Genetische Polymorphismen in Typ-III-Interferon-Genen und deren prognostische Signifikanz für das hepatozelluläre Karzinom und das duktale Pankreasadenokarzinom

Huschka, Henriette

dc.contributor.advisor	Mihm, Sabine Prof. Dr.
dc.contributor.author	Huschka, Henriette
dc.date.accessioned	2021-03-08T12:31:15Z
dc.date.available	2022-12-16T00:50:11Z
dc.date.issued	2021-03-08
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/21.11130/00-1735-0000-0005-1598-8
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.53846/goediss-8476
dc.language.iso	deu	de
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject.ddc	610	de
dc.title	Genetische Polymorphismen in Typ-III-Interferon-Genen und deren prognostische Signifikanz für das hepatozelluläre Karzinom und das duktale Pankreasadenokarzinom	de
dc.type	doctoralThesis	de
dc.title.translated	Interferon-lambda germline variations and their significance for hepatocellular carcinoma and pancreatic ductal adenocarcinoma progression	de
dc.contributor.referee	Mihm, Sabine Prof. Dr.
dc.date.examination	2021-03-16
dc.description.abstractger	Das hepatozelluläre Karzinom (HCC) und und das duktale Pankreasadenokarzinom (PDAC) zählen zu den tödlichsten Tumorentitäten, deren Inzidenz global betrachtet weiter steigt. In Hinblick auf die antitumorale Wirkung von Interferonen (IFN) soll diese Arbeit die Beziehung zwischen genetischen Keimbahnvariationen in Typ-III-IFN-Genen und der Progression der Tumorerkrankungen auf Basis von The Cancer Genome Atlas (TCGA)-Daten untersuchen. Die betrachteten genetischen Variationen spiegeln einen gain-or-loss-of-function Dinukleotidpolymorphismus (rs368234815 [TT/ΔG]) innerhalb des IFNL4-Gens. Die Gesamtheit der TCGA-Sequenzdaten wurde genutzt, um Genotypen von 187 HCC-Patienten und 162 PDAC-Patienten gleicher Ethnizität auszulesen. Für die nach IFNL-Genotypen stratifizierten TCGA-Kollektive wurden innerhalb Ereigniszeitanalysen nach dem Kaplan-Meier-Verfahren die Längen des progressionsfreien Intervalls (PFI), des spezifischen progressionsfreien Intervalls (PFI.2) und der Gesamtüberlebensdauer (OS) als drei klinische Endpunkte für die Tumorprogression betrachtet. Die Log-Rank-Analysen ergaben einen signifikanten Zusammenhang zwischen den IFNL-Genotypen und der PDAC-Progression. Dieser Zusammenhang konnte für die HCC-Patienten nicht detektiert werden. Eine multiple Cox-Regressionanalyse, die als weitere Kovarianten das Patientenalter, den Grad der Tumordifferenzierung und das Tumorstadium enthielt, zeigte die IFNL-Genotypen als unabhängige Einflussfaktoren für die PDAC-Progression. Diese Arbeit liefert erste klinische Evidenz für die Bedeutung von Polymorphismen in den Typ-III-IFN-Genen des Wirtsgenoms für die Progression des PDAC, wobei ein für die IFNL4-Expression prädisponierender IFNL-Haplotyp prognostisch günstig ist.	de
dc.description.abstracteng	Hepatocellular carcinoma (HCC) and pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) are malignancies with a leading lethality. With reference to interferons (IFNs) known to mediate antitumor activities, this study investigated the relationship between germline genetic variations in type III IFN genes and cancer disease progression from The Cancer Genome Atlas (TCGA) data. The genetic variations under study tag a gain-or-loss-of-function dinucleotide polymorphism (rs368234815 [TT/ΔG]) within the IFNL4 gene. The entirety of the TCGA sequencing data was used to assess genotypes of 187 patients with HCC and of 162 patients with PDAC matched for ethnicity. Stratified for IFNL genotypes, both cohorts were subjected to time-to-event analyses according to Kaplan-Meier with regard to the length of the progression free interval (PFI), the length of the specific progression free interval (PFI.2) and the overall survival (OS) time as three clinical endpoints for disease progression. Logrank analysis revealed a significant relationship between IFNL genotypes and disease outcome for PDAC. This relationship was not found for HCC. A multiple Cox regression analysis employing patients’ age, tumor grade and tumor stage as further covariates proved IFNL genotypes to be independent predictors for PDAC disease outcome. This repository-based approach unveiled clinical evidence suggestive for an impact of IFNL germline variations for PDAC progression with an IFNL haplotype predisposing for IFNL4 expression being favorable.	de
dc.contributor.coReferee	Beißbarth, Tim Prof. Dr.
dc.subject.ger	Interferon-lambda4	de
dc.subject.ger	IFNL4	de
dc.subject.ger	IFNL4 rs368234815	de
dc.subject.ger	hepatozelluläres Karzinom	de
dc.subject.ger	HCC	de
dc.subject.ger	duktales Pankreasadenokarzinom	de
dc.subject.ger	PDAC	de
dc.subject.ger	antitumorale Wirtsantwort	de
dc.subject.ger	progressionfreies Intervall	de
dc.subject.ger	PFI	de
dc.subject.ger	spezifisches progressionfreies Intervall	de
dc.subject.ger	PFI.2	de
dc.subject.ger	Gesamtüberlebensdauer	de
dc.subject.ger	OS	de
dc.subject.ger	Typ-III-Interferon	de
dc.subject.eng	interferon-lambda4	de
dc.subject.eng	IFNL4	de
dc.subject.eng	IFNL4 rs368234815	de
dc.subject.eng	type III interferons	de
dc.subject.eng	hepatocellular carcinoma	de
dc.subject.eng	HCC	de
dc.subject.eng	pancreatic ductal adenocarcinoma	de
dc.subject.eng	PDAC	de
dc.subject.eng	antitumor host response	de
dc.subject.eng	progression free interval	de
dc.subject.eng	PFI	de
dc.subject.eng	specific progression free interval	de
dc.subject.eng	PFI.2	de
dc.subject.eng	overall survival	de
dc.subject.eng	OS	de
dc.identifier.urn	urn:nbn:de:gbv:7-21.11130/00-1735-0000-0005-1598-8-4
dc.affiliation.institute	Medizinische Fakultät	de
dc.subject.gokfull	Medizin (PPN619874732)	de
dc.subject.gokfull	Medizinische Statistik / Biometrie / Epidemiologie - Allgemein- und Gesamtdarstellungen (PPN619875046)	de
dc.description.embargoed	2022-12-16
dc.identifier.ppn	1750792583

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Human- und Zahnmedizin [2872]

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