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Lipid dependent interactions of biomimetic membrane models with the ENTH domain of epsin

dc.contributor.advisorSteinem, Claudia Prof. Dr.
dc.contributor.authorTeske, Nelli
dc.date.accessioned2020-02-05T09:46:42Z
dc.date.available2020-02-05T09:46:42Z
dc.date.issued2020-02-05
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/21.11130/00-1735-0000-0005-1309-C
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-7839
dc.language.isoengde
dc.relation.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject.ddc572de
dc.titleLipid dependent interactions of biomimetic membrane models with the ENTH domain of epsinde
dc.typedoctoralThesisde
dc.contributor.refereeSteinem, Claudia Prof. Dr.
dc.date.examination2019-12-09
dc.description.abstractgerWährend der Endozytose wird die Membran durch verschiedene Protein-Protein und Protein-Lipid Interaktionen reguliert. In der Clathrin-vermittelten Endozytose (CME) bewirkt die Bindung des Proteins Epsin an sein Rezeptorlipid Phosphatidyl-(4,5)-bisphosphat (PIP2) eine Membrankrümmung. Durch diese Bindung wird in der Epsin N-terminalen Homologie Domäne (ENTH) eine neue Helix (α0) ausgebildet, die die cytosolische Lipidmonoschicht der Plasmamembran penetriert. Mit artifiziellen Membransystemen konnten die Bindungsaffinitäten und die Oberflä-chentopologien bei ENTH-Anbindung in Abhängigkeit der Lipidzusammensetzung analysiert werden. Mit zunehmender PIP2-Konzentration zeigten die Experimente an fest unterstützten Lipiddoppelschichten und -monoschichten einen direkten Zusam-menhang zwischen der Proteinbelegung und der Rezeptorlipidkonzentration. Dies wiederum deutet darauf hin, dass eine Anhäufung von PIP2 in der Plasmamembran die Endozytose-Rate steigern kann. Nicht nur bei der Erhöhung der PIP2-Konzentration wurde eine höhere Proteinober-flächenbelegungen auf Membranen beobachtet, sondern auch in Gegenwart der Lip-idkopfgruppe Phosphatidylserin (PS), welche die Bildung von ENTH Cluster indu-ziert. Somit scheint neben der Helixinsertion auch das Zusammenlagern mehrerer ENTH-Moleküle (Crowding) einen Einfluss auf den krümmungsinduzierenden Schritt in der CME zu haben. Mit der Mutante ENTH R114A konnte zudem gezeigt werden, dass die Aminosäure R114 essentiell für die Clusterbildung ist. Penetrationsexperimente an Lipidmonoschichten wurden durchgeführt, um die Oberflächenaktivität von ENTH in Abhängigkeit von der Lipidzusammensetzung zu analysieren. Dabei zeigte die PIP2 Konzentration einen größeren Einfluss auf den kritischen Oberflächendruck als die Zugabe von PS. Adhärierte Riesenvesikel (GUVs) ermöglichten zudem die mechanischen Eigenschaf-ten von Membranen in Abhängigkeit von PS zu untersuchen. Inkubation dieser GUVs mit ENTH führte zum Rupturieren der Vesikel durch die Entstehung von Defekten während der Helixinsertion und der PS-induzierten Clusterbildung. Dies zeigt, dass PS einen deutlichen Einfluss auf die Bindungsstruktur von ENTH an PIP2 Membra-nen hat. Dadurch konnte auch gezeigt werden, dass die Lipidzusammensetzung zur Regulation der proteinabhängigen Membrankrümmung während der CME beiträgtde
dc.description.abstractengMembrane remodeling processes during endocytosis are highly regulated by the protein-protein and protein-membrane interactions. In clathrin-mediated endocyto-sis (CME) binding of the protein epsin to its receptor lipid phosphatidylinositol-(4,5)-bisphosphate (PIP2) induces the deformation of the membrane. Upon binding of the epsin N-terminal homology domain (ENTH) to PIP2, conformational changes in the protein lead to a newly formed helix, which inserts into the cytosolic leaflet. By using artificial membrane models the binding affinity and the surface topology upon ENTH binding as a function of the lipid composition were analyzed. With in-creasing the PIP2 concentration the experiments on solid supported lipid bi- and monolayers proved a direct relation between the protein occupancy and the lipid content. Subsequently, this indicates that an accumulation of PIP2 on the cytosolic leaflet can facilitate the endocytosis rate. Besides PIP2 also negatively charged lipids with the head group phosphatidylserine (PS) can affect protein binding in endocytosis. In presence of PS, higher binding af-finities and protein occupancies of ENTH to PIP2 doped membranes were observed. Although ENTH is known to act as a monomeric protein, atomic force microscopy (AFM) measurements revealed the appearance of protein clusters induced by PS. Thus, also membrane crowding seems to have an impact on the curvature inducing step in CME. Mutation of the amino acid R114 showed its relevance in ENTH cluster formation as no oligomers were observed with the mutant R114A. Moreover, monolayer penetration experiments were performed to analyze the sur-face activity of ENTH dependent on the lipid composition. Increasing the PIP2 con-tent increased the critical surface pressure. Addition of PS did not significantly in-crease the penetration of ENTH into monolayers in a PIP2 dependent manner, alt-hough a higher protein occupancy on supported lipid bilayers was observed. To investigate whether ENTH has an influence on mechanical properties of mem-branes in the presence of PS, giant unilamellar vesicles (GUVs) were adhered to Neu-trAvidin coated surfaces. Incubation of these GUVs with ENTH resulted in the rup-turing of those due to lipid packing defects in the membrane by helix insertion and PS induced clusters. These results allow to understand how PS alters the binding structure of ENTH to PIP2 doped membranes. This in turn also show that the lipid composition contributes to the regulation of protein-dependent membrane defor-mation during CME.de
dc.contributor.coRefereeBurg, Thomas Prof. Dr.
dc.subject.engEpsinde
dc.subject.engENTHde
dc.subject.engLipid dependencyde
dc.subject.engENTH-membrane interactionsde
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-21.11130/00-1735-0000-0005-1309-C-7
dc.affiliation.instituteGöttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften, Biophysik und molekulare Biowissenschaften (GGNB)de
dc.subject.gokfullBiologie (PPN619462639)de
dc.identifier.ppn1689510439


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