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dc.contributor.advisor Brenig, Bertram Prof. Dr. Dr. de
dc.contributor.author Gatphayak, Kesinee de
dc.date.accessioned 2004-02-16T14:39:35Z de
dc.date.accessioned 2013-01-18T10:17:52Z de
dc.date.available 2013-01-30T23:51:20Z de
dc.date.issued 2004-02-16 de
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B036-0 de
dc.description.abstract Die im Rahmen dieser Promotion erfolgte Kartierung der porcinen Gene FUS1 und Hyaluronidase-3 (HYAL-3) ermöglichte es, ein aus fünf Genen bestehendes Gencluster (u.a. mit den Hyaluronidase-Genen 1, 2 und 3) dem porcinen Chromosom 13 im Bereich q21 zuzuordnen und molekulargenetisch zu charakterisieren. Eine besondere funktionelle Bedeutung kommt dabei dem Hyaluronidase-3-Gen zu, welches beim Schwein als ein mögliches Kandidatengen für die Entstehung von Hernien (Hodensack- und Leistenbrüche) angesehen wird. Physiologische Studien zeigen, dass das Enzym Hayluronidase-3 zusammen mit den Enzymen ß-Glucuronidase und ß-N-Acetyl-Glucosaminidase beim Abbau der Hyaluronsäure im Gubernaculum (Leitband des Hodens) beteiligt ist. Die vorliegende Arbeit weist nach, dass syntänische Beziehungen der Gene FUS1-HYAL2-HYAL1-FUS2-HYAL3 zwischen den Spezies Schwein (Chromosom 13q21), Mensch (Chromosom 3q21) und Maus (Chromosom 9F1-F2) bestehen. Etwa 20 kb genomischer DNA wurden für die Charakterisierung des Clusters beim Schwein sequenziert. Neben den FUS- und HYAL-Genen sind beim Schwein, wie beim Menschen, weitere sogenannte Tumor-Suppressor-Gene (TSG) in dem Cluster lokalisiert. Die Nukleotidhomologie der porcinen Hyaluronidase-Gene und des Gens FUS2 zu den entsprechenden humanen Genen beträgt 86% bzw. 80%. Die Sequenz des porcinen FUS1-Gens konnte in vorliegender Arbeit lediglich partiell bestimmt werden. Dessen Homologie auf Nukleotidebene beträgt 84% zum humanen FUS1-Gen.Ein weiteres Ergebnis der Arbeit ist, dass beim Schwein sowohl die Hyaluronidase-Gene als auch das Gen FUS2 in einer Vielzahl von verschiedenen Geweben expremiert werden. Dieser Nachweis erfolgte durch Quantitiative PCR. Unterschiede in der Expression der Hyaluronidase-Gene wurden lediglich in Hodenbiopsien eines acht Wochen alten kryptorchiden Ferkels und eines Ebers, der den Phänotyp Hernien aufwies, gefunden. Insgesamt wurden acht Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in den fünf Genen entdeckt (vier SNPs im Hyaluronidase-1-Gen, zwei SNPs im Hyaluronidase-2-Gen, ein SNP im Hyaluronidase-3-Gen und ein SNP im Gen FUS2). Drei der SNPs im Gen Hyaluronidase-1 und einer im Gen Hyaluronidase-3 wurden an einer 295 Tiere umfassenden Stichprobe mit Hilfe von Restriktions Fragment Längen Polymorphismen (RFLP) untersucht. Die Stichprobe setzte sich aus 15 genetisch unterschiedlichen Rassen zusammen (neun europäische und sechs chinesische Schweinerassen). Zum Nachweis des SNPs, der im Gen FUS2 lokalisiert ist, wurde ein Primer Mutagenesis Assay entwickelt. Ein erhöhtes Interesse an vertiefenden Arbeiten besteht für das FUS2-Gen. In der wissenschafltichen Literatur dargestellt am Beispiel des Modellorganismus Hefe - sind mögliche Zusammenhänge zwischen Genvarianten und individueller Fruchtbarkeitsrate postuliert. Weiterhin weist das porcine FUS2-Gen mehrere interessante Sequenzmotive auf, wie beispielsweise das RGD-Motiv, was das Schwein als Tiermodell für die Krebsforschung interessant macht. de
dc.format.mimetype application/pdf de
dc.language.iso eng de
dc.rights.uri http://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyrdiss.htm de
dc.title Molecular characterization of the porcine hyaluronidase gene cluster on SSC13q21 de
dc.type doctoralThesis de
dc.title.translated Molekulargenetische Charakterisierung des porcinen Hyaluronidase-Genclusters auf Chromosom 13q21 de
dc.contributor.referee Brenig, Bertram Prof. Dr. Dr. de
dc.date.examination 2004-02-05 de
dc.description.abstracteng The mapping of genes FUS1 and HYAL3 described in this thesis assigned a cluster of five genes including porcine hyaluronidase genes HYAL 1, 2, and 3 to SSC13q21. The hyaluronidase-3 gene is considered as a candidate gene for porcine hernia. The enzyme acts together with β-glucuronidase and β-N-acetyl glucosaminidase in the degradation of hyaluronan in the gubernaculum tissue. Recently, however, an associated genome scan has shown that in the used pedigree no association between the occurrence of hernia and this part of chromosome 13 exists.The porcine region SSC13q21 was found to be conserved in human (HSA3q21) and mouse (MMU9F1-F2), also with respect to the gene order of the hyaluronidase gene cluster: FUS1-HYAL2-HYAL1-FUS2-HYAL3. This cluster spans around 20-kb of genomic DNA. The nucleotide homology of the porcine HYAL genes and the FUS2 gene is around 86% and 80% to the human orthologs, respectively; the homology of the so far partial FUS1 genomic sequence is about 84%. The hyaluronidase gene cluster has been well characterized for Tumor Suppressor Genes (TSGs) in man.Expression analyses of the HYAL genes showed their ubiquitous expression in porcine tissues, but they are differentially expressed in testis obtained from an eight week old cryptorchid piglet and a herniated boar. FUS2 is also ubiquitously expressed in porcine tissues but is not differentially express in the testes analyzed in this study as shown by quantitative PCR. Several nucleotide polymorphisms (SNPs) that affect amino acid substitutions were found in the genes, three of them in HYAL1 and one for the FUS2 gene while the two mutations in HYAL2 and one each in HYAL1 and HYAL3 did not affect the protein composition. Three mutations in HYAL1 and the one in HYAL3 were screened in 15 genetically divergent pig breeds (9 European and 6 Chinese breeds; n = 295) by the restriction fragment length polymorphisms (RFLP) method. To test for the single nucleotide polymorphism (SNP) in the FUS2 gene, a primer mutagenesis assay was established. From the role of FUS2 described in the yeast model, the gene should further be investigated for associations with fertility rate during fertilization. Moreover, because of special domains (e.g. the RGD motif) in the gene, FUS2 seems to be a highly interesting gene for cancer research using the pig as a model animal. de
dc.contributor.coReferee Meulen, Udo ter Prof. Dr. de
dc.subject.topic Agricultural Sciences de
dc.subject.ger Schwein de
dc.subject.ger Hyaluronidase-Gen de
dc.subject.ger Chromosom 13 de
dc.subject.ger Molekular genetik de
dc.subject.ger TSG-cluster de
dc.subject.ger 630 Landwirtschaft de
dc.subject.ger Veterinärmedizin de
dc.subject.eng Pig de
dc.subject.eng Hyaluronidase genes de
dc.subject.eng Chromosome 13 de
dc.subject.eng Molecular genetic de
dc.subject.eng TSG-cluster de
dc.subject.bk 48.64 de
dc.identifier.urn urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-216-5 de
dc.identifier.purl webdoc-216 de
dc.affiliation.institute Fakultät für Agrarwissenschaften de
dc.identifier.ppn 381895394 de

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