Strukturaufklärung der Phenalinolactone und Beiträge zur Biosynthese der Hexacyclinsäure
structure elucidation of phenalinolactones and contributions to the biosynthesis of hexacyclinic acid
by Sven Wolfgang Meyer
Date of Examination:2004-01-21
Date of issue:2004-04-27
Advisor:Prof. Dr. Axel Zeeck
Referee:Prof. Dr. Ulf Diederichsen
Referee:Prof. Dr. Hartmut Laatsch
Referee:Prof. Dr. Uwe Klingebiel
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Size:946.Kb
Format:PDF
Description:Dissertation
Abstract
English
This work concentrated on biosynthetic studies as well as the isolation and structure elucidation of natural substances of streptomycetes. In line with a cooperation with the workgroup of Prof. Dr. H.-P. Fiedler (University of Tübingen) four substances, isolated from streptomyces sp. Tü 6071, were obtained. The structure elucidation using spectroscopic methods (1D/2D-NMR, HRESI-MS, IR, UV) resulted in an unusual combination of a diterpenoid skeletal structure with a trideoxysuger, a pyrrolecarboxylic acid and a novel gamma-lactone as substituents. With the aid of NOESY-experiments the relative stereochemistry of the substances named phenalinolactone A - D was determined.In a second part previous studies of the biosyntheses of hexacyclinic acid were continued. By feeding experiments using [1-13C, 18O2]-labelled precursors the biogenetic origin of almost all oxygen-atoms was proved. Starting from these results a biosynthetic pathway was proposed and disussed in terms of other natural products like FR182877. The involvment of a diels-alder-reaction during the assembly of the hexacyclic skeletal structure of hexacyclinic acid as well as FR182877 is likely. The further hetero-diels-alder-reaction discussed in literature so far could be disproved.Furthermore, 45 streptomycete strains isolated from three different soil samples were tested in a chemical screening for their production of secondary metabolites. Eight of them were investigated in detail. Isolation and structure elucidation of the compounds lead to various already known substances.
Keywords: phenalinolactones; NMR; actinomycetes; secondary metabolites; natural products; chemical screening; OSMAC; brasilicardin; biosynthesis; hexacyclinic acid; FR182877; diels-alderase; structure elucidation; terpene
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Die vorliegende Dissertation beschäftigte sich mit Biosynthesestudien sowie der Isolierung und Strukturaufklärung von Naturstoffen aus Streptomyceten.Im Rahmen eines Kooperationsprojektes mit der Arbeitsgruppe von Prof. Dr. H.-P. Fiedler (Universität Tübingen) wurden vier Substanzen erhalten, die aus Streptomyces sp. Tü 6071 isoliert wurden. Die Strukturaufklärung mit Hilfe von spektroskopischen Methoden (1D/2D-NMR, HRESI-MS, IR, UV) ergab eine ungewöhnliche Kombination von einem diterpenoidem Grundgerüst mit einem Tridesoxyzucker, einer Pyrrolcarbonsäure sowie einem neuartigen Gamma-Lacton als Substituenten. Durch NOESY-Experimente konnte die relative Stereochemie der Phenalinolacton A - D genannten Verbindungen bestimmt werden.Im zweiten Teil der Arbeit wurden bisherige Untersuchungen zur Biosynthese der Hexacyclinsäure fortgeführt. Durch Fütterungsexperimente mit [1-13C, 18O2]-markierten Vorläufermolekülen konnte der biogenetische Ursprung nahezu aller Sauerstoffatome belegt werden. Ausgehend von den Ergebnissen wurde ein Biosyntheseweg vorgeschlagen und im Hinblick auf andere Naturstoffe, im Besonderen FR182877, diskutiert. Die Beteiligung einer Diels-Alder-Reaktion beim Aufbau des hexacyclischen Grundgerüstes sowohl von Hexacyclinsäure als auch der verwandten Substanz FR182877 ist wahrscheinlich. Eine weitere, in der Literatur bisher angenommene Hetero-Diels-Alder-Reaktion bei der Biosynthese konnte jedoch widerlegt werden.Des Weiteren wurden 45 Streptomycetenstämme, die aus drei verschiedenen Erdproben isoliert wurden, einem chemischen Screening unterzogen. Acht der Stämme wurden auf Ihre Sekundärstoffproduktion hin untersucht. Isolierung und Strukturaufklärung der Inhaltsstoffe führte zu verschiedenen literaturbekannten Substanzen.
Schlagwörter: Phenalinolactone; NMR; Actinomyceten; Sekundärmetaboliten; Naturstoffe; chemisches Screening; OSMAC; Brasilicardin; Biosynthese; Hexacyclinsäure; FR182877; Diels-Alderase; Strukturaufklärung; Terpen; 540 Chemie