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Analysis of ether-à-go-go potassium channel (Eag1) splice variants in melanoma cells

dc.contributor.advisorStülke, Jörg Prof. Dr.de
dc.contributor.authorGomes, Fernanda Ramosde
dc.date.accessioned2012-04-16T14:53:21Zde
dc.date.available2013-01-30T23:51:02Zde
dc.date.issued2011-05-03de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-ADAF-4de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-369
dc.description.abstractDer menschliche Ether-à-go-go Kaliumkanal (hEag1) nachgewiesen werden in adulten Gehirn und in beiden Tumorzelllinien und primären Tumoren. Das physiologische Funktion dieses Kanals im Gehirn bleibt zu aufgeklärt. Die Anwesenheit von hEag1 in Tumoren hat zu einem Anstieg in Verbindung gebracht worden in Proliferation. Veröffentlichte Berichte behaupteten, dass die IGR39 Melanomzellen Linie ist für hEag1 negativ, was erlaubt diese Zelle als negativ verwendet werden zu steuern. Wir beobachteten, dass IGR39 Zellen positiv Verstärkung für Shows hEag1, auf mRNA-Ebene, und ein Protein mit kompatiblen Molekulargewicht und Reaktivität für hEag1 Antikörper wurde in Western-Blot Experimente. Die biophysikalischen Eigenschaften der aktuellen in IGR39 registriert präsentiert eine andere Kinetik, aber es ist noch empfindlich durch Medikamente blockiert und siRNA spezifisch für hEag1. Mit molekularbiologischen Techniken, wir fanden die Expression von zwei neuen Splice-Varianten, E65 und E70, in zwei Melanom-Zelllinien (IPC298 und IGR39) und in neuralen Stammzellen. Die beiden Spleißvarianten haben keine Transmembrandomänen und bilden keine funktionale membrangebundene Kanal. Eine Charakterisierung des neuen Splice Varianten wurde in Xenopus Oozyten leavis getan, um die Wechselwirkung von verifizieren die Spleißvarianten mit full-length hEag1 (fl-hEag1). Elektrophysiologische Messungen der Oozyten, die zusammen mit der injizierten Spleißvariante E65 und die fl-hEag1 zeigte einen gleichgerichteten Strom mit verminderte Amplitude. Auch die Co-Injektion von E65 und FL-hEag1 ermöglicht diese Eizellen zu reifen, die das gleiche Ergebnis wurde der Behandlung von Oozyten mit Progesteron. Basierend auf diesen Ergebnissen haben wir Schluss, dass IGR39 Zelllinie ausdrücken Eag1 Kanäle und die Spleiß Varianten finden in diesen Melanomzellen konnte sowohl die Interaktion mit dem sein in voller Länge Eag1 oder spielen eine Rolle bei der intrazellulären Signalwege.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/de
dc.titleAnalysis of ether-à-go-go potassium channel (Eag1) splice variants in melanoma cellsde
dc.typedoctoralThesisde
dc.contributor.refereeGöpfert, Martin Prof. Dr.de
dc.date.examination2010-04-29de
dc.subject.dnb500 Naturwissenschaftende
dc.description.abstractengThe human ether-à-go-go potassium channel (hEag1) can be detected in adult brain and in both, tumor cell lines and primary tumors. The physiological function of this channel in the brain still remains to be elucidated. The presence of hEag1 in tumors has been linked to an increase in proliferation. Published reports claimed that the IGR39 melanoma cell line is negative for hEag1, what allowed this cell to be used as negative control. We observed that IGR39 cells shows positive amplification for hEag1, at mRNA level, and a protein with compatible molecular weight and reactivity for hEag1 antibody, was detected in western-blot experiments. The biophysical properties of the current registered in IGR39 presents a different kinetics, but it is still sensitive to blocking by drugs and siRNA specific for hEag1. Using molecular biology techniques, we found the expression of two new splice variants, E65 and E70, in two melanoma cell lines (IPC298 and IGR39) and in neural stem cells. The two splice variants have no transmembrane domains and can not form a functional membrane-bound channel. A characterization of the new splice variants was done in Xenopus leavis oocytes, to verify the interaction of the splice variants with the full-length hEag1 (fl-hEag1). Electrophysiological measurements of the oocytes, co-injected with the splice variant E65 and the fl-hEag1, showed a rectified current with diminished amplitude. Moreover, the co-injection of E65 and fl-hEag1 enables these oocytes to mature, which was the same outcome of the treatment of oocytes with progesterone. Based in these results, we conclude that IGR39 cell line express Eag1 channels and the splice variants found in these melanoma cells, could be either interacting with the full-length Eag1 or playing a role in the intracellular signaling.de
dc.contributor.coRefereeWodarz, Andreas Prof. Dr.de
dc.contributor.thirdRefereeSchu, Peter Prof. Dr.de
dc.subject.topicBiology (incl. Psychology)de
dc.subject.gerKaliumkanäle - Krebs - Spleißvariantende
dc.subject.engpotassium channels - cancer - splice variantsde
dc.subject.bk42.13de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2524-5de
dc.identifier.purlwebdoc-2524de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWA 000: Biologiede
dc.identifier.ppn661867153de


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