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Synthese des dansylierten Park-Nucleotids und vereinfachter Analoga der Muraymycin-Antibiotika

dc.contributor.advisorDucho, Christian Prof. Dr.
dc.contributor.authorWohnig, Stephanie
dc.date.accessioned2014-04-24T08:49:09Z
dc.date.available2014-04-24T08:49:09Z
dc.date.issued2014-04-24
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0022-5E95-0
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-4466
dc.description.abstractDie Umsetzung des Park-Nucleotids zu Lipid I in der bakteriellen Zellwandbiosynthese wird durch das Enzym MraY katalysiert. Dieses Enzym ist ein interessantes, bisher ungenutztes Target für neuartige Antibiotika. In der vorliegenden Dissertation wurde das fluoreszenzmarkierte Park-Nucleotid, welches für MraY-Assays geeignet ist, totalsynthetisch dargestellt. Die Synthese konnte ausgehend von kommerziell erhältlichem N-Acetylglucosamin in 14 Stufen mit einer Gesamtausbeute von 4 % erfolgreich durchgeführt werden. Dabei wurden einige Schritte auf Basis einer literaturbekannten Synthese gründlich optimiert und neue Wege zur Darstellung des Peptids und anschließender Kupplung mit einem Kohlenhydrat Baustein gefunden. Im Zuge dieser neuen Syntheseroute wurde die Uridindiphosphat-N-Acetylmuraminsäure, als Substrat für MurC-Assays, synthetisiert. Dies gelang in einer achtstufigen Synthese ausgehend von der geschützten N-Acetylmuraminsäure in einer Gesamtausbeute von 15 %. Die Muraymycine, eine Klasse von natürlichen Nucleosid-Antibiotika, inhibieren das Enzym MraY effizient. In dieser Dissertation wurde der Grundstein für die Synthese möglichst vielfältiger vereinfachter Muraymycin Analoga gelegt, welche potentielle Inhibitoren für MraY darstellen. Die Harnstoffpeptidseitenkette wurde variiert, um den Einfluss dieses Strukturbausteins auf die Inhibitor-Aktivität intensiver untersuchen zu können. Der Ersatz der anspruchsvoll zu synthetisierenden Aminosäure Epicapreomycidin durch die kommerziell erhältlichen Aminosäuren L-Lysin, L-Ornithin, L-Arginin, L-Alanin und L-Methionin konnte die Synthese der Harnstoffpeptidkette stark vereinfachen. Des Weiteren wurde durch eine stereospezifische Synthese die geschützte 2S,3S-Diaminohexansäure dargestellt, um das in den natürlichen Muraymycinen enthaltene L-Hydroxyleucin, welches häufig mit einer Fettsäure verestert ist, zu ersetzten. Dieses sollte durch den Austausch einer Esterbindung durch eine Amidbindung zu einer Stabilisierung der Muraymycin Derivate führen. Unter Verwendung des in dieser Dissertation beschriebenen Lysin-haltigen Harnstoffpeptids wurden vor kurzen vereinfachte Muraymycin-Analoga synthetisiert und IC50 Werte mittels eines fluoreszenzbasierten MraY-Assays bestimmt. Diese stark vereinfachten Verbindungen weisen bereits gute Inhibitor Aktivitäten auf. Durch die Kombination der verschiedenen, in dieser Arbeit synthetisierten Harnstoffpeptide und Aminosäuren mit unterschiedlichen Uridinderivaten kann zukünftig eine große Anzahl diverser potentieller Inhibitoren dargestellt werden.de
dc.language.isodeude
dc.publisherNiedersächsische Staats- und Universitätsbibliothek Göttingende
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/
dc.subject.ddc540de
dc.titleSynthese des dansylierten Park-Nucleotids und vereinfachter Analoga der Muraymycin-Antibiotikade
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedSynthesis of dansylated Park's Nucleotide and simplified Analogs of Muraymycin Antibioticsde
dc.contributor.refereeDucho, Christian Prof. Dr.
dc.date.examination2013-12-17
dc.description.abstractengThe conversion of Park's nucleotide to Lipid I in the bacterial cell wall biosynthesis is catalyzed by the enzyme MraY. This enzyme is an interesting target for new antibiotics. In the present thesis a total synthesis of fluorescence mediated Park's nucleotide, for MraY assays, is presented. The synthesis starts with commercial available N-acetylglucosamine and leads in 14 steps in a total yield of 4 % to the desired product. This synthetic route based partially on a published synthesis of Park's nucleotide, where many steps needed to be optimized. New methods for the synthesis of the peptide chain and subsequently coupling with a carbohydrate building block were investigated. As part of this synthetic route uridine diphosphate N-acetylmuramic acid, as a substrate for MurC assays, was prepared in 8 steps starting from protected N-acetylmuramic acid with a total yield of 15 %. The muraymycins, a class of natural nucleoside antibiotics, inhibit MraY efficiently. In this thesis the basis of the synthesis of various simplified muraymycin analogs were laid. The ureapeptide chain was varied to determine the influence on inhibitor activity of this building block. Replacing the complex amino acid epicapreomycidine by the commercial available amino acids L-lysine, L-ornithine, L-arginine, L-alanine and L-methionine simplifies the synthesis of the ureapeptide chain a lot. Furthermore a stereospecific synthesis of protected 2S,3S-diamino hexanoic acid is described herein. This amino acid should replace L-hydroxy leucine, which can be found in natural muraymycins often esterified with a fatty acid. This should lead to more stable muraymycin analogs with an amide bond replacing the ester bond. Recently the L-lysine containing ureapeptide, described in this thesis, was used to synthesize different muraymycin derivatives. The inhibitor activities of these compounds were determined by a fluorescence based MraY assay. A big amount of diverse potential inhibitors could be obtained per combination of different, in this thesis synthesized ureapeptides and amino acids with various uridine derivatives.de
dc.contributor.coRefereeDiederichsen, Ulf Prof. Dr.
dc.subject.gerAntibiotikade
dc.subject.gerZellwandbiosynthesede
dc.subject.gerNaturstoffede
dc.subject.gerOrganische Synthesede
dc.subject.gerPeptidede
dc.subject.gerKohlenhydratede
dc.subject.gerNucleotidede
dc.subject.gerHarnstoffede
dc.subject.engAntibioticsde
dc.subject.engCell Wall Biosynthesisde
dc.subject.engNatural Productsde
dc.subject.engOrganic Synthesisde
dc.subject.engPeptidesde
dc.subject.engCarbohydratesde
dc.subject.engNucleotidesde
dc.subject.engUreasde
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-11858/00-1735-0000-0022-5E95-0-9
dc.affiliation.instituteFakultät für Chemiede
dc.subject.gokfullChemie  (PPN62138352X)de
dc.identifier.ppn783821557


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