Assoziation von Polymorphismen und alternativen Splicevarianten von DNA-Reparaturgenen mit der Entwicklung von malignen Melanomen

Abstract

Xeroderma pigmentosum (XP) Patienten sind extrem sonnenempfindlich und haben ein über 1000fach erhöhtes Risiko, Hauttumore wie auch maligne Melanome zu entwickeln. Polymorphismen in XP Genen könnten zu leichten Variationen der Nukleotidexzisionsreparaturkapazität führen und damit zur Entstehung von Melanomen beitragen. Diese Arbeit untersucht die Assoziation von insgesamt sieben Polymorphismen der DNA-Reparaturgenen XPC und XPG mit malignen Melanomen in einer Fall-Kontrollstudie von 294 Patienten mit malignem Melanom und 375 gesunden Kontrollpersonen aus der gleichen Region. Die Allelfrequenzen der sieben Polymorphismen entsprachen dem Hardy-Weinberg-Gleichgewicht. Es konnte bestätigt werden, dass drei Polymorphismen (XPC Intron 9 PAT, Intron 11 C-6A und Exon 15 A2920C) im Kopplungsungleichgewicht liegen und einen Haplotyp bilden (D’=1). Die XPC Intron 9 PAT+/+, Intron 11 -6A/A und Exon 15 2920C/C Genotypen waren mit einem nicht-signifikant erhöhten Melanomrisiko assoziiert: OR 1.527 (95%-KI: 0.967-2.418), OR 1.526 (95%-KI: 0.966-2.414), und OR 1.425 (95%-KI: 0.906-2.246). Die Analyse von Subgruppen zeigte, dass diese Genotypen insbesondere mit Melanomen bei älteren Patienten (>60 Jahre) (n=100), bei Patienten mit weniger als 50 Nävi (n=273), bei Patienten mit multiplen primären Melanomen (n=28) und bei Patienten mit einer primären Tumordicke >1mm (n=126) assoziiert sein könnten. Dies unterstützt die Hypothese, dass der PAT+, Intron 11A, Exon 15C Haplotyp zur Melanomentstehung sowie zur Melanomprogression beitragen könnte. Die Analyse der 4 anderen Polymorphismen im XPC (Exon 8 G1580A; Arg492His und T1601C; Val499Ala, Exon 10 G2166A; Arg687Arg) und XPG Gen (Exon 15 C3507G; Asp1104His) zeigte keine Assoziationen mit dem Risiko einer Melanomerkrankung. Zusätzlich wurde in einer Pilotstudie die relative Expressionsmenge der alternativ gesplicten XPC mRNA Isoform mit Deletion von Exon 12 mittels quantitativer real-time RT-PCR bei 26 Melanompatienten und 23 nach Alter und Geschlecht abgeglichenen gesunden Kontrollen bestimmt. Die neu etablierte sensitive Technik ergab sehr gut reproduzierbare Ergebnisse, die mit Literaturangaben übereinstimmen. Die Hypothese einer höheren relativen Expression der XPC Splicevariante in der Melanomgruppe ließ sich jedoch nicht bestätigen.