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dc.contributor.advisor Sheldrick, George M. Prof. Dr. de
dc.contributor.author Pfoh, Roland de
dc.date.accessioned 2008-12-01T12:10:05Z de
dc.date.accessioned 2013-01-18T10:30:15Z de
dc.date.available 2013-01-30T23:51:21Z de
dc.date.issued 2008-12-01 de
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B651-D de
dc.description.abstract Die Arbeit befasst sich mit der Strukturaufklärung von Komplexen zwischen DNA und Antibiotika, wobei die Kristallstrukturen der drei Komplexe d(AACCGGTT)-Trioxacarcin, d(CGTACG)-Trioxacarcin und d(ACGTACGT)-Echinomycin beschrieben werden. Sowohl bei Trioxacarcin A als auch bei Echinomycin handelt es sich um Naturstoffe, die von Streptomyceten hergestellt werden. Trioxacarcin A interkaliert zwischen den Basenpaaren der DNA und bindet auβerdem kovalent zu N7 einer Guanin-Base. Im erstgenannten Komplex verursacht Trioxacarcin das Herausdrehen der nicht-endständigen Thymin-Base aus dem gebildeten Duplex, während bei dem Oligonukleotid d(CGTACG) die Bildung eines Hexaplexes induziert wird. Echinomycin bindet sich dagegen durch Bisinterkalation an DNA, wofür zwei Quinoxalin-Gruppen eingesetzt werden. Die Kristallstruktur zeigt eine Wechselwirkung der DNA-Basen mit Mangan(II)-Ionen, die wahrscheinlich durch die starke Verzerrung der DNA durch Echinomycin ermöglicht wird. Alle drei Kristallstrukturen wurden durch experimentelle Phasenbestimmung gelöst, wobei die Methoden MAD, SAD und SIRAS angewendet wurden. Ein methodischer Teil der Arbeit befasst sich mit dem Effekt der anisotropen Skalierung auf die Strukturlösung von Makromolekülen. Es wird am Beispiel einer Peptid-Struktur gezeigt, dass bei stark anisotrop streuenden Kristallen die Qualität der Elektronendichte-Karten mit Hilfe einer entsprechenden Skalierung deutlich verbessert werden kann. de
dc.format.mimetype application/pdf de
dc.language.iso eng de
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nd/2.0/de/ de
dc.title Crystallographic studies on DNA in complex with antibiotics and effects of anisotropic scaling on structure solution de
dc.type doctoralThesis de
dc.title.translated Kristallstrukturanalyse von DNA in Komplexen mit Antibiotika und Effekte anisotroper Skalierung auf die Strukturlösung de
dc.contributor.referee Sheldrick, George M. Prof. Dr. de
dc.date.examination 2008-10-30 de
dc.subject.dnb 500 Naturwissenschaften allgemein de
dc.description.abstracteng This work investigates the structure of complexes between DNA and antibiotics discussing the crystal structures of d(AACCGGTT)-trioxacarcin, d(CGTACG)-trioxacarcin and d(ACGTACGT)-echinomycin. Both trioxacarcin A and echinomycin are natural compounds produced by streptomyces. Trioxacarcin A intercalates between the DNA base pairs and additionally forms a covalent bond to N7 of a guanine base. In the first complex the non-terminal thymine is flipped out from the duplex whereas in the second one trioxacarcin induces the formation of a DNA hexaplex. Echinomycin on the other hand binds to duplex DNA by bisintercalation of its two quinoxaline residues. The crystal structure shows contacts between DNA bases and bivalent manganese ions which might be related with the DNA unwinding induced by echinomycin. All three crystal structures were solved by experimental phasing using MAD, SAD or SIRAS. A more methods-oriented part of the work investigates the effect of anisotropic scaling on structure solution. With the example of a D,L-alternating peptide it is shown that anisotropic scaling can improve the electron density maps dramatically in the case of severe anisotropic diffraction. de
dc.contributor.coReferee Laatsch, Hartmut Prof. Dr. de
dc.subject.topic Mathematics and Computer Science de
dc.subject.ger Trioxacarcin A de
dc.subject.ger Echinomycin de
dc.subject.ger Anisotrope Skalierung de
dc.subject.eng trioxacarcin A de
dc.subject.eng echinomycin de
dc.subject.eng DNA-drug complex de
dc.subject.eng anisotropic scaling de
dc.subject.eng DNA hexaplex de
dc.subject.bk 35.25 de
dc.subject.bk 35.65 de
dc.identifier.urn urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-1961-1 de
dc.identifier.purl webdoc-1961 de
dc.affiliation.institute Fakultät für Chemie de
dc.subject.gokfull SXN 140: Desoxyribonucleinsäuren {Biochemie} de
dc.identifier.ppn 600975487 de

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