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Evolution of caudal translational repression in higher insects

dc.contributor.advisorAverof, Michalis Dr.de
dc.contributor.authorRödel, Claudia Jasminde
dc.date.accessioned2012-04-16T14:54:31Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:45Zde
dc.date.issued2011-03-03de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-ADEF-5de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-433
dc.description.abstractDer anterior lokalisierte Entwicklungsfaktor bicoid (bcd) steuert the translationale Repression von caudal (cad) in Drosophila Embryos. Das bcd Gen kommt im Gegensatz zu cad nur in einer abgeleiteten Gruppe von Diptera vor. Die Expression von cad in anderen Insektenarten muss daher auf andere Weise reguliert sein. Interessanterweise kann BCD die Translation des Tribolium castaneum cad Homologs (Tc cad) reprimieren, wenn es in transgenen Drosophila Embryos exprimiert ist. Der Bereich an dem BCD in der Tc cad mRNA bindet, liegt wahrscheinlich in der 3 UTR des Transkripts und es stellt sich die Frage, ob BCD an ein konserviertes Element in den unterschiedlichen mRNAs bindet. Mit Hilfe eines in vivo Sensor-Assays wurden kurze Regionen in den 3 untranslatierten Regionen (3 UTR) von Drosophila und der Bremse Haematopota pluvialis identifiziert, die in Anwesenheit von BCD die translationale Repression von Sensortranskripten herbeiführen. Diese RNA Regionen weisen Ähnlichkeiten in ihren Sekundärstrukturen auf und könnten die Grundlage für ein konserviertes BCD-Bindungselement darstellen. Die direkte Bindung der BCD-Homeodomäne an diese RNA-Regionen wurde mit Hilfe eines elektrophoretischen Mobilitäts-Assays nachgewiesen. Die BCD-Bindungsregion der Drosophila 3 UTR überlappt mit einer putativen Bindungsstelle der microRNA miR-308. Mutationen in dieser Region verhindern einerseits die miR-308-Bindung und andererseits die BCD-abhängige translationale Repression des Sensors. Des Weiteren können auch verschiedene Isoformen des BCD Proteins die Translation von Sensortranskripten verhindern. Zusammenfassend weisen diese Ergebnisse auf das Vorhandensein von alternativen Mechanismen der cadDrosophila hin und könnten auch in anderen Insektenarten vorhanden sein.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/de
dc.titleEvolution of caudal translational repression in higher insectsde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedEvolution der translationalen Repression von caudal in höheren Insektende
dc.contributor.refereeWimmer, Ernst A. Prof. Dr.de
dc.date.examination2011-01-10de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaften, Biologiede
dc.description.abstractengThe anterior patterning factor bicoid (bcd) mediates translational repression of caudal (cad) in Drosophila embryos and is an evolutionary novelty present only in higher dipterans. Therefore other insect species must follow different strategies to restrict cad expression. Interestingly, BCD translationally represses the mRNA of the cad homologue of Tribolium castaneum (Tc cad) when expressed in Drosophila embryos. The region to which BCD binds has been speculated to be in the Tc cad 3 UTR and raised the question whether BCD may recognize regulatory element(s) that are conserved between Drosophila, Tribolium and other insect species. By establishing an in vivo sensor for BCD-mediated translational repression I was able to identify small regions in the cad 3 UTR of Drosophila and the horsefly Haematopota pluvialis that mediate BCD-dependent translational repression. These elements show similarities in their predicted secondary structures, which could be the basis for a conserved BCD-binding element. Using electrophoretic mobility shift assays I could show direct binding of the BCD homeodomain to these 3 UTR regions. The BCD-binding region of the Dm cad 3 UTR co-localizes with a target site of the microRNA miR-308 and mutations in this region abolish miRNA-binding and BCD-mediated translational repression. Furthermore, different BCD isoforms are able to mediate translational repression of sensors carrying BCD-binding regions. Taken together, these findings suggest that alternative mechanism(s) for the translational repression of cad mRNA are likely to exist in Drosophila and may also be present in other insect species.de
dc.contributor.coRefereeBucher, Gregor Prof. Dr.de
dc.contributor.thirdRefereeWodarz, Andreas Prof. Dr.de
dc.subject.topicBiology (incl. Psychology)de
dc.subject.gerbicoidde
dc.subject.gercaudalde
dc.subject.gerTranslationale Repressionde
dc.subject.germicroRNAde
dc.subject.gerDrosophila melanogasterde
dc.subject.gerTribolium castaneumde
dc.subject.gerHaematopota pluvialisde
dc.subject.germRNAde
dc.subject.gerEvolutionde
dc.subject.engbicoidde
dc.subject.engcaudalde
dc.subject.engtranslational repressionde
dc.subject.engmicroRNAde
dc.subject.engDrosophila melanogasterde
dc.subject.engTribolium castaneumde
dc.subject.engHaematopota pluvialisde
dc.subject.engmRNAde
dc.subject.engEvolutionde
dc.subject.bk42.21de
dc.subject.bk42.23de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2860-0de
dc.identifier.purlwebdoc-2860de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWK 000: Entwicklungsbiologiede
dc.subject.gokfullWKL 000: Evolution, Phylogenie {Entwicklungsbiologie}de
dc.identifier.ppn687492068de


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