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Entwicklung von Lanthanoid-Tags für die biomolekulare NMR-Spektroskopie

dc.contributor.advisorGriesinger, Christian Prof. Dr.de
dc.contributor.authorPeters, Fabiande
dc.date.accessioned2011-05-02T15:09:03Zde
dc.date.accessioned2013-01-18T10:33:38Zde
dc.date.available2013-01-30T23:51:22Zde
dc.date.issued2011-05-02de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B095-9de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-2066
dc.description.abstractParamagnetisch induzierte Effekte, wie Pseudokontaktverschiebungen (PCSs) oder residuale dipolare Kopplungen (RDCs) sind für die biomolekulare NMR-Spektroskopie von großem Wert. Sie enthalten sowohl langreichweitige Informationen über Abstände und Winkel, die zur Strukturbestimmung verwendet werden können, als auch Informationen über die Dynamik eines Moleküls. In dieser Arbeit werden die Entwicklung, Synthese und Anwendung von Cys-Ph-TAHA (Cysteinyl-Phenyl-Triaminohexaacetat), einem neuartigen, neunzähnigen Lanthanoid-Tag für die paramagnetische Markierung von Proteinen beschrieben. Der vorbeladene Tag kann an oberflächenexponierte Cysteinreste über eine Disulfidbrücke selektiv gebunden werden. Die Eigenschaften des Tags wurden an zwei Ubiquitin-Cysteinmutanten und verschiedenen Lanthanoidionen untersucht. Es wurden große RDCs und PCSs gemessen, die in exzellenter Übereinstimmung mit zurückberechneten Werten waren. Mit den erhaltenen Daten wurden die Eigenschaften der PCS- beziehungsweise RDC-basierten Alignmenttensoren näher untersucht. Durch die gleichzeitige Auswertung von PCSs und RDCs konnte ein gemeinsamer Tensor bestimmt werden, der für beide Daten sehr gute Korrelationen zeigte.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isogerde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/de
dc.titleEntwicklung von Lanthanoid-Tags für die biomolekulare NMR-Spektroskopiede
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedDevelopment of lanthanide-binding tags for biomolecular NMR spectroscopyde
dc.contributor.refereeDiederichsen, Ulf Prof. Dr.de
dc.date.examination2010-12-15de
dc.subject.dnb540 Chemiede
dc.description.abstractengParamagnetically induced effects such as pseudocontact shifts (PCSs) and residual dipolar couplings (RDCs) are valuable parameters for biomolecular NMR spectroscopy. They contain angular and long-distance information, which can be used for structure determination, as well as information about the dynamics of a molecule. In this work developement, synthesis, and application of Cys-Ph-TAHA (Cysteinyl-phenyl-triaminohexaacetate) are described, which is a new nonadentate lanthanide-binding tag for paramagnetic labeling of proteins. The pre-loaded tag can be linked selectively to single solvent-exposed cysteine residues via a disulfide bridge. The performance of the tag was investigated using two cysteine mutants of ubiquitin and different lanthanide ions. Large RDCs and PCSs could be measured which were in excellent agreement with the back-calculated values. With this data, the properties of PCS- and RDC-derived alignment tensors were analyzed in detail. The simultaneous use of RDCs and PCSs resulted in a combined tensor providing very good fits for both data sets.de
dc.contributor.coRefereeGriesinger, Christian Prof. Dr.de
dc.subject.topicChemistryde
dc.subject.gerParamagnetische NMRde
dc.subject.gerLanthanoidede
dc.subject.gerPseudokontaktverschiebungde
dc.subject.gerResiduale dipolare Kopplungde
dc.subject.gerUbiquitinde
dc.subject.engParamagnetic NMRde
dc.subject.engLanthanidesde
dc.subject.engPseudocontact shiftsde
dc.subject.engResidual dipolar couplingde
dc.subject.engUbiquitinde
dc.subject.bk35.25de
dc.subject.bk35.45de
dc.subject.bk35.52de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2941-5de
dc.identifier.purlwebdoc-2941de
dc.affiliation.instituteFakultät für Chemiede
dc.subject.gokfullRRA 300: Kernmagnetische Resonanz NMR- {Physik: Hochfrequenzspektroskopie}de
dc.subject.gokfullSU 000: Organische Chemiede
dc.subject.gokfullSTL 450: Lanthanoide {Anorganische Chemie}de
dc.subject.gokfullSOC 250: Metallkomplexede
dc.subject.gokfullChelate {Chemie: Verbindungstypen}de
dc.identifier.ppn66403229Xde


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