-2 Expression und der SIV-Infektion nicht bestätigen. Dennoch weisen erste Ergebnisse auf eine erhöhte HML-3 Expression in vitro hin. Die Ergebnisse dieser Arbeit stützen die These einer Beteiligung verschiedener HERV-K Mitglieder an der Entstehung und/oder dem Fortschreiten diverser Erkrankungen am Beispiel von Melanomen und SIV-Infektionen. Eine weitere Analyse dieser Beobachtungen könnte zu neuen Diagnosemöglichkeiten und zu einer Vorhersage des Krankheitsverlaufes dieser Erkrankungen führen.
Schlagwörter: HERV-K; HERV-K-MEL; HML-6; HML-2; HML-3; Melanom; SIV; RNAi; Bcl-2; Caspase 8; SK-Mel-28; A-375; NHEM-M2