Beziehungen zwischen der Chromatinstruktur und Apoptose-bedingter DNA-Fragmentierung

Abstract

Während des programmierten Zelltods (=Apoptose) kommt es zur Bildung von DNA-Fragmenten unterschiedlicher Größe. Ziel der vorliegenden Arbeit war es, die Fragmentierung des Chromatins während der Apoptose zu untersuchen, um Erkenntnisse über den zeitlichen und räumlichen Ablauf und die Zusammenhänge zwischen der Apoptose-bedingten Chromatinfragmentierung und der Chromatinstruktur zu gewinnen. Zur Untersuchung der Apoptose-bedingten Fragmentierung des Chromatins wurden verschiedene Zellinien, Induktoren mit Wirkung auf die verschiedenen Apoptose-Signalwege, die Anreicherung von apoptotischen Zellen durch magnetische Separation, die Induktion der Apoptose auf verschiedenen Stufen des Signalwegs, "in vitro"-Assays mit isolierten Kernen sowie die vorherige Synchronisierung der Zellen in Kombination mit einem Zellzyklus-Phasen-spezifischen Apoptose-Induktor getestet, etabliert und optimiert. Die Fragmentierung der DNA wurde sowohl im Vergleich funktionell verschiedener Chromatinregionen (Zentromer/Telomer/LINE/SINE-Elemente), als auch im Detail in einer Modellregion, dem Histongencluster auf Chromosom 6 untersucht.