Nutzung molekularer Hochdurchsatz-Verfahren zur schnellen und eingehenden Artenbestimmung von Pilzgesellschaften

Reich, Marlis

dc.contributor.advisor	Polle, Andrea Prof. Dr.	de
dc.contributor.author	Reich, Marlis	de
dc.date.accessioned	2012-04-16T14:52:41Z	de
dc.date.available	2013-01-30T23:51:02Z	de
dc.date.issued	2009-09-15	de
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AD73-8	de
dc.description.abstract	Zahlreiche Umweltfaktoren beeinflussen den Artenreichtum und die zusammensetzung von Pilzgesellschaften in Waldökosystemen. Einer der wichtigsten Faktoren ist die Pflanze, da ein hoher Prozentsatz der pflanzlich produzierten Kohlenstoffe im Boden wiedergefunden wird. Pilzgesellschaften konnten lange Zeit nur unzureichend dokumentiert werden, da Nachweismethoden nur wenige Arten auf einmal bestimmen konnten. Um eine schnellere und eingehende Pilzbestimmung zu ermöglichen, haben wir zwei Generationen von ribosomalen DNA Phylochips entwickelt und getestet. Der zuletzt entwickelte Phylochip kann ca. 10 000 Pilzarten aus allen grösseren taxonomischen Pilzgruppen detektieren. Wir haben mit Hilfe der entwickelten Phylochips die Mykorrhizagesellschaft zweier unterschiedlicher Baumarten beschrieben. Weiterhin haben wir den Einfluss sechs unterschiedlicher Waldbäume auf die Zusammensetzung ihrer Bodenpilzgesellschaften untersucht, indem wir über 180 000 Sequenzen (454 Pyrosequenzierung) analysiert haben. Die meisten der Ektomykorrhizapilze bevorzugen jeweils einen der pflanzlichen Symbiosepartner. Die Pilzgesellschaften unter den sechs ausgewählten Baumarten weisen auf Artenniveau einige spezifische Baum-Pilz Beziehungen auf. Die geringen Unterschiede auf Familenniveau sind auf die grosse Anzahl ubiquistischer Pilzarten zurückzuführen.	de
dc.format.mimetype	application/pdf	de
dc.language.iso	eng	de
dc.rights.uri	http://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.html	de
dc.title	Nutzung molekularer Hochdurchsatz-Verfahren zur schnellen und eingehenden Artenbestimmung von Pilzgesellschaften	de
dc.type	doctoralThesis	de
dc.title.translated	Using high-throughput genotyping for monitoring communities of soil fungi	de
dc.contributor.referee	Lohaus, Gertru PD Dr.	de
dc.date.examination	2009-05-28	de
dc.subject.dnb	570 Biowissenschaften, Biologie	de
dc.description.abstracteng	In forest ecosystems, fungal communities are highly diverse since several environmental factors influence their richness and structure. Host plant composition is one of the major factors, as the main input of carbohydrates into soil is plant-derived. Ecological research of fungal communities was hindered by the lack of high-throughput diagnostic tools. To ease the large-scale identification of fungi, we have constructed and validated two generations of ribosomal DNA phylochips. The last generation of developed phylochips carried species-specific probes for about 10,000 fungal species spread over the whole fungal kingdom. We applied the developed phylochips to describe the impact of host trees on ectomycorrhizal communities over the time scale of one year. Furthermore, we monitored the diversity of fungal communities under six different host trees by generating over 180,000 sequences using 454 pyrosequencing approach. Results of both techniques revealed a high influence of the different tree species on soil fungal community composition, richnesse and abundance. Furthermore, host preference was observed for most of the ectomycorrhizal and saprotrophic fungi. However, host preference appeared mainly on species level, but not on family level showing also the ubiquistic character of some of the microorganisms.	de
dc.contributor.coReferee	Marmeisse, Roland Dr.	de
dc.contributor.thirdReferee	Xavier, Nesme Dr.	de
dc.subject.topic	Mathematics and Computer Science	de
dc.subject.ger	Pilze	de
dc.subject.ger	Phylochip	de
dc.subject.ger	Arraytechnik	de
dc.subject.ger	454 Pyrosequenzierung	de
dc.subject.ger	Artenvielfalt Pilzgesellschaften	de
dc.subject.ger	Bevorzugung eines pflanzlichen Symbiospartners	de
dc.subject.ger	Waldbaumarten	de
dc.subject.eng	fungi	de
dc.subject.eng	phylochip	de
dc.subject.eng	array technique	de
dc.subject.eng	454 pyrosequencing	de
dc.subject.eng	mycorrhizal community structure	de
dc.subject.eng	host preference	de
dc.subject.eng	tree species	de
dc.subject.bk	42	de
dc.identifier.urn	urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2223-3	de
dc.identifier.purl	webdoc-2223	de
dc.affiliation.institute	Biologische Fakultät inkl. Psychologie	de
dc.subject.gokfull	W	de
dc.identifier.ppn	620971010	de

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Fakultät für Biologie und Psychologie (inkl. GAUSS) [1621]

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