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Regulation of nitrogen fixation in Klebsiella pneumoniae: The role of Fnr in oxygen signal-transduction

dc.contributor.advisorSchmitz, Ruth A. Dr.de
dc.contributor.authorGrabbe, Romande
dc.date.accessioned2012-04-16T14:55:58Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:39Zde
dc.date.issued2003-04-30de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AE66-Dde
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-560
dc.description.abstractIn Klebsiella pneumoniae wird die Aktivität des Transkriptionsaktivators NifA durch NifL in Abhängigkeit von gebundenem Stickstoff und molekularem Sauerstoff geregelt. NifL, ein Flavoprotein, das redox-sensitiv ist, scheint, das Sauerstoffsignal über eine Konformationsänderung auf NifA zu übertragen. Kürzlich konnten wir zeigen, dass in einer K. pneumoniae fnr null Mutante NifL das Signal für Sauerstofflimitierung nicht erhält, was zu einer inhibitorischen Konformation des Proteins führt. Dies bedeutet, dass Fnr, indirekt oder direkt, in diese Signalübertragung involviert ist. Wir nehmen an, dass Fnr als primärer Sauerstoffsensor Gene der anaeroben Atmungskette kontrolliert, die wiederum Elektronen für die Reduktion des FAD-Cofaktors in NifL zur Verfügung stellen. Interessanterweise findet sich in einer unter Sauerstoff- und Stickstofflimitierung gewachsenen fnr Mutante bis zu 95% des NifL Proteins im Cytoplasma, während im Wildtyp 55% des Regulators in der Membranfraktion nachgewiesen werden können. In der Mutante wird der räumliche Abstand zwischen NifL und NifA, der letztlich NifA die Enhancer Funktion in der nif Gene Transkription ermöglicht, verhindert.Unter Sauerstofflimitation ist NifL also hauptsächlich an der Membran lokalisiert, wobei sein FAD-Cofaktor reduziert wird und NifL so in seiner nicht-inhibitorischen Konformation verweilt. Um diese Reduktion nachzuweisen, untersuchten wir die Übertragung von Elektronen von reduzierten invertierten Membranvesikeln bzw. Quinolen auf den FAD-Cofaktor von NifL. Wir konnten eindeutig zeigen, dass sowohl Vesikel als auch Quinole in der Lage sind, Elektronen von NADH auf NifL zu übertragen. Dies unterstützt die Theorie der Reduktion von NifL mit Elektronen aus Quinol-Poolen, die durch die anaerobe Atmungskette generiert werden, an der Cytoplasmamembran. Unterstützt wird diese These durch NifA-abhängige Expressionsstudien mit K. pneumoniae Stämmen, die Null-Mutationen in Oxidoreduktasen, z.B. NADH-Oxidoreduktase, der anaeroben Atmung aufweisen. In diesen Stämmen sind die Expressionslevel nahezu identisch mit denen des Wildtyp Stammes unter aeroben Bedingungen.Wir schlagen deshalb ein Model vor, in dem NifL an der cytoplasmatischen Membran durch Elektronen aus dem Quinol-Pool reduziert wird. Gespeist wird dieser Pool mit Elektronen der anaeroben Atmungskette.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyrdiss.htmde
dc.titleRegulation of nitrogen fixation in <i>Klebsiella pneumoniae</i>: The role of Fnr in oxygen signal-transductionde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedRegulation der Stickstoffixierung in <i>Klebsiella pneumoniae</i>: die Rolle von Fnr in der Sauerstoffsignaltransduktionde
dc.contributor.refereeGottschalk, Gerhard Prof. Dr.de
dc.date.examination2002-06-20de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaften, Biologiede
dc.description.abstractengIn Klebsiella pneumoniae transcriptional activity of NifA is modulated by NifL in response to combined nitrogen or molecular oxygen. NifL a flavoprotein, which is redox-sensitive, apparently mediates the oxygen signal towards NifA through a conformational switch. We recently showed that in a fnr null mutational K. pneumoniae strain NifL does not receive the signal for anaerobiosis, resulting in an inhibitory conformation of NifL. Indicating, Fnr seems to be involved in the signal transduction pathway, directly or indirectly. We proposed that fnr-dependent genes, the products of which function to relieve NifL inhibition by reducing the FAD moiety of NifL, resulting in a non-inhibitory conformation. We further hypothized that members of the anaerobic electron transport chain could be involved in this signal transduction. Interestingly, in a anerobic and nitrogen limited K. pneumoniae fnr-null mutant 95% of NifL protein is located in the cytoplasm, contrarely to the conditions in the wild type, where 55% of NifL is found in the membrane fraction. In the mutant strain, the spatial gap between NifL and NifA, which allows NifA to enhance transcription of the nif-genes, is abolished.In K. pneumoniae wild type strains under oxygen limitation NifL is mainly located at the cytoplasmic membrane and recieves electrons leading to a reduced FAD cofactor, which allows NifL to retain the non-inhibitory conformation. Consequently, we started experiments to reduce oxidized NifL using reduced inside out vesicles and quinone derivatives in the presence of NADH. We clearly demonstrated that both membrane vesicles and quinone derivatives are highly potential in electron transduction from NADH towards NifL. Indicating that electrons from the anaerobic respiratory chain, which are mainly found in the quinone pools in the cytoplasmic membrane are used to reduce the FAD moiety of NifL resulting in a non-inhibitory conformation of the protein. These findings were confirmed by K. pneumoniae strains carrying null mutations of anaerobic reductases, for example NADH-oxidoreductase. These mutant strains failed to relieved NifL inhibition or showed reduced nifH-lacZ transcription levels in the appropriate genetic backgrounds.We favor a model in which NifL is membrane associated under anaerobic and nitrogen limited conditions and recieves electrons from the anaerobic respiratory chain, especially from the reduced quinone pools, resulting in a non-inhibitory conformation.de
dc.contributor.coRefereeSchmitz, Ruth A. Dr.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.gerKlebsiella pneumoniaede
dc.subject.gernitrogen fixationde
dc.subject.gerFnrde
dc.subject.gerNifLde
dc.subject.gerNifAde
dc.subject.engKlebsiella pneumoniaede
dc.subject.engStickstoffixierungde
dc.subject.engFnrde
dc.subject.engNifLde
dc.subject.engNifAde
dc.subject.bk42.3de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-435-1de
dc.identifier.purlwebdoc-435de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWUE200de
dc.identifier.ppn367133369de


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