Diagnostik, Prävalenz und molekulare Charakterisierung von Clostridioides difficile im ländlichen Ghana

Diagnostics, Prevalence and Molecular Characterization of Clostridioides difficile in Rural Ghana

by Iryna Janssen née Toker
Doctoral thesis
Date of Examination:2024-10-10
Date of issue:2024-10-01
Advisor:Prof. Dr. Uwe Groß
Referee:Prof. Dr. Uwe Groß
Referee:PD Dr. Ulrike, Loderstädt
Persistent Address: http://dx.doi.org/10.53846/goediss-10775

 

 

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Abstract

English

This study investigated the role of Clostridioides difficile (C. difficile) as a cause of diarrheal diseases in rural Ghana. Between November 2013 and September 2014, 176 stool samples from diarrhea patients and 131 samples from healthy individuals were collected and analyzed for C. difficile at St. Martin de Porres Hospital in Eikwe. Detection of C. difficile was performed using culture, antigen tests, and toxin assays. Further analyses, such as antibiotic resistance testing and MALDI-TOF mass spectrometry, were conducted in Germany. Ribotyping of all C. difficile strains was carried out in collaboration with the University of Maribor, Slovenia. The prevalence of C. difficile was 4.9%, with no significant difference between healthy and diseased participants. Nine ribotypes were identified, including three new ones. 80% of the isolates were non-toxigenic. Additional intestinal pathogens, such as rotavirus and Campylobacter, were detected in some C. difficile-positive samples. Risk factors for C. difficile infections included the use of ceftriaxone, low fluid intake, Plasmodium falciparum infection, and contact with goats. The uncritical use of antibiotics may increase the risk of future infections.
Keywords: Clostridioides difficile; Diarrheal diseases; Rural Ghana; Intestinal pathogens; Ribotyping

German

In dieser Studie wurde die Rolle von Clostridioides difficile (C. difficile) als Ursache von Durchfallerkrankungen in einer ländlichen Region Ghanas untersucht. Zwischen November 2013 und September 2014 wurden 176 Stuhlproben von Durchfallpatienten und 131 Proben von gesunden Personen gesammelt und im St. Martin de Porres Hospital in Eikwe auf C. difficile untersucht. Die Detektion von C. difficile erfolgte durch kulturelle Anzucht, Antigentests und Toxinanalysen. Weitere Analysen wie Antibiotikaresistenztests und MALDI-TOF-Massenspektrometrie wurden in Deutschland durchgeführt. Die Ribotypisierung aller C. difficile-Stämme erfolgte in Kooperation mit der Universität Maribor, Slovenia. Die Prävalenz von C. difficile lag bei 4,9 %, ohne signifikanten Unterschied zwischen den gesunden und erkrankten Probanden. Es wurden neun Ribotypen identifiziert, darunter drei neue. 80 % der Isolate waren nicht-toxigen. Weitere Darmpathogene wie Rotavirus und Campylobacter wurden in einigen C. difficile-positiven Proben nachgewiesen. Als Risikofaktoren für C. difficile-Infektionen wurden der Gebrauch von Ceftriaxon, geringe Flüssigkeitsaufnahme, Plasmodium falciparum-Infektion und der Kontakt mit Ziegen identifiziert. Der unkritische Einsatz von Antibiotika könnte das Risiko zukünftiger Infektionen erhöhen.
Schlagwörter: Clostridioides difficile; Durchfallerkrankungen; ländliches Ghana; Darmpathogene; Ribotypisierung