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Community structure of Arbuscular Mycorrhizal Fungi in temperate grassland and tropical land-use systems

dc.contributor.advisorPolle, Andrea Prof. Dr.
dc.contributor.authorEdy, Nur Dr.
dc.date.accessioned2015-08-31T08:56:37Z
dc.date.available2015-08-31T08:56:37Z
dc.date.issued2015-08-31
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0022-608C-B
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-5238
dc.description.abstractFast alle Pflanzen in den gemäßigten und tropischen Klimazonen gehen eine symbiontische Beziehung mit Mykorrhizapilzen ein. Studien über die Symbiose von Mykorrhizen konzentrieren sich vor allem auf die gemäßigten Klimazonen der Erde und nur wenige Informationen über tropische Landnutzungssysteme stehen zur Verfügung. Die Assoziation von Pflanzenwurzel und arbuskulären Mykorrhizapilzen (AMF) ist von wesentlicher Bedeutung, da der Pilz eine Schlüsselrolle für die Funktionsfähigkeit und Nachhaltigkeit von Ökosystemen einnimmt. Es wurden zwei Experimente durchgeführt, um die Gesellschaften von AMF zu untersuchen, eines in der gemäßigten Klimazone in einem Dauergrünland im Solling, Deutschland und das andere in tropischen Transformationssystemen auf Sumatra, Indonesien. Das Ziel des Experiments im Grünland war es festzustellen, ob es Unterschiede in der Zusammensetzung von AMF-Gesellschaften gibt, die durch verschiedene Flächenbewirtschaftungen und Herbivorie verursacht werden. Es wurde angenommen, dass (i) Düngung die AMF-Gesellschaftszusammensetzung verändert und der AMF-Artenreichtum herabgesenkt werden kann, (ii) regelmäßiges Mähen und Herbivorie potentiell zur Reduzierung von photosynthetischem Kohlenstoff in den Pflanzengeweben führt. Da die AMF auf die Kohlenstoffzufuhr durch ihre Wirtspflanzen angewiesen sind, gehen wir davon aus, dass Herbivorie und Mähen die AMF-Abundanz senkt, (iii) bisher ist der Zusammenhang zwischen AMF-Gesellschaften und pflanzlicher Diversität unklar. Wir erwarten, dass die Manipulation des Artenreichtums der Graslandvegetation negativen Einfluss auf die AMF-Abundanz hat. Im zweiten Experiment sollte der Einfluss der Umwandlung von Tieflandregenwald in Kautschuk- und Ölpalmplantagen auf die Struktur von AMF-Gesellschaften untersucht werden. In dieser Studie wurde angenommen, dass die veränderte Landnutzung hingehend zu intensive bewirtschafteten Plantagen einhergeht mit einem Verlust des AMF-Artenreichtums und dass die AMF-Gesellschaftszusammensetzung verändert wird. Die Graslandvegetation wurde durch die Anwendung von Herbiziden gegen entweder dikotyle oder monokotyle Pflanzen verändert um Unterschiede im Artenreichtum in den Flächen zu erlangen. Die so entstandenen unterschiedlichen Grünflächen wurden dann unterschiedlich durch Mähen, Düngung und dem Aussetzen von Fraßfeinden behandelt. Die Studie war ein Feldexperiment mit Latin Rectangle Design. Es beinhaltete drei Behandlungsfaktoren: Grünflächentyp, Anwendung und Nährstoffe. Der Faktor Grünflächentyp war durch drei Ausprägungen vertreten (unbehandelte Kontrollflächen [species richness], Flächen mit Reduktion von Dikotylen [monocots] und Flächen mit reduzierter Anzahl von Monokotylen [dicots]). Der Faktor Anwendung hatte zwei Level: einmalig gemäht und dreimal gemäht. Der Faktor Nährstoffe wurde ebenfalls durch zwei Level vertreten, zum einen durch die Düngung mit NPK und zum anderen durch den Verzicht auf Düngung. Um die AMF-Kolonisierung zu betrachten, wurde die relative Kolonisierungsrate durch Hyphen, die relative Abundanz von Vesikeln, sowie die relative Abundanz von Arbuskeln analysiert. Die Diversität von AMF OTUs (Operational Taxonomic Units) wurde anhand der Amplifikation der rDNA Region zum Sanger-Sequenzieren bestimmt. Die Ergebnisse zeigen, dass die Hyphenkolonisierungsrate nicht durch die verschiedenen Flächenbewirtschaftungen beeinflusst wurde. Dünung als Einzelfaktor hat die relative Abundanz von Arbuskeln und Vesikeln sowie die AMF-Diversität signifikant herabgesetzt. Der Shannon Index für Diversität (H’) zeigt, dass ungedüngte Flächen diversere AMF OTUs aufweisen als gedüngte Flächen. Die relative AMF-Abundanz wurde nicht durch das Entfernen oberirdischer Pflanzenbiomasse, in Form von regelmäßigem Mähen und Herbivorie, beeinflusst. Auch die verschieden artenreichen Graslandvegetationen haben keinen Einfluss auf die relative AMF-Abundanz gezeigt. Dennoch hat die Interaktion von Grünflächentyp, Dünung und Schnittfrequenz zu einer signifikanten Veränderung der relativen Abundanz von Vesikeln und Arbuskeln geführt. Es wurden AMF OTUs innerhalb dreier Familien der Glomeromycota gefunden: Glomeraceae, Claroideoglomeraceae, und Archaeosporaceae wobei Glomus sp. am häufigsten gefunden wurde. Diese Ergebnisse weisen darauf hin, dass Dünung ein dominanter Faktor für die Veränderungen von AMF-Gesellschaften in Graslandvegetationen sein könnte. Das zweite Experiment wurde in zwei Landschaften auf Sumatra, Indonesien durchgeführt, zum einen im Gebiet des Bukit Duabelas Nationalpark und zum anderem im Gebiet des Harapan Regenwalds. Die AMF-Artenabundanz in Wurzeln wurden untersucht, indem partielle rDNA-Fragmente amplifiziert wurde. Um die dazugehörigen Wirtspflanzenart zu identifizieren, wurde die pflanzliche DNA mit Hilfe der Marker rbcL und matK bestimmt. Es wurden insgesamt 112 Einzelwurzeln untersucht und 39 AMF OTUs gefunden. Die Rarefaction-Analysen zeigen, dass die Anzahl analysierter AMF Sequenzen pro Probenahmestelle ausreichend waren, um eine Aussage über die AMF-Diversität in den Wurzeln der Landnutzungssysteme treffen zu können. Die pflanzliche DNA konnte mit dem rbcL Marker identifiziert werden, während der matK Marker keine zufriedenstellenden Ergebnisse lieferte. Es wurden 20 AMF Wirtspflanzen in Bukit Duabelas beziehungsweise 31 in Harapan gefunden. Die Diversitätsindizes zeigen, dass durch die Umwandlung von Regenwald in Ölpalm- und Kautschukplantagen der Artenreichtum von AMF signifikant verringert wird. Der Effekt der Landnutzung wurde mithilfe von PERMANOVA ermittelt und zeigte, dass unterschiedliche Landschaften und Plots die Zusammensetzung der AMF-Gesellschaften signifikant beeinflussen. Dieser Effekt kann durch Umweltfaktoren erklärt werden. Es konnte gezeigt werden, dass die Struktur der AMF-Gesellschaften in Verbindung stehen mit Kohlenstoff-, Stickstoff- und Aluminiumkonzentration der Wurzeln sowie mit dem pH-Wert der BÖden. Im Gegensatz dazu, hat der Phosphorgehalt der Wurzeln keinen signifikanten Einfluss auf die Struktur der AMF-Gesellschaften. Die Ergebnisse dieser Studien zeigen klar den Einfluss von spezifischer Flächenbewirtschaftung in Grünflächen der gemäßigten Zone sowie den der Umwandlung des tropischen Regenwaldes zu intensiv bewirtschafteten Plantagen. Die Untersuchungsgebiete des Dauergrünlandes in der gemäßigten Klimazone und der Transformationssysteme des Regenwaldes in den Tropen enthalten genügend Umweltfaktoren, um viele Effekte von Flächenbewirtschaftung und Landnutzungsveränderungen auf die Zusammensetzung von AMF-Gesellschaften zu erklären.de
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject.ddc634de
dc.titleCommunity structure of Arbuscular Mycorrhizal Fungi in temperate grassland and tropical land-use systemsde
dc.typedoctoralThesisde
dc.contributor.refereePolle, Andrea Prof. Dr.
dc.date.examination2015-07-20
dc.description.abstractengMost plants in temperate and tropical regions form symbiotic association with mycorrhizal fungi. Studies on mutualistic association of mycorrhiza focus mainly on temperate regions of the world, whereas little information is available from the tropical land use systems. Associations between plant root and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) are essential components of ecosystems where the fungus plays a key role in the functioning and sustainability of the ecosystems. We conducted two experiments in a permanent temperate grassland in the Solling, Germany, and transformation systems in Sumatra, Indonesia, to examine the communities of AMF. The objective of the grassland experiment was to determine the changes within AMF community composition caused by management practices and herbivores. We hypostasized that: (i) fertilization will change the community composition the AMF and may reduce the species rich, (ii) frequent utilization by mowing and herbivore will potentially reduce the photosynthetic carbon in plant tissue. Since AMF required the carbon from their plant host, we expect that mowing and herbivore will decrease the AMF abundance (iii) AMF communities, so far, had unclear relation to the plant diversity. We expected that manipulating sward species richness will have negative impact on the AMF abundance. In the second experiment, we aimed to investigate the impact of transformation of tropical lowland rain forest into managed rubber tree and oil palm plantations on AMF community structure. The postulated hypothesis stated that land-use change into intensive agro plantations will reduce the AMF species richness and alter its community composition. We manipulated grassland vegetation by applying herbicides against either monocots or dicots to modify the swards species composition. The resulting swards were then treated with mowing and fertilizer, and herbivores were allowed to feed on the grass. The study was field experiment with Latin Rectangle design. It includes three treatment factors: sward type, utilization, and nutrients. Sward type consisted of three levels: untreated control sward (species-rich), dicots reduced (monocots-dominated), and monocots reduced (dicots- dominated). Utilization consisted of two levels: mowed once and mowed three times, whereas nutrients consisted of two levels: with and without nitrogen, phosphorus, and potassium. To assess the AMF colonization rate, the relative hyphal colonization rate, the relative abundance of arbuscules, and the relative abundance of vesicles were analyzed. The diversity of the AMF operational taxonomic units (OTUs) were analyzed by amplification of the rDNA region using Sanger sequencing method. Our results showed that hyphal colonization rate of arbuscular mycorrhizal fungi were not affected by management practices. Fertilization as a single factor significantly reduced the relative abundances of arbuscule and vesicle and decreased the AMF diversity. The Shannon diversity index (H’) indicated that unfertilized swards had more diverse AMF OTUs compared to fertilized plots. The relative abundance of AMF was not affected by removing plant aboveground biomass through mowing frequency and herbivores. We also found that different species rich sward did not impact the relative abundance of AMF. However, the interaction between sward, fertilization, and cutting frequency significantly changed the relative abundance of arbuscule and vesicle. AMF OTUs belonged to three families of Glomeromycota: Glomeraceae, Claroideoglomeraceae, and Archaeosporaceae and Glomus sp. was the most abundant among the AMF. These results suggested that fertilization is a dominant factor in changing the AMF community in grassland vegetation. The second set of experiments was carried out in two landscapes in the Bukit Duabelas National Park and Harapan Rainforest in Sumatra, Indonesia. The AMF species abundance in the roots was investigated by amplifying a partial rDNA fragment, and AMF host plant species were identified using DNA barcoding with markers rbcL and matK. A total of 112 single roots were analyzed and 39 AMF OTUs were detected. The rarefaction analysis indicated that the number of sequences analyzed per sampling site was sufficient to cover AMF diversity in the roots per land use system. Plant DNA barcoding was successful with rbcL marker, whereas matK had low species identification efficiency. We found 20 and 31 AMF host plant species in Bukit Duabelas and Harapan, respectively. Diversity indices showed that conversion of forest to oil palm and rubber tree plantations significantly decreased the AMF species richness. However, none of the AMF OTUs had strong host specificity. The effect of land use was determined by permutational multivariate analysis of variance, showing that different landscapes and plots significantly influenced the community composition of AMF, which effect was explained by environmental factors. We found that AMF community structures were related to C, N, and Al concentrations in roots and soil pH. In contrast, P concentration in roots did not significantly affect the AMF community structure. The results presented here clearly demonstrate the influence of management practices in temperate grassland and conversion of tropical forest into agro plantation on the AMF community structure. The study area in temperate grassland and transformation systems of tropical lowland rain forest covers sufficient environmental factors to explain multiple effects of management practice and land-use change on AMF community composition.de
dc.contributor.coRefereeKreft, Holger Prof. Dr.
dc.contributor.thirdRefereeEdy, Nur
dc.subject.gerEnglishde
dc.subject.engEcologyde
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-11858/00-1735-0000-0022-608C-B-0
dc.affiliation.instituteFakultät für Forstwissenschaften und Waldökologiede
dc.subject.gokfullForstwirtschaft (PPN621305413)de
dc.identifier.ppn834204517


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