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The role of Pcl5p and Pcl7p in the Gcn4p stability regulation of Saccharomyces cerevisiae

dc.contributor.advisorBraus, Gerhard Prof. Dr.de
dc.contributor.authorSchulze, Floriande
dc.date.accessioned2012-04-16T14:54:45Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:27Zde
dc.date.issued2011-05-09de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AE05-9de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-455
dc.description.abstractIn der Bäckerhefe Saccharomyces cerevisiae ist der Transkriptionsaktivator Gcn4p das zentrale Element der Allgemeinen Kontrolle der Aminosäurebiosynthese , der die Induktion von mehr als 500 Genen als Reaktion auf Aminosäuremangel bewirkt. Die Gcn4p-Menge in der Zelle wird überwiegend durch einen translationellen Mechanismus sowie durch Regulation der Stabilität kontrolliert. Die hohe Instabilität von Gcn4p in gesättigten Zellen beruht auf der schnellen Degradation über den Ubiquitin-Proteasom-Weg, die von der Phosphorylierung durch die Zyklin-abhängige Kinase Pho85p in Assoziation mit dem Zyklin Pcl5p initiiert wird. Pcl5p ist ein kernlokalisiertes Protein dessen Transport in den Kern von seinem C-terminus abhängig ist und vermutlich durch das β-Importin Kap95p vermittelt wird. Für die von der Aminosäureversorgung abhängige Stabilisierung von Gcn4p sind der Zyklin-abhängige Kinase Inhibitor Pho81p, sowie ein weiteres Zyklin, Pcl7p, notwendig. Es wird angenommen, dass die Stabilisierung von Gcn4p durch die Dissoziation des Pho85p/Pcl5p-Komplexes eingeleitet wird. In dieser Arbeit konnte gezeigt werden, dass der C-Terminus von Pcl5p ein nicht klassisches NLS darstellt, das ein Motiv benötigt, in dem ein Prolin und ein Aspartat basische Aminosäuren flankieren. Der Transport von Pcl5p in den Kern erfolgt außerdem durch direkte Interaktion mit dem β-Importin Kap95p. In dieser Arbeit wurden verkürzte Pcl5p-Varianten und Pcl5p/Pho80p-Hybride verwendet, um Bereiche von Pcl5p zu identifizieren, die für die Assoziation/Dissoziation der Pho85p/Pcl5p-Komplexe, sowie Pho81p/Pcl5p-Komplexe in gesättigten bzw. in hungernden Zellen benötigt werden. Die hier durchgeführten Untersuchungen bestätigen, dass der mittlere Bereich für die Substratspezifität verantwortlich ist und zeigen, dass dieser Bereich vermutlich auch die Assoziation mit Pho85p und Pho81p vermittelt. Zusätzlich konnte gezeigt werden, dass Pcl5p unabhängig von der Verfügbarkeit von Aminosäuren mit Pho85p und Pho81p interagiert. Darüber hinaus konnte durch Überexpressionsstudien gezeigt werden, dass die Stabilisierung von Gcn4p hauptsächlich durch die geringe Menge von Pcl5p in hungernden Zellen vermittelt wird. Das stabile Zyklin Pcl7p hat hierbei nur eine indirekte Funktion. Die konkurrierende Bindung zu Pho85p wirkt der verbleibenden Pho85p/Pcl5p-Komplexbildung in hungernden Zellen entgegen.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/de
dc.titleThe role of Pcl5p and Pcl7p in the Gcn4p stability regulation of Saccharomyces cerevisiaede
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedDie Rolle von Pcl5p und Pcl7p bei der Stabilitätsregulation von Gcn4p in Saccharomyces cerevisiaede
dc.contributor.refereeBraus, Gerhard Prof. Dr.de
dc.date.examination2010-10-27de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaften, Biologiede
dc.description.abstractengIn the baker s yeast Saccharomyces cerevisiae, the transcriptional activator Gcn4p is the central element of the general amino acid control network that induces more than 500 genes in response to amino acid limitation. The amount of Gcn4p in the cell is mainly regulated by a translational mechanism and via control of its stability. The high instability of Gcn4p in sated cells is due to its rapid degradation via the ubiquitin-proteasome pathway which is initiated by phosphorylation through the cyclin-dependent kinase Pho85p in association with the cyclin Pcl5p. Pcl5p is a nuclear localized protein and its nuclear translocation depends on its C terminus and was suggested to be mediated by the β importin Kap95p. The amino acid-dependent stabilization of Gcn4p in starved cells requires the cyclin-dependent kinase inhibitor Pho81p and another cyclin, Pcl7p. It was suggested that the initial step of the Gcn4p stabilization is the dissociation of the Pho 85p/Pcl5p complex. In the course of this study it was shown that the C-terminus of Pcl5p comprises a non-classical NLS that requires a motif of basic amino acids flanked by a proline and an aspartic acid residue. The translocation of Pcl5p into the nucleus depends on a direct interaction with the β importin Kap95p. Truncated versions of Pcl5p and Pcl5p/Pho80p hybrids were used for interaction studies to identify regions of Pcl5p responsible for the assembly/disassembly of Pho85/Pcl5p and Pho81p/Pcl5p complexes in sated and starved cells, respectively. The investigations undertaken here confirmed that the middle part of Pcl5p is responsible for the substrate specificity towards Gcn4p and suggest that this region also mediates the interaction with Pho85p and the cyclin-dependent kinase inhibitor Pho81p. In addition, it was shown that Pcl5p interacts with Pho85p and Pho81p independent of the amino acid availability. Furthermore, overexpression of PHO85, PCL5, and PCL7 indicate that the Gcn4p stabilization mainly depends on the acutely low amount of Pcl5p in starved cells. The stable cyclin Pcl7p has an indirect function in the Gcn4p stabilization by its competitive binding to Pho85p that counteracts the residual Pho85p/Pcl5p complex formation in starved cells.de
dc.contributor.coRefereeIrniger, Stefan PD Dr.de
dc.subject.topicBiology (incl. Psychology)de
dc.subject.gerGcn4pde
dc.subject.gerTranskriptionsfaktorde
dc.subject.gerDegradationde
dc.subject.gerPcl5pde
dc.subject.gerZyklinede
dc.subject.gerLokalisierungde
dc.subject.gerKerntransportde
dc.subject.engGcn4pde
dc.subject.engtranscription factorde
dc.subject.engdegradationde
dc.subject.engPcl5pde
dc.subject.engcyclinsde
dc.subject.englocalizationde
dc.subject.engnuclear transportde
dc.subject.bk42.13 Molekularbiologiede
dc.subject.bk42.30 Mikrobiologiede
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2952-7de
dc.identifier.purlwebdoc-2952de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWF 000: Molekularbiologie, Gentechnologiede
dc.subject.gokfullWH 000: Cytologie {Biologie}de
dc.subject.gokfullWHC 300: Zellkern {Cytologie}de
dc.identifier.ppn661879356de


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