Relevanz von methylierten DNA-Fragmenten als nicht-invasiver Biomarker beim Nierenversagen
Relevance of methylated DNA fragments as a non-invasive biomarker in kidney failure
by Anna Franziska Spinn
Date of Examination:2025-01-20
Date of issue:2025-01-20
Advisor:Prof. Dr. Michael Zeisberg
Referee:Prof. Dr. Argyris Papantonis
Referee:Prof. Dr. Dieter Kube
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Name:Spinn_Anna_Dissertation_eDiss.pdf
Size:2.84Mb
Format:PDF
Description:Embargo
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Abstract
English
Epigenetic modifications, particularly DNA methylation, play a central role in the progression of acute and chronic kidney diseases. Early identification of at-risk patients and timely initiation of preventive measures are crucial to halting disease progression and preventing kidney failure. This study investigated epigenetic markers, specifically the methylation of the BMP7, EPO, and RASAL1 genes, to evaluate their potential as biomarkers for kidney damage and the need for renal replacement therapy. DNA methylation levels in peripheral blood lymphocytes were determined using methylated DNA immunoprecipitation combined with quantitative real-time PCR. Methylation analysis was conducted on blood samples from two patient cohorts: critically ill patients with acute kidney injury and patients with chronic kidney disease undergoing dialysis. Significant correlations were observed between gene methylation patterns and various stages of kidney disease: BMP7 was associated with acute kidney injury, while EPO reflected chronic disease processes. RASAL1, used as a control gene, was linked to fibrotic processes but showed no specific association with either acute or chronic stages. In the acute kidney injury cohort, a cutoff value for BMP7 methylation was identified, enabling a timely indication for dialysis. In the chronic kidney disease cohort, methylation measurements in leukocytes proved reliable and were unaffected by dialysis. These findings demonstrate the potential clinical utility of BMP7, EPO, and RASAL1 methylation analysis for predicting disease progression and facilitating early therapeutic interventions, particularly dialysis initiation.
Keywords: DNA methylation; epigenetic markers; acute kidney injury (AKI); chronic kidney disease (CKD); BMP7; EPO; RASAL1; renal replacement therapy; dialysis initiation; fibrosis; biomarker prediction
German
Epigenetische Veränderungen, insbesondere die DNA-Methylierung, spielen eine zentrale Rolle bei der Progression akuter und chronischer Nierenerkrankungen. Die frühzeitige Identifikation von Risikopatienten und rechtzeitige Einleitung präventiver Maßnahmen sind entscheidend, um das Fortschreiten von Nierenerkrankungen und das Eintreten eines Nierenversagens zu verhindern. In dieser Arbeit wurden epigenetische Marker, insbesondere die Methylierung der Gene BMP7, EPO und RASAL1, untersucht, um deren Bedeutung als Biomarker für Nierenschäden und die Notwendigkeit einer Nierenersatztherapie zu evaluieren. Die Methylierung dieser Gene in peripheren Blutlymphozyten wurde durch methylierte DNA Immunpräzipitation und quantitative Realtime-PCR bestimmt. Die Methylierungsanalyse erfolgte an Blutproben zweier Patientenkohorten: Intensivpatienten mit akutem Nierenversagen und chronisch dialysepflichtigen Patienten. Es zeigten sich signifikante Korrelationen zwischen der Methylierung der Gene und verschiedenen Stadien der Nierenerkrankung: BMP7 war mit akutem Nierenversagen assoziiert, während EPO die chronischen Prozesse widerspiegelte. RASAL1, als Kontrollgen, korrelierte mit Fibroseprozessen, jedoch nicht spezifisch mit den akuten oder chronischen Stadien. In der Kohorte mit akutem Nierenversagen wurde ein Cut-Off-Wert für BMP7 identifiziert, der eine rechtzeitige Dialyseindikation ermöglichte. In der Kohorte mit chronischer Niereninsuffizienz bestätigte sich die Verlässlichkeit der Messung der Methylierung in Leukozyten und zeigte keinen signifikanten Einfluss der Dialyse auf die Methylierungswerte. Die Ergebnisse dieser Studie belegen die potenzielle klinische Anwendung der Methylierungsanalyse von BMP7, EPO und RASAL1 zur Vorhersage des Krankheitsverlaufs und zur frühen Einleitung therapeutischer Maßnahmen, insbesondere der Dialysebehandlung.
Schlagwörter: DNA-Methylierung; epigenetische Marker; akutes Nierenversagen (ANV); chronische Nierenerkrankung (CNV); BMP7; EPO; RASAL1; MeDIP; Nierenersatztherapie; Dialyseeinleitung; Nierenfibrose; Biomarker