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Monitoring of Fusarium species on oats in Germany - identification, mycotoxin production and cultivar effects

by Charlotte Rodemann
Doctoral thesis
Date of Examination:2025-07-11
Date of issue:2025-11-04
Advisor:Prof. Dr. Andreas von Tiedemann
Referee:Prof. Dr. Andreas von Tiedemann
Referee:Prof. Dr. Susanne Neugart
crossref-logoPersistent Address: http://dx.doi.org/10.53846/goediss-11597

 

 

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Name:Thesis_Charlotte_Rodemann_ediss_final.pdf
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Format:PDF
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Abstract

English

The use of oats in human nutrition has increased in recent years due to their beneficial nutritional components. Nonetheless, with the implementation of new legal limits, elevated levels of mycotoxins in the harvested material have become an issue of concern throughout oat production in Europe. For this purpose, the occurrence and composition of the Fusarium spp. spectrum and their associated mycotoxins in German spring oats were determined over a three-year monitoring period in the present study. The investigation also focused on analysing the susceptibility of selected cultivars to F. langsethiae and their reaction to contamination with T-2 toxin in vitro and in field experiments. Within the framework of the monitoring, samples were collected from fungicide-free plots of the cultivars Max, Apollon and Lion at multiple locations across Germany from 2020 to 2022. Samples were analysed by isolation and identification of Fusarium spp. and the detection of Fusarium DNA by qPCR. For the evaluation of environmental factors and agronomic practices, site-specific data concerning crop rotation, precipitation, temperature and relative humidity were collected at each location. Low disease incidence was observed in 2020 (11,4%) and 2022 (12,8%), while the incidence in 2021 (38,4%) nearly tripled. In total, up to 17 different Fusarium spp. were isolated from oat kernels. Throughout the monitoring period, F. poae, F. tricinctum and F. avenaceum were found to be the prevalent species. Important producers of type A or type B trichothecenes on the other hand were isolated with a lower frequency. qPCR analysis further underlined the high presence of F. poae and F. tricinctum in naturally infected kernels. While the high presence of F. avenaceum could not be replicated, the qPCR analysis also revealed a frequent occurrence of F. langsethiae DNA in infected kernels. Mycotoxin analysis was performed using HPLC-MS/MS and confirmed the presence of DON, NIV, T-2 and HT-2. Average concentrations during the monitoring period were 36.8 µg/kg for DON, 33.1 µg/kg for NIV, 31.0 µg/kg for T-2, 7.7 µg/kg for HT-2 and 38.7 µg/kg for the sum of T-2+HT-2. Despite low average concentrations, peak concentrations of DON (max: 224.53 µg/kg) or the sum of T-2+HT-2 (max: 637.6 µg/kg) were occasionally detected. In none of the analysed samples, DON, T-2 and HT-2 were detected at concentrations above the current legal limits. High annual variation in the disease incidence, the composition of the Fusarium spp. spectrum and the occurrence of mycotoxins was observed throughout the monitoring period. Qualitative alterations in the composition of the Fusarium species spectrum coincided with annual environmental variation concerning precipitation and mean temperature. However, correlations between climatic variables and the level of fungal DNA or the concentrations of mycotoxins were rather low. Concentrations of F. tricinctum and F. langsethiae DNA measured in infected kernels varied significantly between different types of preceding crops. Higher concentrations were found in oats grown after spring and winter cereals. No significant effect of crop rotation was found for the levels of F. poae DNA. Similarly, higher concentrations of T-2 and HT-2 were found when the previous crops were cereals, while significant higher DON concentrations were detected after non-cereal spring crops. The examined cultivars did not show any significant differences regarding disease incidence, concentration of fungal DNA or mycotoxin content for any of the analysed Fusarium spp.. All in all, the monitoring revealed a lower risk for German oat production as the most frequent Fusarium spp. are of a lesser toxicological relevance and detected mycotoxin concentrations were low. Resistance to initial infection by F. langsethiae was examined in a set of 32 cultivars in two field experiments and one greenhouse study. High variation of the concentration of fungal DNA in infected kernels was observed between the two field trials as well as the greenhouse study. Nonetheless, some cultivars accumulated consistently low, respectively high, concentrations of fungal DNA across all environments, while others showed strong variation between the examined environments. These results indicated that there are already more resistant cultivars present on the German market. The interaction of cultivars with the mycotoxin T-2 was evaluated in multiple in vitro experiments focussing on the uptake of the toxin by roots and leaves of seedlings. Studies were performed by cultivating seedlings in a solution containing T-2 or the treatment of leaves with T-2. All samples were analysed using HPLC-MS/MS. Results revealed that all cultivars were able to take up T-2 through roots and leaves and to metabolize it to HT-2. In the root uptake experiments, cultivars showed significant differences concerning the uptake, but also the accumulation of T-2 and HT-2 in the plant. Significant differences concerning the accumulation of T-2 and HT-2 were also observed after treating leaves with T-2. Following both treatments, cultivars with low accumulation of T-2 and HT-2 and high accumulation could be observed. Furthermore, cultivars varied significantly in the ratio of HT-2/T-2 detected in plants. The highest ratio was found in the cultivar Symphony indicating a higher turnover rate of T-2 to HT-2. In seedlings only treated on leaves, low concentrations of T-2 and HT-2 were also detected in untreated plant parts up to 0.1 µg/g on average indicating that plants were able to translocate the mycotoxins. Additionally, excretion of T-2 or HT-2 through the roots of up to 1.55% of the applied amount was observed in both experiments with some variation between cultivars. Overall, both methodologies were able to identify resistant or tolerant cultivars that are able to contribute to lower mycotoxin accumulation in kernels, by either low accumulation in treated organs or higher turnover rates. Mycotoxin analysis of plant material using LC-QTOF, following the treatment of leaves with 13C-labelled T-2, revealed that the major metabolite of T-2 in plants, besides HT-2, was HT-2-3-G. After leaf treatment, HT-2-3-G was most not only abundant in the treated leaves, but also the untreated stem, suggesting translocation. The results of this study offer closer insights into the occurrence of Fusarium spp. and the threat they may pose to oats produced in Germany through their ability to produce mycotoxins. These findings can be used to design strategies to manage the risk of Fusarium for farmers and breeders. The results on cultivar resistance to infection with F. langsethiae and the uptake of T-2 could be incorporated into future breeding research.
Keywords: Oats; Fusarium; Mycotoxins; T-2

German

Aufgrund seiner ernährungsphysiologischen Vorzüglichkeit und der anhaltenden Nachfrage ist der Haferanbau in Deutschland in den letzten Jahren kontinuierlich angestiegen. Allerdings gab es zur gleichen Zeit immer wieder Berichte über die Kontamination von Erntegut mit Mykotoxinen, hervorgerufen durch den Befall der Rispe mit Fusarium spp.. Um die Bedeutung der Rispenfusariose für den deutschen Haferanbau zu bewerten, wurden in der vorliegenden Studie im Rahmen eines dreijährigen Monitorings das Vorkommen und die Zusammensetzung des Spektrums von Fusarium spp. und der assoziierten Mykotoxine in deutschem Sommerhafer untersucht. Weiterhin wurde in der vorliegenden Arbeit die Anfälligkeit ausgewählter Sorten gegenüber F. langsethiae und deren Reaktion auf die Kontamination mit dem T-2-Toxin in vitro und in Feldversuchen untersucht. Im Rahmen des Monitorings wurden von 2020 bis 2022 Ernteproben aus fungizid-freien Parzellen der Hafersorten Max, Apollon und Lion von verschiedenen Standorten in Deutschland gesammelt und auf den Befall mit Fusarium spp. untersucht. Dazu erfolgte die Isolation und Identifikation von Fusarium spp. von infizierten Körnern, sowie die Quantifizierung von Fusarium-DNA mittels qPCR. Zur Bewertung des Einflusses von Umweltfaktoren und pflanzenbaulichen Praktiken auf die Befallsstärke, wurden zusätzlich standortspezifische Daten zu Fruchtfolge, Niederschlag, Temperatur und relativer Luftfeuchtigkeit erhoben. In den Jahren 2020 und 2022 konnte mit 11,4% und 12,8% nur eine geringe Befallshäufigkeit mit Fusarium spp. festgestellt werden, während sie im Jahr 2021 auf 38,4% anstieg. Insgesamt konnten bis zu 17 verschiedene Fusarium-Arten von Haferkörnern isoliert werden. Im Untersuchungszeitraum wurden F. poae, F. tricinctum und F. avenaceum als vorherrschende Arten im deutschen Haferanbau festgestellt. Im Gegensatz dazu konnten die Produzenten von Typ A oder Typ B Trichothecenen nur mit geringerer Häufigkeit isoliert werden. Der molekulare Nachweis mittels qPCR-Analyse zeigte ebenfalls das erhöhte Auftreten von F. poae und F. tricinctum in natürlich infizierten Körnern. Während das hohe Vorkommen von F. avenaceum in den Ergebnissen der qPCR nicht bestätigt werden konnte, wurde demgegenüber eine erhöhte Konzentration an F. langsethiae-DNA in den Körnern nachgewiesen. Die Analyse des Mykotoxinauftretens erfolgte mittels HPLC-MS/MS und bestätigte das Vorkommen von DON, NIV, T-2 und HT-2 im deutschen Haferanbau. Die durchschnittlichen Konzentrationen betrugen dabei 36,8 µg/kg für DON, 33,1 µg/kg für NIV, 31,0 µg/kg für T-2, 7,7 µg/kg für HT-2 und 38,7 µg/kg als Summe aus T-2+HT-2. Trotz durchschnittlich niedriger Konzentrationen wurden gelegentlich erhöhte Gehalte von DON (max. 224,53 µg/kg) oder T-2+HT-2 (max. 637,6 µg/kg) nachgewiesen. In keiner der untersuchten Proben wurden Konzentrationen für DON, T-2 und HT-2 nachgewiesen, die die geltenden gesetzlichen Grenzwerte überschritten. Die Ergebnisse des Monitorings zeigten starke jährliche Schwankungen in der Befallshäufigkeit, der Zusammensetzung des Spektrums an Fusarium spp. und dem Vorkommen von Mykotoxinen. Qualitative Veränderungen in der Zusammensetzung des Fusarium-Artenspektrums traten dabei in Abhängigkeit von den jährlichen Schwankungen der monatlichen Niederschlagsmenge und Durchschnittstemperatur auf. Jedoch konnten nur geringe Korrelationen zwischen klimatischen Faktoren und der Höhe der pilzlichen DNA einzelner Arten oder der Konzentration einzelner Mykotoxine ermittelt werden. Die Ergebnisse zeigten zudem einen Einfluss der Vorfrüchte auf die DNA-Konzentrationen von F. tricinctum und F. langsethiae. Höhere DNA-Gehalte beider Arten wurden in Haferproben gemessen, die nach Sommer- und Wintergetreide angebaut wurden. Für F. poae konnte hingegen kein signifikanter Effekt der Fruchtfolge auf den Gehalt an pilzlicher DNA festgestellt werden. Höhere Konzentrationen von T-2 und HT-2 wurde nach getreideartigen Vorfrüchten festgestellt werden, während signifikant höhere DON-Werte nach getreidefreien Sommerungen gemessen werden konnten. Für die untersuchten Sorten konnten keine signifikanten Unterschiede bezüglich der Befallshäufigkeit, der Konzentration an pilzlicher DNA oder dem Mykotoxingehalt für die analysierten Fusarium Arten nachgewiesen werden. Insgesamt zeigte das Monitoring ein geringeres Risiko für die deutsche Haferproduktion auf, da die wichtigsten Fusarium spp. von geringerer toxikologischer Relevanz sind und die nachgewiesenen Mykotoxinkonzentrationen niedrig waren. Zur Bewertung der Sortenresistenz gegenüber F. langsethiae wurden zwei Feldversuche und eine Gewächshausstudie mit 32 Genotypen mit künstlicher Inokulation durchgeführt. Sowohl bei den beiden Feldversuchen als auch bei der Gewächshausstudie konnten große Unterschiede in der Konzentration der pilzliche DNA in den infizierten Kernen festgestellt werden. In den Sorten Talkunar, KLAR185 und Apollon wurden in allen Umwelten die niedrigsten Konzentrationen an F. langsethiae-DNA gemessen, während die Sorten Gabriel und Magellan durchweg hohe DNA-Konzentrationen aufwiesen. Im Gegensatz dazu konnten für die Sorten Karl, Simon und Dominik starke Unterschiede zwischen den Umwelten beobachtet werden. Trotzdem konnten in einigen Sorten niedrige Konzentrationen bzw. hohe Konzentrationen an F. langsethiae DNA in allen Umwelten gemessen werden, während für andere Sorten starke Unterschiede zwischen den Umwelten beobachtet werden konnte Die Interaktion verschiedener Sorten mit dem Mykotoxin T-2 wurde in mehreren in vitro Experimenten deren Schwerpunkt auf der Aufnahme des Toxins durch die Pflanze lag untersucht. Die Untersuchung wurde in zwei Ansätzen durchgeführt: der Kultivierung von Keimlingen in einer T-2 haltigen Lösung und der Applikation von T-2 auf die Blätter von Keimlingen. Zur Bewertung der Aufnahme wurden alle Proben mittels HPLC-MS/MS analysiert. Die Ergebnisse zeigten, dass alle Sorten in der Lage waren, T-2 über Wurzeln und Blätter aufzunehmen und zu HT-2 zu metabolisieren. Bei den Versuchen zur Wurzelaufnahme zeigten die Sorten zudem nicht nur signifikante Unterschiede bei der Aufnahme, sondern auch bei der Anreicherung von T-2 und HT-2 in der Pflanze. Ebenso konnten nach der Behandlung der Blätter mit T-2 signifikante Unterschiede hinsichtlich der Anreicherung von T-2 und HT-2 beobachtet werden. Nach beiden Behandlungen konnten Sorten mit geringer Anreicherung von T-2 und HT-2 sowie mit hoher Anreicherung identifiziert werden. Darüber hinaus unterschieden sich die Sorten erheblich hinsichtlich des Verhältnisses von HT-2 zu T-2 in den analysierten Pflanzenteilen. Das größte Verhältnis wurde bei der Sorte Symphony festgestellt, was auf eine höhere Umsatzrate von T-2 zu HT-2 hinweist. Zudem konnten in den Keimlingen auch niedrige Konzentrationen an T-2 und HT-2 von im Mittel bis zu 0,1 µg/g in den Pflanzenorgane unterhalb des behandelten Blattes nachgewiesen werden, was auf eine potenzielle Verlagerung der Mykotoxine durch die Pflanze hindeutet. Weiterhin konnte in beiden Versuchen eine Ausscheidung von T-2 oder HT-2 über die Wurzeln von bis zu 1,55% der applizierten Menge beobachtet werden. Insgesamt konnten mit beiden Methoden resistente oder tolerante Sorten identifiziert werden, die zu einer geringeren Mykotoxinakkumulation in den Körnern beitragen können, indem sie entweder eine geringere Akkumulation in den behandelten Organen oder höhere Umsatzraten aufweisen Die Behandlung der Blätter von Keimlingspflanzen mit 13C-markiertem T-2, sowie der anschließenden Analyse mittels LC-QTOF zeigte, dass als wichtigster Metabolit von T-2 und HT-2 in Pflanzen HT-2-3-G nachgewiesen werden konnte. Nach der Behandlung der Blätter mit T-2 konnte HT-2-3-G nicht nur in den behandelten Blättern nachgewiesen werden, sondern auch im unbehandelten Stängel. Diese Beobachtung deutet ebenfalls auf eine Translokation des Toxins in der Pflanze hin. Die dargestellten Ergebnisse geben Einblicke in das Auftreten von Fusarium spp. und assoziierter Mykotoxine im deutschen Haferanbau, sowie der potenziellen Bedrohung, die sich daraus für die Sicherheit und Qualität von Lebensmitteln ergeben könnten. Die gewonnenen Erkenntnisse können genutzt werden, um Strategien zur Minimierung des Fusarium-Risikos für Landwirte und Züchter zu entwickeln. Die Ergebnisse zur Sortenresistenz gegenüber einer Infektion mit F. langsethiae und der Aufnahme von T-2 können in die künftige Züchtungsforschung einfließen.
 

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