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Characterization of neuronal SNAREs and interacting proteins

dc.contributor.advisorFasshauer, Dirk Prof. Dr.de
dc.contributor.authorPobbati Venkatesan, Ajaybabude
dc.date.accessioned2006-03-20T06:55:18Zde
dc.date.accessioned2013-01-18T14:25:19Zde
dc.date.available2013-01-30T23:51:15Zde
dc.date.issued2006-03-20de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B5E9-1de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-3234
dc.description.abstractDiese Arbeit konzentrierte sich auf die SNARE-Proteine Syntaxin 1, SNAP-25 und Synaptobrevin 2, die an der Freisetzung von Neurotransmittern aus synaptischen Vesikeln mitwirken. Ein einfaches Modell vergleicht die Funktionsweise von SNAREs mit einem Reissverschluss, wobei man annimmt, dass sie sich ausgehend vom N-Terminus zu einem Bündel zusammenlagern. Wahrscheinlich reicht die dabei freigesetzte Energie zur Aktivierung der Vesikelfusion aus. Allerdings sind die Belege für das Reissverschluss-Modell weitgehend indirekt.In vivo werden die Neurotransmitter innerhalb von Millisekunden freigesetzt, wenn man aber neuronale SNAREs in Liposomen einbaut, benötigt deren Fusion mehrere Minuten. Dieser Widerspruch beschäftigt die Forschung schon seit längerem und war Grundlage für den ersten Teil dieser Arbeit. Durch biochemische Analyse wurde die schrittweise Ausbildung des neuronalen SNARE-Komplexes nachgewiesen. Zuerst entsteht ein dimerer Übergangskomplex aus Syntaxin 1 und SNAP-25, an den Synaptobrevin binden kann, jedoch auch ein zweites Molekül Syntaxin 1. Ein 2:1 Komplex aus Syntaxin 1 und SNAP-25 ist für Synaptobrevin nicht zugänglich und daher der Reaktion zum neuronalen SNARE-Komplex entzogen. Zu Beginn der Arbeit vermuteten wir, dass die Bildung des 2:1 Komplexes die Liposomenfusion verlangsamt. Dazu wurde ein trimerer Komplex aus Syntaxin 1, SNAP-25 und einem C-terminalen Teil von Synaptobrevin untersucht, dessen Struktur dem Dimer aus Syntaxin 1 und SNAP-25 ähnelt, an den aber kein weiteres Syntaxin 1 binden kann. Wurde der trimere Komplex in Liposomen eingebaut, erfolgte deren Fusion deutlich schneller. SNAREs können daher schnelle Membranfusion vermitteln, wenn der dimere Übergangskomplex stabilisiert wird. Meine Daten belegen ausserdem, dass Synaptobrevin an den N-terminalen Teil der Q-SNAREs bindet, was mit dem Reissverschluss-Modell übereinstimmt.Der übrige Teil der Arbeit beschäftigte sich mit den löslichen, regulatorischen SNARE-Proteinen Tomosyn und Amisyn. Beide Proteine bilden einen stabilen trimeren Komplex mit Syntaxin 1 und SNAP-25. Aus der sorgfältigen Charakterisierung des SNARE-Motivs von Tomosyn ergab sich die Aufklärung der Kristallstruktur des SNARE-Kernkomplexes um Tomosyn, der wie der neuronale Komplex ein Bündel aus vier Helices darstellt. Tomosyn kann im Komplex nicht durch Synaptobrevin ersetzt werden, und die Hinweise aus meiner Arbeit bestärken die Annahme, dass Tomosyn und Amisyn als Inhibitoren der Exocytose wirken könnten.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.htmlde
dc.titleCharacterization of neuronal SNAREs and interacting proteinsde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedCharakterisierung von neuronalen SNAREs und interagierenden Proteinende
dc.contributor.refereeLiebl, Wolfgang Prof. Dr.de
dc.date.examination2006-03-15de
dc.subject.dnb570 Biowissenschaftende
dc.subject.dnbBiologiede
dc.description.abstractengThis work centered on the SNARE proteins syntaxin 1, SNAP-25, and synaptobrevin 2, which drive the discharge of neurotransmitters from synaptic vesicles. A relatively simple scenario for the role of SNAREs in neurotransmitter release is given by the zipper model, which assumes that the SNARE assembly proceeds from N → C terminus and the energy released during the assembly is probably sufficient to overcome the energy barrier for fusion. However, the evidence for the zipper model is largely circumstantial.Physiologically, neurotransmitter release takes place in milliseconds, but when neuronal SNAREs are reconstituted into liposomes, fusion occurs very slowly (> several minutes). The initial part of this work addressed this long-standing controversy in the SNARE field. Biochemical analysis demonstrates the sequential assembly of neuronal SNAREs. The assembly initiates with the formation of transient dimer of syntaxin and SNAP-25, which constitutes the appropriate binding site for synaptobrevin. However this binding site is also readily occupied by a second syntaxin molecule, resulting in an `off-pathway´ 2:1 syntaxin-SNAP-25 complex. In the beginning of the work we hypothesized that the liposome fusion is probably slow because of this `off-pathway´ reaction. In this study a ternary SNARE complex containing syntaxin, SNAP-25 and C-terminal portion of synaptobrevin prevented this `off-pathway´ reaction. This ΔN complex was also a structural mimic of syntaxin-SNAP-25 dimer. When this complex was reconstituted into liposomes the fusion was greatly enhanced. Therefore by providing an appropriate binding site and by preventing the `off-pathway´ reaction, SNAREs can rapidly fuse membranes. My data also demonstrates that the synaptobrevin binding site is restricted to the N-terminal portion of the Q-SNAREs. Thus, my study supports the zipper model.The other part of the work focused on the soluble SNARE regulatory proteins tomosyn and Amisyn. The initial detailed characterization of the SNARE motif of tomosyn led to the elucidation of the crystal structure of the core tomosyn SNARE complex, which is a four-helix bundle similar to that of the SNARE complex containing synaptobrevin. The tomosyn in the SNARE complex cannot be replaced by synaptobrevin and my work supports the view that tomosyn acts as a negative regulator of exocytosis. The full-length and the SNARE motif of amisyn, like tomosyn, formed a stable ternary complex with syntaxin and SNAP-25. Preliminary experiments suggested that amisyn also acts as a negative regulator of exocytosis.>de
dc.subject.topicMolecular Biology & Neurosciences Programde
dc.subject.gerSNAREde
dc.subject.gerVesikelfusionde
dc.subject.gertomosynde
dc.subject.geramisynde
dc.subject.engSNAREsde
dc.subject.engmembrane fusionde
dc.subject.engtomosynde
dc.subject.engamisynde
dc.subject.bk42.13 Molecular biologyde
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-685-9de
dc.identifier.purlwebdoc-685de
dc.affiliation.instituteGöttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften und molekulare Biowissenschaften (GGNB)de
dc.identifier.ppn484868527de


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