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Host-parasite interaction between the potato tuber rot nematode (Ditylenchus destructor), stem nematode (Ditylenchus dipsaci) and potato

dc.contributor.advisorVidal, Stefan Prof. Dr.
dc.contributor.authorMutua, Peter Mwaura
dc.date.accessioned2015-03-18T09:15:08Z
dc.date.available2015-03-18T09:15:08Z
dc.date.issued2015-03-18
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0022-5F85-C
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-4986
dc.description.abstractZUSAMMENFASSUNG Nematoden rufen weltweit erhebliche Verluste in der Kartoffelproduktion hervor. Der Knollenfäule-Nematode Ditylenchus destructor Thorne 1945 und das Stock-und Stangelälchen Ditylenchus dipsaci Kühn 1857 Filipjev, 1936, verursachen Läsionen an der Kartoffelknolle, was deren Qualität und Marktwert verringert. Diese Nematoden sind aufgrund ihres umfangreichen Wirtspflanzenspektrums schwierig zu kontrollieren und werden daher in vielen Ländern als Quarantäne-Nematoden geführt. In der hier vorliegenden Doktorarbeit wurden Experimente durchgeführt, um die Wechselwirkung von Kartoffel mit jeder dieser beiden Nematodenarten zu untersuchen. Verschiedene Populationen von D. destructor und D. dipsaci wurden molekular und morphometrisch charakterisiert. Die Gensequenz kodierend für die Untereinheit I der Cytochrom Oxidase (COI) auf der mitochondrialen DNA (mtDNA) wurde analysiert, um eine phylogenetische Beziehung zwischen den untersuchten Populationen darzustellen. Die Ergebnisse zeigten zwei deutlich getrennte Cluster für die D. destructor und die D. dipsaci Populationen. Eine Diskriminanzanalyse der morphometrischen Daten von Männchen und Weibchen von D. destructor und D. dipsaci Populationen verdeutlichte, dass diese beiden Arten mittels a-ratio und ihrem Durchmesser unterschieden werden können. Die sich ergänzende Kombination von molekularen und morphometrischen Untersuchungen ermöglichte die Identifikation der untersuchten Arten. Es wurden zwei Gewächshausexperimente mit 25 angebauten Kartoffelsorten durchgeführt, um diese auf Resistenz und Toleranz gegenüber Nematoden zu testen. Dazu wurde ein Standard-Screening Protokoll entwickelt. Resistenz und Toleranz wurden gemäß der derzeitigen Definition (Nematologie) bewertet. Die relative Anfälligkeit und äußere Verletzung der Kartoffelknolle stellten sich als beste Parameter für die Beurteilung der Resistenz respektive der Toleranz heraus. Alle 25 untersuchten Kartoffelsorten waren weder resistent noch tolerant gegenüber D. destructor oder D. dipsaci. Jedoch wurden Unterschiede in der Toleranz der Sorten festgestellt. Im Vorfeld zum Pflanzenexperiment wurden die Populationsdichten von D. destructor und D. dipsaci und deren Einfluss auf Ertragsverlust untersucht. Die initiale Populationsdichte hatte einen signifikanten Effekt auf den Schaden an der Kartoffelknolle und den Fortpflanzungsfaktor der Nematoden unter Gewächshausbedingungen. D. destructor verursachte Schäden bereits bei einer geringeren initialen Populationsdichte als D. dipsaci. Unter Klimakammerbedingungen wurde gezeigt, dass die Temperatur Einfluss auf die Schadensrate von D. destructor und D. dipsaci an Kartoffelknollen nimmt. Im Gegensatz zu einer Temperatur von 16°C waren 26°C sowohl optimal für die Vermehrung von D. destructor als auch für D. dipsaci. Obwohl für D. destructor und D. dipsaci unterschiedliche Temperaturanforderungen beschrieben wurden, verursachten beide Arten in ähnlichen Temperaturbereichen äußere Verletzungen an der Kartoffelknolle. Beauveria bassiana ist ein weltweit verbreiteter Pilz, der vor allem zur Bekämpfung von Insektenschädlingen in der Kartoffelproduktion Anwendung findet. Doppelbefall von Kartoffeln mit B. bassiana Sporensuspensionen im Boden mit D. destructor oder D. dipsaci begünstigte die Nematoden, was zu einer erhöhten Nematodenfortpflanzung und Knollenbeschädigung führte. B. bassiana allein war nicht schädlich für die Kartoffel. Es wurde vermutet, dass B. bassiana eine indirekte Rolle in der Wechselwirkung Nematode-Kartoffel spielt. Vorschläge für zukünftige Experimente werden angebracht, die einen weiteren Beitrag zu den hier vorgestellten Studien leisten können.de
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/
dc.subject.ddc630de
dc.titleHost-parasite interaction between the potato tuber rot nematode (Ditylenchus destructor), stem nematode (Ditylenchus dipsaci) and potatode
dc.typecumulativeThesisde
dc.contributor.refereeHallmann, Johannes Prof. Dr.
dc.date.examination2015-02-02
dc.description.abstractengNematodes are among important pest constraints influencing potato production worldwide. The tuber rot nematode, Ditylenchus destructor Thorne 1945, and the stem nematode, Ditylenchus dipsaci (Kühn, 1857) Filipjev, 1936, cause lesions on potato tubers degrading their quality and market value. These nematodes are difficult to control due to their wide host range and therefore are listed as quarantine nematodes in many countries. In this PhD thesis, experiments were conducted to investigate the interaction between potato and each of these nematode species. Molecular and morphometric characterization of different populations of D. destructor and D. dipsaci were studied. Sequence analysis of the cytochrome oxidase subunit I (COI) gene located on the mitochondrial DNA (mtDNA) was used to develop a phylogenetic relationship of the studied populations. The results demonstrated two highly supported clades containing D. destructor populations and the other D. dipsaci populations. The discriminant function analysis (DFA) of the morphometric data of males and females of D. destructor and D. dipsaci populations revealed that these species could be separated using the a-ratio and the highest body width. The combination of both methods molecular and morphometric methods complemented the identity of the species under study. Two greenhouse experiments were performed to evaluate sources of resistance and tolerance to D. destructor and D. dipsaci in 25 cultivated potato varieties. A standard screening protocol for resistance and tolerance to D. destructor and D. dipsaci was developed. Resistance and tolerance was evaluated based on the current definition of these terms in nematology. Relative susceptibility (RS) and external potato tuber damage were found to be the best methods for resistance and tolerance evaluation respectively. Potato varieties tested were not resistant or tolerant against D. destructor or D. dipsaci. However, some varieties were more tolerant than others. Pre-plant densities of D. destructor and D. dipsaci and their impact on yield loss were also assessed. Initial population densities of D. destructor and D. dipsaci had significant influence on potato tuber damage and nematodes reproduction factor under greenhouse conditions. Damage caused by D. destructor started at a lower initial population density compared to that caused by D. dipsaci. Influence of temperature on D. destructor and D. dipsaci population density and their impact on tuber damage was studied under climate chambers. Temperature influenced the nematodes population dynamics and consequently levels of potato tuber damage caused by D. destructor and D. dipsaci. Temperature of 26°C was optimal for both D. destructor and D. dipsaci multiplication compared to 16°C. Although D. destructor and D. dipsaci are reported to have different temperature requirements, both species caused external potato tuber damage at similar temperature ranges. Beauveria bassiana is a cosmopolitan fungus used mainly in the management of insect pests in potato production. Dual infestation of potatoes with spore suspensions of B. bassiana in the soil together with D. destructor or D. dipsaci benefited the nematodes, thus leading to increased nematodes reproduction and tuber damage. B. bassiana on its own was not harmful to potato. It was hypothesized that B. bassiana played an indirect role in the nematode-plant interaction. In order to add value, experiments are suggested which might help to give detailed mechanisms involved during the nematode-B. bassiana-plant interactionsde
dc.contributor.coRefereeTiedemann, Andreas von Prof. Dr.
dc.subject.gerDitylenchus destructorde
dc.subject.gerDitylenchus dipsacide
dc.subject.gerBeauveria bassianade
dc.subject.gerPotato varietiesde
dc.subject.gerPotato external and internal tuber damagede
dc.subject.gerInitial population densitiesde
dc.subject.engDitylenchus destructorde
dc.subject.engDitylenchus dipsacide
dc.subject.engBeauveria bassianade
dc.subject.engPotato varietiesde
dc.subject.engPotato external and internal tuber damagede
dc.subject.engInitial population densitiesde
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-11858/00-1735-0000-0022-5F85-C-8
dc.affiliation.instituteFakultät für Agrarwissenschaftende
dc.subject.gokfullLand- und Forstwirtschaft (PPN621302791)de
dc.identifier.ppn820537993


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