Methanophenazin: Strukturaufklärung und Totalsynthese eines neuartigen Cofaktors aus methanogenen Archaea
Methanophenazine: Structure and Total Synthesis of a New Co-factor from Methanogenic Archaea
von Mario Tietze
Datum der mündl. Prüfung:2000-11-02
Erschienen:2002-10-30
Betreuer:PD Dr. Uwe Beifuss
Gutachter:Prof. Dr. Dr. h.c. Lutz Tietze
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Size:1.19Mb
Format:PDF
Description:Dissertation
Zusammenfassung
Englisch
Methanogenesis is the terminal step in the degradation of complex organic compounds and essential for the mineralization of organic material. The formation of methane from simple compounds such as H2 and CO2 , formic acid, methanol, methyamines or acetic acid is the characteristic feature of the strictly anaerobic methanogenic archaea. The metabolic pathways leading to the generation of methane are unique and involve a number of enzymes and co-factors that occur in methanogens only. This thesis reports on the purification, structure elucidation and total synthesis of Methanophenazine (1) the first phenazine derivative from methanogenic archea. Methanophenazine (1) was isolated from the cytoplasmic membranes of Methanosarcina mazei Gö1. HPLC-purification of the crude isooctane extracts of membranes provided small amounts of pure material. The elucidation of the structure is mainly based on NMR spectroscopic experiments (1H, 13C, H,H- and C,H-COSY) and mass spectrometry (EI, HRMS). The new natural compound 1 represents a linear sesterterpene ether of 2-hydroxy-phenazine (2). The lipophilic side chain consists of five isoprene units arranged in a head to tail manner. The C5 -unit directly connected to the aromatic system is fully saturated while the other isoprene units are unsaturated. They show (E)-configurated double bonds. The retrosynthetic analysis of 1 results in the building blocks 2-hydroxy-phenazine (2) and the terpenoid unit 3 which was divided into alkyl iodide 6 and (E)-vinyl iodide 7. Compound 2 was made accessible by condensation of 1,2,4-trihydroxybenzene (45) with o-phenylendiamine (5). In order to develop a stereodivergent approach to (R)-6 and (S)-6 , ethyl (R)-3-methylglutarate [(R)-11] was found to be suitable for the synthesis of both enantiomerically pure buildung blocks. First lactone (R)-12 was prepared by chemoselective reduction of the carboxyl group of (R)-11 which was then transformed to (R)-6 in enantiomerically pure form. The preparation of (S)-1 started with the transformation of (E,E )-farnesyl acetone (10) into the terminal alkyne 9. Carboalumination of 9 followed by a stereospecific quench of the resulting aluminium species with I2 afforded the (E)-vinyl iodide 7. A Pd(0) catalyzed sp2-sp3 cross coupling reaction of 7 with (R)-6 delivered alkohol (S)-78 after deprotection in enantio- and diastereomerically pure form. Etherification of 2-hydroxy-phenazine (2) with (S)-78 yielded the target molecule (S )-methanophenazine [(S)-1]. The spectral data for the synthetic methanophenazine are identical to those of the natural product. Since lactone (S)-12 can also be prepared from ethyl (R )-3-methylglutarate [(R)-11] by chemoselective reduction of its ester group this approach will also allow for the synthesis of (R )-methanophenazine [(R)-1]. In conclusion, methanophenazine [(S)-1] has been synthesized using a stereodivergent approach from three building blocks, i.e. 2-hydroxy-phenazine (2), ethyl (R)-3-methylglutarate [(R)-11] and (E,E)-farnesyl acetone (10) in a highly convergent manner. First experiments on the biological function of 1 show that the molecule is able to mediate the electron transport between membrane-bound enzymes in washed cytoplasmic membranes of Methanosarcina mazei Gö1. In this way Methanophenazine (1) was characterized as the first phenazine derivative involved in the electron transport of biological systems. These results suggest that its role in the energy metabolism of methanogens is similar to that of ubiquinone in mitochondria and bacteria.
Keywords: <i> Keywords:</i> electron transfer; natural products; phenazines; terpenoids.
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Methanogenese ist der abschließende Schritt beim Abbau komplexen organischen Materials und essentiell für die Mineralisation organischer Substanzen. Die Bildung von Methan aus einfachen Substraten wie H2 und CO2, Ameisensäure, Methanol, Methylaminen oder Essigsäure ist charakteristisch für die strikt anaeroben methanogenen Archaea. An der Bildung des Methans sind zahlreiche außergewöhnliche Enzyme und Cofaktoren beteiligt, wie man sie nur bei den Methanogenen findet. Die vorliegende Dissertation berichtet über die Reinigung, Strukturaufklärung und Totalsynthese von Methanophenazin (1), dem ersten Phenazinderivat aus methanogenen Archaea überhaupt. Methanophenazin (1) wurde aus Cytoplasmamembranen von Methanosarcina mazei Gö1 isoliert. Durch Aufreinigung eines Isooctan Rohextrakts aus Cytoplasmamembranen mittels HPLC konnten geringe Mengen an reiner Substanz 1 gewonnen werden. Die Aufklärung der Struktur gelang durch die Anwendung massenspektrometrischer (EI, HRMS) und NMR-spektroskopischer Methoden (1H, 13 C, H,H- und C,H-COSY). Bei dem neuen Naturstoff 1 handelt es sich um einen linearen Sesterterpenether von 2-Hydroxyphenazin (2). Die lipophile Seitenkette ist aus fünf isoprenoiden Einheiten aufgebaut, die in Kopf-Schwanz Manier miteinander verbunden sind. Die C5-Einheit, die direkt mit dem Aromaten verknüpft ist, ist gesättigt, während die verbleibenden Isopreneinheiten ungesättigt sind und einheitlich (E)-konfigurierte Doppelbindungen besitzen. Die retrosynthetische Analyse von 1 führt zu 2-Hydroxyphenazin (2) und der terpenoiden Einheit 3, die sich weiter in das Alkyliodid 6 und das (E)-Vinyliodid 7 zerlegen läßt. Die Verbindung 2 wurde durch Kondensation von 1,2,4-Trihydroxybenzol (45) und o -Phenylendiamin (5) zugänglich gemacht. Ausgehend von (R )-3-Methylglutarsäureethylester [(R)-11] wurde ein stereodivergenter Zugang zu den enantiomeren Bausteinen (R)-6 und (S)-6 ausgearbeitet. Zunächst wurde durch chemoselektive Reduktion der Carboxylgruppe von (R)-11 und anschließender Cyclisierung das Lacton (R)-12 synthetisiert, das im weiteren zu enantiomerenreinem (R)-6 umgewandelt werden konnte. Die Darstellung von (S )-1 begann mit der Transformation von (E,E)-Farnesylaceton (10) in das terminale Alkin 9, das durch Carboaluminierung und Abfangen der intermediär gebildeten Aluminiumspezies mit I2 in das (E)-Vinyliodid 7 übergeführt wurde. Eine Pd(0) katalysierte sp2-sp3 Kreuzkupplung von 7 mit dem Alkyliodid (R)-6 lieferte, nach Entschützen, den Alkohol (S)-78 in enantio- und diastereomerenreiner Form. Die Veretherung von 2-Hydroxyphenazin (2) mit (S)-78 ergab schließlich das Zielmolekül (S)-Methanophenazin [(S)-1]. Die spektroskopischen Daten von synthetischem Methanophenazin stimmen mit denen des Naturstoffs hervorragend überein. Da das Lacton (S)-12 sich ebenfalls aus (R)-3-Methylglutarsäureethylester [(R)-11] durch chemoselektive Reduktion seiner Estergruppe und anschließender Cyclisierung darstellen läßt, ist mit der vorgestellten Strategie auch die Grundlage zur Synthese von (R )-Methanophenazin [(R)-1] gelegt worden. Ausgehend von den leicht zugänglichen Synthesebausteinen 2-Hydroxyphenazin (2), (R)-3- Methylglutarsäureethylester [(R)-11] und (E,E)-Farnesylaceton (10) stellt die vorliegende Synthese einen stereodivergenten und konvergenten Zugang zu (S)-Methanophenazin [(S)-1] dar. Erste Experimente zur biologischen Funktion von 1 zeigen, daß das Molekül in der Lage ist, den Elektronentransport zwischen membrangebundenen Enzymen in gewaschenen Cytoplasmamembranen von Methanosarcina mazei Gö1 zu vermitteln. Demnach ist Methanophenazin (1) nicht nur das erste Phenazin aus methanogenen Archea, sondern es stellt auch das erste am Elektronentransport in biologischen System beteiligte Phenazinderivat dar. Die bisherigen Ergebnisse zeigen, daß die Funktion von 1 im Energiestoffwechsel der Methanogenen mit der des Ubichinons in Mitochondrien und Bakterien vergleichbar ist.
Schlagwörter: <i>Stichwörter:</i> Elektronentransport; Naturstoffe; Phenazine; Terpene.