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Pathways for phospholipid deacylation in Saccharomyces cerevisiae and their impact on fatty acid trafficking and equilibrium

dc.contributor.advisorFulda, Martin Dr.de
dc.contributor.authorMora Oberländer, Gabrielde
dc.date.accessioned2011-01-25T06:54:32Zde
dc.date.accessioned2013-01-18T14:24:03Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:57Zde
dc.date.issued2011-01-25de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B5B8-Fde
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-3203
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-3203
dc.description.abstractEin wesentliches Merkmal von biologischen Membranen ist ihre Zusammensetzung aus verschiedenen Klassen von Phospholipiden (PL) mit spezifischen molekularen Spezies, die wesentlich für ihre korrekte Funktion sind. Die molekularen Spezies der PL werden nur zum Teil durch de novo- Synthese erreicht. Es ist bekannt, dass PL umfangreichenAbbau- und Umbauprozessen unterliegen und diese von grundlegender Bedeutung für die Aufrechterhaltung der stationären Lipidzusammensetzung sind. In der Hefe Saccharomyces cerevisiae sind die Stoffwechselwege, die zu PL-Deacylierungund damitzu PL-Abbau oder Umbau führen, bislang unbekannt. Eine Schwierigkeit bei der Identifizierung der beteiligten enzymatischen Aktivitäten liegt, in der Tatsache, dass die direkten Produkte der PL-Deacylierung (freie Fettsäuren (FFS), Lysophospholipide und Glycerophosphodiesters), sehr schnell metabolisiert werden und daher nur sehr eingeschränkt für eine exakte experimentelle Erkennung und Quantifizierung zur Verfügung stehen.Im Falle der FFS ist die Metabolisierung unmittelbar mit der Umsetzung zu Acyl-CoA verknüpft. Diese Reaktion wird durch Acyl-CoA-Synthetasen (ACS) katalysiert. In dem S. cerevisiae Stamm YB526wurden die vier Gene für die ACS Enzyme Faa1p, Faa2p, Faa3p und Faa4p inaktiviert und die Zellen sind somit nicht in der Lage FFS zu aktivieren und zu verstoffwechseln. FFS, die durch Deacylierung von Lipiden freigesetzt werden akkumulierendaher in diesem Stamm und können einfach quantifiziert werden. Die Manipulation von spezifischen Enzymaktivitäten oder ganzen Stoffwechselvorgängen, die Lipid-Deacylierung oder Fettsäurehomöostase betreffen können unmittelbar an einem veränderten Gehalt von FFS in den YB526 Zellen abgelesen werden. Mit diesem Ansatz konnte gezeigt werden, dass Phospholipasen B nicht in PL-Umbau oder andere Formen der konstitutiven PL-Deacylierung involviert sind. Im Gegensatz dazu wurde autophagischer Abbau als der quantitativ bedeutendsten Mechanismus für PL-Deacylierung identifiziert. Trotz der verbreiteten Annahme, dass die Autophagie einen Mechanismus für eher unspezifischen Abbau von umfangreichen Substratmengen darstellt, zeigen unsere Daten, dass die Autophagie bei der Regulation der zellulären PL nicht nur eine quantitative, sondern auch qualitative Bedeutung hat. Der Metabolismus der Neutrallipide (NL) wurde als weiteres zentrales Element für die Regulation der Zusammensetzung der PL-Spezies identifiziert. Insgesamt beeinflusst der NL-Metabolismus die Verteilung von Fettsäuren innerhalb der Zelle quantitativ in einem ähnlichen Umfang wie die Autophagie. Innerhalb des NL-Metabolismus erbringt die Phospholipid: DAG-Acyltransferase (PDAT) Lro1p einen wesentlichen Beitrag zur PL-Deacylierung, und scheint eine prominente Rolle beim Umbau von PL generell zu spielen. Durch eine Modulation des Substrats der PL-Synthese scheinen die acyl-CoA-abhängigen Biosyntheseaktivitäten des NL-Metabolismus indirekt auch die Zusammensetzung der molekularen Spezi es der PL zu beeinflussen. Darüber hinaus stellten wir fest, dass eingeschränkte NL-Synthese zu erhöhtem autophagischen Abbau von PL führt, während die beeinträchtigte Sequestrierung von Substrat für autophagischen Abbau umgekehrt zu einer verstärkten NL-Synthese führt.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/de
dc.titlePathways for phospholipid deacylation in Saccharomyces cerevisiae and their impact on fatty acid trafficking and equilibriumde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedStoffwechselwege für die Deacylierung von Phospholipiden in Saccharomyces cerevisiae und ihre Auswirkungen auf Transport und Gleichgewicht von Fettsäuren in der Zellede
dc.contributor.refereeFeußner, Ivo Prof. Dr.de
dc.date.examination2010-04-20de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaftende
dc.subject.dnbBiologiede
dc.description.abstractengThe phospholipid (PL) class and species composition is a fundamental characteristic of membranes, essential to their proper function. The PL species distribution of cellular lipids is only partly achieved through de novo synthesis; PL degradation and PL remodeling are known to occur extensively and to be fundamental in the establishment of the steady state lipid composition. In the yeast Saccharomyces cerevisiae the pathways for PL deacylation, leading to PL degradation or PL remodeling, remained, until now, unidentified. The difficulty in the identification of the enzymatic activities involved lies, partly, in the fact that free fatty acids (FFA), lysophospholipids and glycerophosphodiesters (GPD), the direct products of PL deacylation, are rapidly metabolized and are therefore inaccessible to accurate experimental detection and quantification.In the case of FFA, metabolization is necessarily initiated by activation through conversion to acyl-CoA, a reaction catalyzed by acyl-CoA synthetases (ACS). The S. cerevisiae strain YB526, in which the genes coding for the ACS enzymes Faa1p, Faa2p, Faa3p and Faa4p have been deleted, is unable to activate, and therefore to metabolize, FFA. In consequence, FFA derived from lipid deacylation accumulate in this strain and can be quantified. An analysis of the effect that the interference with specific enzymatic activities and metabolic processes has on the FFA content of YB526 cells, reveals the role of those activities and processes in lipid deacylation and in the homeostasis of fatty acids (FA) and acyl-ester pools in general.This approach has revealed that phospholipases B are not involved in PL remodeling or other constitutive forms of PL deacylation. Autophagic degradation, in contrast, was identified as the quantitatively most prominent mechanism for PL deacylation. Despite the fact that autophagy constitutes a mechanism for bulk degradation, its role in the regulation of the cellular PL content appears to be not only quantitative, but also qualitative. Neutral lipid (NL) metabolism was identified as well as a central element in the regulation of PL species composition. NL metabolism as a whole, mediates FA trafficking to a quantitatively similar extent than autophagy. Within NL metabolism, the phospholipid:DAG acyltransferase (PDAT) Lro1p makes a substantial contribution to PL deacylation, and is suggested by our results as the most likely mediator in PL remodeling. The acyl-CoA dependant biosynthetic activities of NL metabolism appear to be involved as well in the establishment of PL species composition through a modulation of the substrate available for PL synthesis. Furthermore, we established that impaired NL synthesis leads to augmented autophagic degradation of PL, while impaired sequestration of substrate for autophagic degradation leads to enhanced NL synthesis.de
dc.contributor.coRefereeThumm, Michael Prof. Dr.de
dc.contributor.thirdRefereeNave, Klaus-Armin Prof. Dr.de
dc.subject.topicGöttingen Graduate School for Neurosciences and Molecular Biosciences (GGNB)de
dc.subject.gerSaccharomyces cerevisiaede
dc.subject.gerPhospholipidsynthesede
dc.subject.gerPhospholipid Umbaude
dc.subject.gerNeutrallipidede
dc.subject.gerFettsäurende
dc.subject.gerLipidhomöostasede
dc.subject.gerLipasede
dc.subject.gerAutophagiede
dc.subject.engSaccharomyces cerevisiaede
dc.subject.engphospholipid synthesisde
dc.subject.engphospholipid remodelingde
dc.subject.engneutral lipidsde
dc.subject.engfatty acidde
dc.subject.englipid homeostasisde
dc.subject.englipasede
dc.subject.engautophagyde
dc.subject.bk35.78de
dc.subject.bk42.13de
dc.subject.bk42.30de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2784-9de
dc.identifier.purlwebdoc-2784de
dc.affiliation.instituteGöttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften und molekulare Biowissenschaften (GGNB)de
dc.subject.gokfullWF200de
dc.subject.gokfullWUE200de
dc.identifier.ppn662669525de


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