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dc.contributor.advisor Zafar, Saima Dr.
dc.contributor.author Tahir, Waqas
dc.date.accessioned 2017-05-17T08:56:53Z
dc.date.available 2017-05-17T08:56:53Z
dc.date.issued 2017-05-17
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0023-3E48-F
dc.description.abstract La maladie sporadique de Creutzfeldt-Jakob (sCJD) est une encéphalopathie spongiforme transmissible mortelle caractérisée par une large gamme de manifestations cliniques et pathologiques. Les caractéristiques pathologiques de la SDMC dépendent en grande partie de la présence d'une forme mal repliée de protéine prion cellulaire (PrPC); Connu sous le nom de PrPSC et polymorphisme (méthionine et valine) au codon 129 du gène PRNP qui code pour PrPC. Les facteurs étiologiques exacts de la MCSJ sont encore inconnus. Le génotype Codon 129 du gène PRNP et le type de PrPSC (type 1 ou type 2) influent sur l'hétérogénéité de la maladie telle que définie par des caractéristiques pathologiques spécifiques de la région qui peuvent réguler les voies moléculaires qui conduisent au développement de phénotypes pathogènes dépendants des sous-types. Dans cette étude, nous avons étudié l'ensemble de la réglementation protéomique dans la région cerebrale du cerveau des deux sous-types les plus répandus (MM1 et VV2) des patients atteints de SDMC utilisant une électrophorèse sur gel bidimensionnelle (2DE) et une spectrométrie de masse. L'analyse de toutes les taches de protéines sur les gels 2DE avec le logiciel DECODON Delta2D a révélé vingt-cinq taches de protéines différenciées et l'identification de ces taches avec MALDI-TOF MS / MS a révélé quatre-vingts trois protéines différentiellement réglementées dans les deux sous-types dans la région du cervebelle du cerveau par les patients atteints de sCJD. Quarante protéines dans le sous-type MM1 et quarante-trois protéines dans le sous-type VV2 ont été classées. Douze protéines étaient communément réglementées dans les deux sous-types, dont cinq d'entre elles présentaient une régulation expresnelle inverse et le repos sept avait une régulation expresnelle similaire dans les deux sous-types. Les trois principaux mécanismes moléculaires cellulaires réglementés dans les deux sous-types comprennent: i) le cycle cellulaire; L'expression des gènes et la mort cellulaire, ii) - la réponse au stress cellulaire / le stress oxydatif et iii) - la transduction du signal et les fonctions synaptiques La plupart des protéines sous la classification des réponses au stress cellulaire étaient associées aux fonctions moléculaires cellulaires liées au stress oxydatif. DJ-1 qui est un capteur bien connu de stress oxydatif, a également été jugé réglementé dans la catégorie des réponses au stress cellulaire. Le DJ-1 protège les cellules contre le stress oxydatif directement en translocant au noyau pour l'activation de gènes antioxydants et indirectement en activant la voie Nrf2 / ARE. Nos résultats expérimentaux ont démontré l'activation de la voie Nrf2 / ARE dans les sous-types MM1 et VV2 de sCJD. Le DJ-1 a également montré une régulation positive significative dans son expression de l'ARNm dans les sous-types MM1 et VV2 mais l'expression des protéines uniquement dans le sous-type VV2 dans le cervelet du cerveau des patients atteints de sCJD. En outre, l'expression de la protéine DJ-1 a également été augmentée au cours des stades pré-symptomatiques et symptomatiques dans le cervelet du cerveau des modèles de souris de sCJD (MM1 et VV2) et pendant le stade clinique dans les échantillons de CSF des patients atteints de SDMC. Ces résultats suggèrent l'implication du stress oxydatif lors de la pathophysiologie de la SDMC et l'utilisation de DJ-1 comme capteur potentiel de stress oxydatif pendant la phase clinique de la sCJD. de
dc.language.iso eng de
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject.ddc 570 de
dc.title Identification and characterization of proteomic regulations in the cerebellum region of brain in MM1 and VV2 subtypes of sporadic Creutzfeldt-Jakob disease (sCJD) de
dc.title.alternative Proteome Profiling of sCJD brain tissue de
dc.type doctoralThesis de
dc.contributor.referee Simons, Mikael Prof. Dr.
dc.date.examination 2016-06-02
dc.description.abstractger Sporadische Creutzfeldt-Jakob-Krankheit (sCJD) ist eine tödliche, transmissible spongiforme Enzephalopathie (TSE), die durch eine breite Palette von klinischen und pathologischen Manifestationen gekennzeichnet ist. Pathologische Merkmale von sCJD sind weitgehend abhängig von der Anwesenheit von fehlgefalteter Form von zellulärem Prionprotein (PrPC); Bekannt als PrPSC und Polymorphismus (Methionin und Valin) am Codon 129 des PRNP-Gens, das für PrPC kodiert. Exakte ätiologische Faktoren von sCJD sind noch unbekannt. Codon 129 Genotyp des PRNP-Gens und der Typ des PrPSC (Typ 1 oder Typ 2) beeinflussen die Heterogenität der Erkrankung, wie sie durch regionale spezifische pathologische Merkmale definiert werden, die möglicherweise die molekularen Pfade regulieren, die zur Entwicklung von Subtyp-abhängigen Krankheitsphänotypen führen. In dieser Studie haben wir die gesamte proteomische Regulation im Cerebellum-Bereich des Gehirns der beiden am häufigsten vorkommenden Subtypen (MM1 und VV2) von sCJD-Patienten mit zweidimensionaler Gelelektrophorese (2DE) und Massenspektrometrie untersucht. Die Analyse aller Proteinflecken auf 2DE-Gelen mit DECODON Delta2D-Software zeigte fünfundzwanzig unterschiedlich regulierte Proteinspots und die Identifizierung dieser Spots mit MALDI-TOF MS / MS zeigte achtzig drei differentiell regulierte Proteine ​​in beiden Subtypen im Cerebellum-Bereich des Gehirns von sCJD-Patienten. Vierzig Proteine ​​im MM1-Subtyp und dreiundvierzig Proteine ​​im VV2-Subtyp wurden reguliert. Zwölf Proteine ​​wurden häufig in beiden Subtypen reguliert, wobei fünf von ihnen zeigten eine inverse Expressionsregulation und Rest sieben zeigten eine ähnliche Expressionsregulation in beiden Subtypen. Top drei regulierte zelluläre molekulare Mechanismen in beiden Subtypen enthalten, i) - Zellzyklus; Genexpression und Zelltod, ii) - zelluläre Stressreaktion / oxidativer Stress und iii) - Signaltransduktion und synaptische Funktionen Die meisten Proteine ​​unter der Klassifikation von zellulären Stressreaktionen wurden mit oxidativen stressbedingten zellulären molekularen Funktionen assoziiert. DJ-1, ein bekannter Sensor von oxidativem Stress, wurde auch unter der Kategorie der zellulären Stressreaktionen reguliert. DJ-1 schützt die Zellen vor oxidativem Stress direkt durch Translokalisierung in den Zellkern zur Aktivierung antioxidativer Gene und indirekt durch Aktivierung des Nrf2 / ARE-Weges. Unsere experimentellen Ergebnisse zeigten die Aktivierung des Nrf2 / ARE-Weges in beiden MM1- und VV2-Subtypen von sCJD. DJ-1 zeigte auch eine signifikante Hochregulation in der mRNA-Expression sowohl in MM1- als auch in VV2-Subtypen, aber die Protein-Expression nur im VV2-Subtyp im Cerebellum des Gehirns von sCJD-Patienten. Darüber hinaus wurde auch festgestellt, dass die Expression von DJ-1-Proteinen während der prä-symptomatischen und symptomatischen Stadien des Gehirns des Gehirns von Mäusemodellen von sCJD (MM1 und VV2) und während der klinischen Phase in CSF-Proben von sCJD-Patienten ebenfalls erhöht wurde. Diese Ergebnisse deuten auf die Implikation von oxidativem Stress während der Pathophysiologie von sCJD und der Verwendung von DJ-1 als potentieller Sensor von oxidativem Stress während der klinischen Phase von sCJD hin. de
dc.description.abstracteng Sporadic Creutzfeldt–Jakob disease (sCJD) is a fatal, transmissible spongiform encephalopathy (TSE) characterized by broad range of clinical and pathological manifestations. Pathological features of sCJD are largely dependent on the presence of misfolded form of cellular prion protein (PrPC); known as PrPSC and polymorphism (methionine and valine) at codon 129 of PRNP gene that encodes PrPC. Exact etiological factors of sCJD are still unknown. Codon 129 genotype of PRNP gene and the type of PrPSC (type 1 or type 2) influence the heterogeneity of disease as defined by regional specific pathological features potentially regulating the molecular pathways which lead to development of subtype dependent disease phenotypes. In this study, we have investigated the whole proteomic regulations in cerebellum region of brain of the two most prevalent subtypes (MM1 and VV2) of sCJD patients using two dimensional gel electrophoresis (2DE) and mass spectrometry. Analysis of all protein spots on 2DE gels with DECODON Delta2D software, revealed twenty five differentially regulated protein spots and identification of these spots with MALDI-TOF MS/MS revealed eighty three differentially regulated proteins in both subtypes in cerebellum region of brain from sCJD patients. Forty proteins in MM1 subtype and forty three proteins in VV2 subtype were found regulated. Twelve proteins were commonly regulated in both subtypes with five of those showed inverse expressional regulation and rest seven showed similar expressional regulation in both subtypes. Top three regulated cellular molecular mechanisms in both subtypes included, i)- cell cycle; gene expression and cell death, ii)- cellular stress response/ oxidative stress and iii)- signal transduction and synaptic functions Most of the proteins under the classification of cellular stress responses, were associated with oxidative stress related cellular molecular functions. DJ-1 which is a well-known sensor of oxidative stress, was also found regulated under the category of cellular stress responses. DJ-1 protects the cells against oxidative stress directly by translocalizing to nucleus for activation of antioxidative genes and indirectly by activating the Nrf2/ARE pathway. Our experimental results demonstrated the activation of Nrf2/ARE pathway in both MM1 and VV2 subtypes of sCJD. DJ-1 also showed significant upregulation in its mRNA expression in both MM1 and VV2 subtypes but protein expression only in VV2 subtype in cerebellum of brain of sCJD patients. Furthermore, DJ-1 protein expression was also found to be increased during the pre-symptomatic and symptomatic stages in cerebellum of brain of mice models of sCJD (MM1 and VV2) and during the clinical stage in CSF samples of sCJD patients as well. These results suggest the implication of oxidative stress during the pathophysiology of sCJD and use of DJ-1 as a potential sensor of oxidative stress during the clinical phase of sCJD. de
dc.contributor.coReferee Hoppert, Michael PD Dr.
dc.contributor.thirdReferee Zerr, Inga Prof. Dr.
dc.subject.ger Sporadic Creutzfeldt–Jakob disease + cellular prion protein + two dimensional gel electrophoresis de
dc.subject.eng Sporadic Creutzfeldt–Jakob disease + cellular prion protein + two dimensional gel electrophoresis de
dc.identifier.urn urn:nbn:de:gbv:7-11858/00-1735-0000-0023-3E48-F-7
dc.affiliation.institute Biologische Fakultät für Biologie und Psychologie de
dc.subject.gokfull Biologie (PPN619462639) de
dc.identifier.ppn 887658482

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