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Acyl-acyl carrier protein synthetases from bluegreen algae and plants

dc.contributor.advisorFeußner, Ivo Prof. Dr.de
dc.contributor.authorKaczmarzyk, Danutade
dc.date.accessioned2012-05-16T12:10:06Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:50Zde
dc.date.issued2008-12-02de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B652-Bde
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-1339
dc.description.abstractAllen metabolischen Prozessen von Fettsäuren, geht deren Aktivierung zu einem Thioesterderivat voraus. Während die Aktivierung durch Acyl-CoA-Synthetasen in der Literatur gut etabliert ist, ist für die alternative Aktivierung mittels Acyl-Carrier-Protein bislang wenig Information verfügbar. Die Aufgabe dieser Arbeit war daher die Untersuchung von Acyl-ACP-Synthetase-Aktivitäten (AAS) in Cyanobakterien und höheren Pflanzen als Vertretern von photosynthetischen Organismen.In einer früheren Studie unserer Arbeitsgruppe konnten Acyl-ACP-Synthetasen aus Cyanobakterien identifiziert werden und ihre Aktivität nach heterologer Expression in Escherichia coli funktional charakterisiert werden. Die biologische Funktion dieser Aktivitäten konnte jedoch nicht ermittelt werden. In Arabidopsis wurden mit AAE15 und AAE16 zwei homologe Sequenzen gefunden. Beide Proteine wurden zuvor bereits bezüglich ihrer Rolle für die Elongation von exogenen Fettsäuren in Chloroplasten untersucht (Koo et al. 2005), jedoch legten die gewonnenen Daten lediglich für AAE15 eine AAS-Aktivität nahe.Um die biologische Funktion der AAS-Aktivität in Cyanobakterien zu untersuchen, wurden aas-Deletionsmutanten in den Stämmen Synechocystis sp. PCC 6803 und Synechococcus elongatus PCC 7942 hergestellt. Die erzeugten Mutanten zeigten zwei Phänotypen: Die Stämme waren unfähig exogene Fettsäuren aus dem Medium zu verwerten und sie sekretierten endogene Fettsäuren in das Kulturmedium. Durch Komplementation der aas-Mutante des Stammes Synechocystis sp. PCC 6803 mit dem aas Gen aus Synechococcus elongatus PCC 7942 konnte der Wildtyp-Status widerhergestellt werden. Die Analyse der extrazellulären und der intrazellulären Fettsäureprofile von Wildtyp und den aas-Mutanten Stämmen ergab, dass die gefundenen Fettsäuren aus Membranlipiden freigesetzt werden. Die gefundenen Daten deuten auf einen hohen Turnover dieser Lipide hin. Die AAS-Aktivität scheint für die Reaktivierung der freigesetzten Fettsäuren erforderlich zu sein mit dem Ziel diese Fettsäuren dem Lipidmetabolismus erneut verfügbar zu machen.Das Genom von Arabidopsis kodiert für zwei Sequenzen mit deutlicher Ähnlichkeit zu den AAS-Proteinen aus Cyanobakterien. Für diese beiden mit AAE15 und AAE16 benannten Proteine wurde mittels Expression von EYFP-Fusionsproteinen in Zwiebelzellen die Lokalisation in Plastiden nachgewiesen. Für eine weitergehende Charakterisierung wurden beide Proteine in Insektenzellen exprimiert und ihre Aktivität mittels in-vitro Enzymtests untersucht. Für AAE15 konnte AAS-Aktivität mit mittelkettigen Fettsäuren nachgewiesen werden. Zusätzlich wurde die aas-Mutante aus Synechocystis sp. PCC 6803 mit AAE15 und AAE16 komplementiert und die entstandenen Stämme anschließend für Fütterungsstudien mit Fettsäuren herangezogen. Es konnte gezeigt werden, dass die Komplementation mit AAE15 den Wildtyp-Phänotyp wieder herstellte. Zusätzlich wurde die Spezifität von AAE15 für mittelkettige Fettsäuren bestätigt. Die Komplementation mit AAE16 verlief ebenfalls erfolgreich und deutet eine breite Substratspezifität für dieses Protein an. In weiteren Studien wurde die Expression von AAE15 und AAE16 in Abhängigkeit von Gewebetypen und von Entwicklungsstadien untersucht. Die histochemischen GUS-Färbungen zeigten für AAE15 und AAE16 hochspezifische Expressionsprofile in verschiedenen Organen der Blüte und zusätzlich für AAE16 die Expression in Schließzellen. Diese Ergebnisse zeigen deutliche Diskrepanzen zu den Mikroarray-basierten Daten, die durch Genevestigator verfügbar sind.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/2.0/de/de
dc.titleAcyl-acyl carrier protein synthetases from bluegreen algae and plantsde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedAcyl-Acyl Carrier Protein Synthetasen aus Blaualgen und Pflanzende
dc.contributor.refereeFeußner, Ivo Prof. Dr.de
dc.date.examination2008-04-29de
dc.subject.dnb500 Naturwissenschaften allgemeinde
dc.description.abstractengAll metabolic processes involving fatty acids are preceded by the activation of the fatty acid to form a thioester derivative. Activation by acyl-CoA synthetase is well established whereas only little information is available about the alternative way utilizing acyl carrier protein (ACP) as acceptor of the acyl group. The focus of this work was to investigate acyl-ACP synthetase (AAS) activity in cyanobacteria and plants, two groups of photosynthetic organisms.In a previous study of our group cyanobacterial AAS was identified and functionally characterized by heterologous expression in Escherichia coli. However, the biological role of this activity within the cell was not determined. Two homologous sequences, AAE15 and AAE16 were found in Arabidopsis. Both of them were investigated by Koo et al. (2005) with respect to their role in the elongation of exogenous fatty acids in chloroplasts, but only for AAE15 the AAS activity was proposed.To elucidate the biological role of AAS activity in cyanobacteria, aas knockout mutants were generated in the background of Synechocystis sp. PCC 6803 and Synechococcus elongatus PCC 7942. The obtained mutants showed two phenotypes: They were unable to utilize exogenous fatty acids and they secreted endogenous fatty acids into the culture medium. The wild type phenotype was restored by complementation of the aas knockout mutant of Synechocystis sp. PCC 6803 with the corresponding gene from Synechococcus elongatus PCC 7942. The analysis of extracellular and intracellular fatty acid profiles of wild type strains and aas mutant strains showed that fatty acids are released from membrane lipids indicating a strong turnover of these lipids. The AAS activity seemed to be necessary for the reactivation of the released fatty acid thereby enabling their recycling back into the lipid metabolism.The genome of Arabidopsis encodes two sequences with strong amino acid similarity to the AAS of cyanobacterial origin. For these two proteins termed AAE15 and AAE16 the localization in plastids was confirmed by expression of EYFP fusion proteins in onion cells followed by fluorescent microscopy. To further characterize these proteins, AAE15 and AAE16 were overexpressed in insect cells and analyzed by in-vitro assays. It was shown that AAE15 displays AAS activity with substrate specificity towards medium chain fatty acids. In addition the aas knockout mutant of Synechocystis sp. PCC 6803 was complemented individually with AAE15 and AAE16, and the obtained strains were fed with labeled fatty acids. It was demonstrated that complementation with AAE15 restored the wild type phenotype, and the specificity for medium chain fatty acids of the enzyme was confirmed. In addition the complementation experiment gave evidence for AAS activity of AAE16 and indicated its broad substrate specificity. In further studies the expression of AAE15 and AAE16 were analyzed with respect to tissue specificity and to dependence on developmental stage. The histochemical GUS staining indicated highly specific expression profiles for AAE15 and AAE16 in flower organs and additionally for AAE16 in guard cells of different organs. The results revealed some strong discrepancies to microarray-based data provided by Genevestigator.de
dc.contributor.coRefereeHeineke, Dieter Prof. Dr.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.gerFettsäurede
dc.subject.gerLipidde
dc.subject.gerAcyl Carrier Proteinde
dc.subject.gerCyanobakteriende
dc.subject.engfatty acidde
dc.subject.englipidde
dc.subject.engacyl carrier proteinde
dc.subject.engcyanobacteriade
dc.subject.bk35.73de
dc.subject.bk42.13de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-1964-9de
dc.identifier.purlwebdoc-1964de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullWVE 200: Biochemie {Botanik, Pflanzenphysiologie und Phytochemie}de
dc.identifier.ppn600975061de


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