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Metabolic and developmental functions of the transcription factor Gcn4p of Saccharomyces cerevisiae

Die metabolischen und Entwicklungsfunktionen des Transkriptionsfaktors Gcn4p von Saccharomyces cerevisiae

by Britta Herzog
Doctoral thesis
Date of Examination:2010-10-27
Date of issue:2011-10-17
Advisor:Prof. Dr. Gerhard Braus
Referee:Prof. Dr. Gerhard Braus
Referee:PD Dr. Michael Hoppert
crossref-logoPersistent Address: http://dx.doi.org/10.53846/goediss-3548

 

 

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Abstract

English

The bakers’ yeast Saccharomyces cerevisiae executes two well established pathways, the ‘General Amino Acid Control’ (GAAC) and the ‘Unfolded Protein Response’ (UPR), which are in contrast to mammals not essential but enable yeast cells to adapt to environmental changes and different stress conditions. The bZIP transcription factor Gcn4p represents the global key regulator of the GAAC and herein regulates transcription of numerous metabolic genes of amino acid or purine biosynthesis in response to amino acid starvation. Gcn4p is also involved in the regulation of the developmental cell-surface flocculin Flo11p, which is required for diploid pseudohyphae formation and for adhesion upon nutrient starvation. This dual function as metabolic and developmental activator could be separated by a Gcn4p variant carrying a single amino acid substitution in its leucine zipper, Gcn4pL267S. This mutation abolishes FLO11 expression and results in a reduced but sufficient transcriptional activity for the induction of amino acid biosynthetic genes. Gcn4pL267S is impaired in homodimer formation and presents a significantly more stable protein compared to wild type Gcn4p. A helix breaker substitution in Leu253 results in a transcriptionally inactive, but highly stable protein variant. This is due to a feedback circuit between transcriptional activity of Gcn4p and its own stability, which depends on the Gcn4p-controlled cyclin Pcl5p. Gcn4pL253G reduces the expression of Pcl5p and therefore its own degradation. Hac1p plays an important role in the yeast UPR system and represents a bZIP transcription factor, alike Gcn4p. This work presents first evidence for a so far unknown function of Hac1p in the GAAC. Hac1p is not only able to activate Gcn4p specific target genes, but also FLO11 expression is reduced in yeast cells deleted for HAC1 and diploids can neither grow adhesively when starved for amino acids nor develop pseudohyhae upon nitrogen starvation. Promoter analysis of FLO11 identified a promoter element influenced by both, Hac1p and Gcn4p, in response to amino acid starvation that was previously identified to confer regulation by amino acid starvation. Transcription factor specific stress situations result in repression of the respective antagonist. First results indicate novel evidence in Hac1p regulation, which might be of clinical interest due to the involvement of the UPR system in tumorogenesis in mammal ian.
Keywords: yeast; Saccharomyces cerevisiae; adhesion; Gcn4p; Hac1p; transcription factor; GAAC; UPR

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In der Bäckerhefe Saccharomyces cerevisiae existieren zwei gut erforschte Signalwege, die ‘Allgemeine Kontrolle der Aminosäurebiosynthese’ (GAAC) und die ‘Antwort auf ungefaltete Proteine’ (UPR), die im Vergleich zu Säugetieren zwar nicht essentiell, aber für die Hefe dennoch von großer Bedeutung sind, um sich an unterschiedliche Umwelt- und Stressbedingungen anzupassen. Der bZIP Transkriptionsfaktor Gcn4p ist der zentrale Regulator der GAAC und aktiviert unter Aminosäuremangel die Transkription vieler Gene aus Aminosäure- und Purinbiosynthesewegen. Des Weiteren ist Gcn4p an der Regulation des Zellwandproteins Flo11p beteiligt, das sowohl für das diploide Pseudohyphenwachstum, als auch für das adhäsive Wachstum unter Nährstoffmangel erforderlich ist. Diese doppelte Funktion als metabolischer und Entwicklungsaktivator konnte durch eine Gcn4p Variante getrennt werden, welche eine einzige Aminosäuresubstitution im Leucin-Zipper aufweist, Gcn4pL267S. Diese Mutation führt dazu, dass die FLO11 Expression zwar unterdrückt wird, aber die transkriptionelle Aktivität für die Induktion der Aminosäurebiosynthesegene ausreicht. Gcn4pL267S beeinträchtig die Homodimerbildung und stellt, verglichen zum Wildtyp-Protein, ein stabileres Protein dar. Der Austausch von Leu253 gegen einen Helixbreaker führt zu einem inaktiven, aber sehr stabilen Transkriptionsfaktor. Dies ist auf eine Feedback-Regulation zurückzuführen, in der Gcn4p an der Regulation von Pcl5p beteiligt ist, welches wiederum für den Abbau von Gcn4p benötigt wird. Da Gcn4pL253G nicht in der Lage ist, Pcl5p zu aktivieren, unterdrückt es folglich seinen eigenen Abbau. Hac1p gehört wie Gcn4p zu der Gruppe der bZIP Transkriptionsfaktoren und nimmt eine wichtige Rolle im UPR System der Hefe ein. Die Ergebnisse dieser Arbeit weisen auf eine bisher unbekannte Rolle von Hac1p im Netzwerk der GAAC hin. Hac1p ist nicht nur in der Lage Gcn4p spezifische Zielgene zu aktivieren, sondern ist auch an der Regulation von Flo11p beteiligt. Aufgrund der reduzierten FLO11 Expression können diploide hac1-Deletionsstämme weder unter Aminosäuremangel adhäsiv wachsen, noch unter Stickstoffmangel Pseudohyphen ausbilden. Analysen des FLO11 Promotors weisen auf ein Promotorelement hin, dass von Hac1p und Gcn4p unter Aminosäuremangel beeinflusst wird. Für dieses Element wurde schon zuvor eine Aminsäuremangel-abhängige Funktion beschrieben. Spezifische Stresssituationen des jeweiligen Transkriptionsfaktor bewirken die Repression des jeweils anderen. Erste Ergebnisse deuten auf neue Erkenntnisse bzgl. der Hac1p Regulation hin, die von klinischem Interesse sein könnte, da das UPR System auch an der Tumorentwicklung in Säugern beteiligt ist.
Schlagwörter: Hefe; Saccharomyces cerevisiae; Adhäsion; Gcn4p; Hac1p; Transkriptionsfaktor; GAAC; UPR
 

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