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Proteomische Analyse von Plattenepithelkarzinomen des Kopf-Hals-Bereichs und Plattenepithelkarzinomen der Lunge

dc.contributor.advisorStröbel, Philipp Prof. Dr.
dc.contributor.authorHoffmann, Jonatan Felix
dc.date.accessioned2022-07-26T09:33:20Z
dc.date.available2022-08-25T00:50:10Z
dc.date.issued2022-07-26
dc.identifier.urihttp://resolver.sub.uni-goettingen.de/purl?ediss-11858/14180
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-9366
dc.language.isodeude
dc.subject.ddc610de
dc.titleProteomische Analyse von Plattenepithelkarzinomen des Kopf-Hals-Bereichs und Plattenepithelkarzinomen der Lungede
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedProteomic analysis of head and neck squamous cell carcinoma and lung squamous cell carcinomade
dc.contributor.refereeStröbel, Philipp Prof. Dr.
dc.date.examination2022-08-18de
dc.description.abstractgerBei Patient*innen, die an einem Plattenepithelkarzinom des Kopf-Hals-Bereichs erkrankt sind, kann es aufgrund gemeinsamer Risikofaktoren wie z. B. Tabakrauch im Verlauf sowohl zu einer Lungenmetastase dieses Karzinoms als auch zu einem metachronen Plattenepithelkarzinom der Lunge kommen. Die Unterscheidung dieser beiden Tumorentitäten ist essentiell, da entweder palliativ oder kurativ therapiert wird, gestaltet sich aufgrund großer genomischer und histomorphologischer Ähnlichkeiten in der klinischen Routine jedoch als große Herausforderung. In dieser Studie wurde eine vergleichende proteomische Analyse dieser Neoplasien durchgeführt mit dem Ziel, sie anhand von Proteinsignaturen voneinander zu unterscheiden. Dazu wurden Proteine aus insgesamt 74 Tumorgewebeproben (44 Plattenepithelkarzinome der Lunge und 30 Plattenepithelkarzinome des Kopf-Hals-Bereichs) isoliert und mittels eines Proteinquantifizierungsstandards massenspektrometrisch analysiert. Dabei konnten pro Probe durchschnittlich 2.251 und insgesamt 6.214 Proteine quantifiziert werden. Bei 518 Proteinen zeigte sich eine signifikant unterschiedliche Expression zwischen Plattenepithelkarzinomen der Lunge und des Kopf-Hals-Bereichs. Darunter waren auch Proteine, wie beispielsweise HMGCS-1 oder FAM83H, die bereits zuvor als onkogene Faktoren beschrieben worden waren. Mittels einer aus ca. 1.100 Proteinen bestehenden Signatur konnten Plattenepithelkarzinomen der Lunge und des Kopf-Hals-Bereichs erfolgreich differenziert werden. Einzelne Biomarker waren hingegen nicht geeignet. Diese Arbeit stellt damit einen umfassenden proteomischen Datensatz zur Verfügung, der als Grundlage weiterer Untersuchungen dienen kann. Sie zeigt außerdem, dass die Unterscheidung von malignen Neoplasien mit hoher Ähnlichkeit durch komplexe proteomische Signaturen möglich ist. Die massenspektrometrische Proteomanalyse könnte zukünftig eine Rolle in der Diagnostik von Lungentumoren bei Patient*innen mit einem Plattenepithelkarzinom des Kopf-Hals-Bereichs einnehmen, jedoch sind hierfür insbesondere noch prospektive klinische Studien notwendig. Die in dieser Studie gewählte Methode bietet außerdem die Möglichkeit, formalinfixiertes und in Paraffin eingebettetes Gewebe, das weltweit in den Archiven Pathologischer Institute und Biobanken lagert, massenspektrometrisch zu analysieren und so zu einem besseren Verständnis maligner Neoplasien und der Beantwortung klinisch relevanter Fragestellungen beizutragen.de
dc.description.abstractengPatients with squamous cell carcinoma of the head and neck may develop both lung metastasis and metachronous squamous cell carcinoma of the lung due to shared risk factors such as tobacco smoke. Distinguishing between these two tumor entities is essential as either palliative or curative therapy is administered, but proves to be a major challenge in clinical routine due to large genomic and histomorphologic similarities. In this study, a comparative proteomic analysis of these neoplasms was performed aiming to distinguish them based on protein signatures. To this end, proteins were isolated from a total of 74 tumor tissue samples (44 squamous cell carcinomas of the lung and 30 squamous cell carcinomas of the head and neck) and analyzed by mass spectrometry using a protein quantification standard. An average of 2,251 proteins per sample and a total of 6,214 proteins could be quantified. 518 proteins showed significantly different expression between squamous cell carcinomas of the lung and head and neck. These included proteins, such as HMGCS-1 or FAM83H, which had previously been described as oncogenic factors. By using a signature consisting of approximately 1,100 proteins, squamous cell carcinomas of the lung and head and neck could be successfully differentiated. In contrast, individual biomarkers were not suitable. This work thus provides a comprehensive proteomic dataset that can serve as a basis for further investigation. It also demonstrates that differentiation of malignant neoplasms with high similarity is possible through complex proteomic signatures. Mass spectrometric proteomic analysis may have a future role in the diagnosis of lung tumors in patients with head and neck squamous cell carcinoma, but prospective clinical studies in particular are required. The method chosen in this study also offers the possibility to analyze formalin-fixed and paraffin-embedded tissue stored in archives of pathological institutes and biobanks worldwide by mass spectrometry and can thus contribute to a better understanding of malignant neoplasms and to answering clinically relevant questions.de
dc.contributor.coRefereeBeutner, Dirk Prof. Dr.
dc.subject.gerBiomarkerde
dc.subject.gerPlattenepithelkarzinom des Kopf-Hals-Bereichsde
dc.subject.gerPlattenepithelkarzinom der Lungede
dc.subject.gerProteomikde
dc.subject.gerMassenspektrometriede
dc.subject.engBiomarkerde
dc.subject.enghead‐and‐neck cancerde
dc.subject.englung cancerde
dc.subject.engproteomicsde
dc.subject.engmass spectrometryde
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-ediss-14180-6
dc.affiliation.instituteMedizinische Fakultätde
dc.subject.gokfullPathologie / Pathologische Anatomie / Histopathologie / Zytopathologie - Allgemein- und Gesamtdarstellungen (PPN619875674)de
dc.description.embargoed2022-08-25de
dc.identifier.ppn181185852X
dc.identifier.orcid0000-0002-1038-8294de


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