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Scale effects on genomic modelling and prediction

dc.contributor.advisorSimianer, Henner Prof. Dr.
dc.contributor.authorBerger, Swetlana
dc.date.accessioned2015-08-24T09:37:56Z
dc.date.available2015-08-24T09:37:56Z
dc.date.issued2015-08-24
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0022-6086-8
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-5230
dc.description.abstractIn dieser Arbeit wird eine neue Methode für den skalenunabhängigen Vergleich von LD-Strukturen in unterschiedlichen genomischen Regionen vorgeschlagen. Verschiedene Aspekte durch Skalen verursachter Probleme – von der Präzision der Schätzung der Marke-reffekte bis zur Genauigkeit der Vorhersage für neue Individuen - wurden untersucht. Darüber hinaus, basierend auf den Leistungsvergleichen von unterschiedlichen statistischen Methoden, wurden Empfehlungen für die Verwendungen der untersuchten Methoden gege-ben.de
dc.description.abstractIn dieser Arbeit wird eine neue Methode für den skalenunabhängigen Vergleich von LD-Strukturen in unterschiedlichen genomischen Regionen vorgeschlagen. Verschiedene Aspekte durch Skalen verursachter Probleme – von der Präzision der Schätzung der Marke-reffekte bis zur Genauigkeit der Vorhersage für neue Individuen - wurden untersucht. Darüber hinaus, basierend auf den Leistungsvergleichen von unterschiedlichen statistischen Methoden, wurden Empfehlungen für die Verwendungen der untersuchten Methoden gegebende
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject.ddc630de
dc.titleScale effects on genomic modelling and predictionde
dc.typedoctoralThesisde
dc.contributor.refereeBickeböller, Heike Prof. Dr.
dc.date.examination2015-02-03
dc.description.abstractengIn this thesis, a novel method for scale corrected comparisons of LD structure in different genomic regions is suggested. Several aspects of scale-caused problems – from precision of marker effect estimates to accuracy of predictions for new individuals - are investigated. Furthermore, based on a comparison of the performance of different approaches, recommendations on the application of examined methods are given.de
dc.contributor.coRefereeGertheiß, Jan Prof. Dr.
dc.subject.engWhole-Genome Regressionde
dc.subject.enggenetic architecturede
dc.subject.engaccuracy of genomic predictionsde
dc.subject.engLinkage Disequilibriumde
dc.subject.engsimulation techniquesde
dc.subject.engmulticollinearityde
dc.subject.engLD structurede
dc.subject.engprecision of estimatesde
dc.subject.engBayesian hierarchical modelde
dc.subject.engcomparison of LD structure in genomic regionsde
dc.subject.engArabidopsisde
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-11858/00-1735-0000-0022-6086-8-2
dc.affiliation.instituteFakultät für Agrarwissenschaftende
dc.subject.gokfullLand- und Forstwirtschaft (PPN621302791)de
dc.identifier.ppn833807455


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