Identification and analysis of JAK/STAT pathway target genes in Drosophila melanogaster

Bina, Samira

dc.contributor.advisor	Zeidler, Martin P. Dr.	de
dc.contributor.author	Bina, Samira	de
dc.date.accessioned	2009-07-30T06:52:56Z	de
dc.date.accessioned	2013-01-18T14:22:54Z	de
dc.date.available	2013-01-30T23:50:18Z	de
dc.date.issued	2009-07-30	de
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B4FF-E	de
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.53846/goediss-3177
dc.description.abstract	Der JAK/STAT-Signalübertragungsweg ist im Tierreich evolutionär konserviert und spielt eine Rolle in der Entwicklung eines Organismus, sowie beim Erhalt von Stammzellen. Desweiteren verursacht eine erhöhte Signalaktivität in Blutzellen Leukämie. Mit Hilfe der genetischen und molekularen Methoden, die in der Taufliege Drosophila melanogaster verfügbar sind, wurden die Hauptkomponenten der JAK/STAT-Signalkaskade identifiziert.Ziel dieser Arbeit war die Identifikation von Effektoren, die durch die JAK/STAT-Signalkaskade in Drosophila angeschaltet werden und die Bildung von Bluttumoren verursachen. Die Untersuchung des Geneexpressionsmusters ergab, dass 1197 Gen-Loci direkt oder indirekt durch den Liganden der Signalkaskade namens UPD zu unterschiedlichen Zeitenpunkten reguliert werden. Mit Hilfe von bioinformatischen Methoden konnten diese 1197 Gene zu immunologisch relevanten Kategorien (auch Gene Ontology genannt) zugewiesen werden, welche ebenfalls eine zeitlich dynamische Verteilung aufweisen. Weiterhin identifizierte die Promotoranalyse von hoch-regulierten Genen DNA-Bindungsstellen, an die der Transkriptionsfaktor der JAK/STAT-Signalkaskade mit hoher oder niedriger Affinität bindet. Die Rolle von zehn der 1197 Gene wurde in der Taufliege bezüglich der Tumorentwicklung untersucht. Darunter befinden sich Gene, die für die Zellpolarität verantwortlich sind; eine Funktion, die kürzlich mit der Aktivierung der JAK/STAT-Signalkaskade im Epithelgewebe in Verbindung gebracht wurde.	de
dc.format.mimetype	application/pdf	de
dc.language.iso	eng	de
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nd/2.0/de/	de
dc.title	Identification and analysis of JAK/STAT pathway target genes in Drosophila melanogaster	de
dc.type	doctoralThesis	de
dc.title.translated	Identifikation und Analyse von Zielgene der JAK/STAT-Signalkaskade in Drosophila melanogaster	de
dc.contributor.referee	Wimmer, Ernst A. Prof. Dr.	de
dc.date.examination	2009-05-13	de
dc.subject.dnb	570 Biowissenschaften	de
dc.subject.dnb	Biologie	de
dc.description.abstracteng	The JAK/STAT signalling cascade is one of the most conserved pathways in the animal kingdom. Aside from its developmental roles, the JAK/STAT pathway is needed for stem cell maintenance, and its mis-regulation is associated with various malignancies, ranging from solid tumours to myeloproliferative disorders. Using Drosophila as a genetically tractable model organism has enabled the identification of the main JAK/STAT pathway components. This work was aimed at identifying downstream effectors of the Drosophila JAK/STAT pathway which are be responsible for the generation and progression of blood tumours. Gene expression profiling identified 1197 loci that are regulated either directly or indirectly at different time points by the main pathway ligand UPD. Bioinformatic analysis of the 1197 genes showed a temporally dynamic distribution of functional categories relevant to immunity. Furthermore promoter analysis illustrated differential distribution of high and low affinity binding sites of the JAK/STAT pathway transcription factor among up-regulated genes. The significance of ten UPD-regulated genes in mediating tumourigenesis in flies was also validated in vivo. Among these are genes that are important in cell polarity, a function that has recently emerged as being important for polarised JAK/STAT signalling in epithelial cells.Although the focus of this work was mainly on validating the role of JAK/STAT target genes in tumourigenesis, gene expression profiling has generated a non-exhaustive list of candidate genes that can also be used for studies of other roles that are mediated by the JAK/STAT pathway, such as cell movement and stem cell maintenance.	de
dc.contributor.coReferee	Kessel, Michael Prof. Dr.	de
dc.subject.topic	Molecular Biology & Neurosciences Program	de
dc.subject.ger	JAK/STAT	de
dc.subject.ger	Signaltransduktion	de
dc.subject.ger	Drosophila	de
dc.subject.ger	Genexpressionsmuster	de
dc.subject.eng	JAK/STAT	de
dc.subject.eng	signal transduction	de
dc.subject.eng	Drosophila	de
dc.subject.eng	gene expression profiling	de
dc.subject.bk	Biologie	de
dc.identifier.urn	urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2179-2	de
dc.identifier.purl	webdoc-2179	de
dc.affiliation.institute	Göttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften und molekulare Biowissenschaften (GGNB)	de
dc.subject.gokfull	W Biologie	de
dc.identifier.ppn	615413714	de