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Vergleichende Untersuchungen zur Regulation der SNARE-Komplexbildung durch Sec1/Munc18-Proteine

dc.contributor.advisorFasshauer, Dirk Prof. Dr.de
dc.contributor.authorBurkhardt, Pawelde
dc.date.accessioned2009-07-01T12:10:45Zde
dc.date.accessioned2013-01-18T14:24:01Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:18Zde
dc.date.issued2009-07-01de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B671-5de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-3202
dc.description.abstractMembranfusionsereignisse zwischen den verschiedenen Kompartimenten eukaryotischer Zellen werden durch zwei konservierte Proteinfamilien vermittelt: SNARE- und Sec1/Munc18 (SM)-Proteine. Die SNARE-Proteine Syntaxin1a, SNAP-25 und Synaptobrevin2 sind in Nervenzellen an der Fusion synaptischer Vesikel mit der Plasmamembran beteiligt. Syntaxin1a und SNAP-25 sind auf der Plasmamembran lokalisiert, Synaptobrevin2 auf der Vesikelmembran. Die Komplexbildung der drei Membranproteine zwischen Plasma- und Vesikelmembran leitet die Fusion ein. SM-Proteine interagieren mit SNARE-Proteinen, allerdings ist der genaue molekulare Mechanismus dieser Interaktion noch nicht wirklich aufgeklärt. So bindet das SM-Protein Munc18a fast die gesamte zytosolische Domäne von Syntaxin1a in der so genannten geschlossenen Konformation. Mehrere andere SM-Proteine (i.e. Munc18c, Sly1, Vps45) scheinen dagegen nur ein kurzes N-terminales Peptid für die Bindung an ihren Syntaxinpartner zu verwenden. Im ersten Teil dieser Arbeit konnte ich mittels ITC zeigen, dass für eine hochaffine Bindung von Munc18a und Syntaxin1a nicht nur Kontakte von der geschlossenen Konformation, sondern zusätzlich Kontakte vom N-terminalen Peptid von Syntaxin1a nötig sind. In der Tat konnte das N-terminale Peptid in eine zuvor übersehene Elektronendichte in der Kristallstruktur eingefügt werden. Diese befindet sich an der äußeren Oberfläche der Domäne 1 von Munc18a. Die Elektronendichte konnte verfeinert werden und die Aminosäuren 2-9 vom N-terminalen Syntaxin1a-Peptid in die Elektronendichte eingebaut werden. Des Weiteren wurde ein zweites SM-Protein/Syntaxin-Paar untersucht. Auch für eine hochaffine Interaktion von Vps45 und Syntaxin16 ist das N-terminale Peptid und der gesamte Rest des Syntaxin16-Moleküls, sehr wahrscheinlich in einer geschlossenen Konformation, an der Bindung beteiligt. Meine Arbeit zeigt, dass SM-Protein/Syntaxin-Paare über einen konservierten Bindungsmechanismus interagieren. An der kooperativen Bindung scheinen jeweils zwei Bereiche von Syntaxin1a beteiligt. Im zweiten Abschnitt der Arbeit wurde der Einfluss von Munc18a auf die SNARE-Komplexbildung untersucht. Es ist seit einiger Zeit bekannt, dass Munc18a Syntaxin1a bindet und die SNARE-Komplexbildung in vitro blockiert. Bisher konnte allerdings nicht geklärt werden, wie Syntaxin1a sich aus der festen Umklammerung von Munc18a befreien kann. In der hier vorliegenden Arbeit konnte gezeigt werden, dass die Interaktion von Munc18a mit dem N-Peptid nötig ist, um die SNARE-Komplexbildung unterbinden zu können. Wurde das N-terminale Peptid von Syntaxin1a entfernt oder die Bindung durch Punktmutationen im N-terminalen Peptid bzw. in der Munc18a-Bindestelle gestört, war die SNARE-Komplexbildung in Anwesenheit von Munc18a nicht mehr blockiert. Dieser Befund weist auf einen möglichen Konformationswechsel im Munc18a/Syntaxin1a-Komplex hin. Abschließend wurde die Interaktion von Munc18 und Syntaxin1 und die Rolle von Munc18 bei der SNARE-Komplexbildung in dem Choanoflagellaten Monosiga brevicollis, einem den Tieren nahe verwandter Einzeller, untersucht. Es stellte sich heraus, dass nicht nur die Bindung von Munc18 an das N-terminale Peptid und die geschlossene Konformation von Syntaxin1 in Choanoflagellaten hoch konserviert ist, sondern auch die regulative Funktion von Munc18 bei der SNARE-Komplexbildung. Des Weiteren legen meine licht- und elektronenmikroskopischen Untersuchungen nahe, dass Monosiga brevicollis einen Sekretionsapparat besitzt, welcher sich in der apikalen Region der Zelle befindet.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isogerde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/2.0/de/de
dc.titleVergleichende Untersuchungen zur Regulation der SNARE-Komplexbildung durch Sec1/Munc18-Proteinede
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedComparative investigations on the regulation of SNARE complex assembly by Sec1/Munc18-like proteinsde
dc.contributor.refereeFasshauer, Dirk Prof. Dr.de
dc.date.examination2009-03-25de
dc.subject.dnb500 Naturwissenschaften allgemeinde
dc.description.abstractengMembrane fusion events between various intracellular compartments in eukaryotic cells are mediated by two conserved protein families: SNARE- and Sec1/Munc18 (SM)-proteins. The SNARE proteins syntaxin1, SNAP-25, and synaptobrevin2 play a central role during fusion of synaptic vesicles with the plasma membrane. Syntaxin1 and SNAP-25 are located in the plasma membrane, whereas synaptobrevin2 resides on synaptic vesicles. Their assembly into a membrane-bridging ternary SNARE complex is believed to drive fusion. SM-proteins interact with SNARE-proteins but the molecular basis for this interaction is not entirely understood. Munc18a binds the cytosolic domain of syntaxin1a in a so called closed conformation. A binding mode distinct from that of Munc18a/syntaxin1a appears to govern the interaction of several other SM-proteins (i.e. Munc18c, Sly1, Vps45) with their cognate syntaxins. In these complexes the far N-terminal region of syntaxin binds to the SM-protein. In the first part of this thesis it is shown that Munc18a binds simultaneously to the closed conformation of syntaxin1a and to the N-terminal peptide of syntaxin1a by ITC. In addition, residual electron density on the outer surface of domain 1 of Munc18a was uncovered, a finding that had been overlooked until now. Re-refinement of the Munc18a/syntaxin1a-structure improved the electron density within this region, and residues 2 9 of syntaxin1a could be modelled. A second SM-protein/syntaxin-pair was also investigated. It was observed that the N-terminal peptide of syntaxin 16 binds to the SM-protein Vps45, while the remainder of syntaxin 16, probably in a closed conformation strongly enhances the affinity of the interaction. Collectively these data indicate that SM-proteins interact with their cognate syntaxins via a conserved binding mechanism. Two regions of syntaxin appear to cooperatively bind Munc18a. Next, the role of Munc18a in controlling SNARE complex assembly was investigated. It has previously been established, that Munc18a binds syntaxin1a and thereby blocks SNARE-complex assembly in vitro. However, how syntaxin1a can escape the tight grip of Munc18a, thus enabling its participation in SNARE complex formation remains unclear. Here it is demonstrated, that the interaction of Munc18a with the N-terminal peptide of syntaxin1a is essential for the inhibition of SNARE-complex formation. Removal of the N-terminal peptide of syntaxin1a, and either point mutations in the peptide, or in the Munc18a binding site, allowed for SNARE complex formation of Munc18a-bound syntaxin1a. These results suggest a conformational change in the Munc18a/syntaxin1a-complex. In the third section, the interaction of Munc18 and syntaxin1 and the role of Munc18 in SNARE-complex assembly in the choanoflagellate Monosiga brevicollis, a unicellular organism believed to be the closest known relative of animals, was investigated. The results indicate that not only is the binding of Munc18 to the N-terminal peptide and the closed conformation of syntaxin1 conserved, but also the regulative function of Munc18 in controlling SNARE-complex assembly in chaonoflagellates. Furthermore using light- and electron microscopy it was shown that Monosiga brevicollis appears to possess a secretion apparatus localized to the apical region of the cell.de
dc.contributor.coRefereeFicner, Ralf Prof. Dr.de
dc.contributor.thirdRefereeThumm, Michael Prof. Dr.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.gerSNAREde
dc.subject.gerMembranfusionde
dc.subject.gerMunc18de
dc.subject.gerITCde
dc.subject.engSNAREde
dc.subject.engmembrane fusionde
dc.subject.engMunc18de
dc.subject.engITCde
dc.subject.bk42.00de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2155-5de
dc.identifier.purlwebdoc-2155de
dc.affiliation.instituteGöttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften und molekulare Biowissenschaften (GGNB)de
dc.subject.gokfullWA 000: Biologiede
dc.identifier.ppn631860223de


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