Charakterisierung eines neuen Proteins, Mapl-1 und seine Rolle in der Regulation der Pax-6 Funktion.
Characterization of a novel protein and its role in the regulation of Pax-6 function.
by Petros Petrou
Date of Examination:2001-11-01
Date of issue:2002-01-22
Advisor:Prof. Dr. Peter Gruss
Referee:PD Dr. Sigrid Hoyer-Fender
Referee:Prof. Dr. Hans-Joachim Fritz
Referee:Prof. Dr. Dietrich Gradmann
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Format:PDF
Description:Dissertation
Abstract
English
Pax proteins comprise a family of highly conserved transcriptional regulators that hold essential roles during embryonic development and organogenesis. The structural motif common to all Pax proteins is the paired box that has been originally identified in the fruitfly Drosophila melanogaster and encodes for a sequence specific DNA binding domain. The murine Pax genes exhibit specific temporal and spatial expression patterns and are involved in different developmental programs in which they occupy high positions in the corresponding regulatory hierarchies. The function of Pax6 has been tightly correlated with the development of the visual system both in vertebrates as well as in invertebrates. Understanding of the function of Pax6 requires elucidation of the molecular mechanisms that underlie its regulation. The present work describes the physical interaction between Pax6 and a novel identified protein Mapl-1. Mapl-1 exhibits a highly overlapping expression pattern to Pax6 especially during the early stages of eye and brain development. Genes similar to Mapl-1 have also been identified on the basis of sequence similarity in the genomes of Drosophila and the nematode Caenorhabditis elegans. Thus Mapl-1 is the founding member of a novel family of evolutionary conserved proteins. Analysis of the interaction between Pax6 and Mapl-1 in vitro identified the paired domain of Pax6 as protein-protein interaction motif. Furthermore binding of Mapl-1 to the Pax6 paired domain prevented its simultaneous interaction with the consensus DNA binding site. This suggests that Mapl-1 might exert an inhibitory effect on the DNA binding properties of the paired domain and therefore on Pax6 function. Analysis of the cellular distribution of Mapl-1 in cultured cells revealed its association with the cellular microtubules while its overexpression induced dramatic changes in microtubule organization leading to the formation of thick bundles. The microtubule association of Mapl-1 is direct and specific since the organization of the other types of cytoskeletal filaments is not affected and leads to increased stability of the microtubule filaments. Hence, Mapl-1 represents a novel "microtubule associated protein", (MAP) since it does not share any substantial sequence similarity to other known MAPs. Mapl-1 can also translocate into the cell nucleus and possesses transcriptional stimulatory potential. The regulation of the cellular localization of Mapl-1 is under the control of nuclear import and export signals. The ability of Mapl-1 to interact both with Pax6 and the microtubules caused in cultured cells the ectopic localization of the otherwise strictly nuclear Pax6 on microtubule filaments. The data presented in this work create for the first time a link between the cytoskeleton and the regulation of Pax protein activity and provide new insights into the molecular mechanisms that control Pax6 function.
Keywords: Pax; Pax6; Paired domain; transcription factor; protein protein interactions; GST-Pulldown; microtubules; microtubule associated protein; MAP
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Die Pax-Proteine stellen eine Familie von stark konservierten Transkriptionsfaktoren dar die, während der embryonalen Entwicklung und Organogenese eine Schlüsselrolle spielen. Das gemeinsame Strukturmotiv dieser Genfamilie ist die Paired-Box, die zuerst in der Fruchtfliege Drosophila melanogaster entdeckt wurde und für eine sequenzspezifische DNA bindende Domäne kodiert. Die Pax-Gene der Maus weisen ein räumlich und zeitlich spezifisches Expressionsmuster auf und sind an verschiedenen Entwicklungsprogrammen beteiligt, bei denen sie hohe Positionen in den entsprechenden regulatorischen Kaskaden einnehmen. Die Funktion von Pax6 ist sowohl bei Vertebraten als auch bei Invertebraten mit der Entwicklung des visuellen Systems eng verknüpft. Das Verständnis der Wikung des Pax6 Proteins während der Embryogenese erfordert die Aufklärung der molekularen Aspekte seiner Funktion. In dieser Arbeit wurde die physikalische Interaktion zwischen Pax6 und einem neu identifizierten Protein, Mapl-1 studiert. Mapl-1 weist ein zu Pax6 weitgehend überlappendes Expressionsmuster auf insbesondere während der frühen Stadien der Augen- und Gehirnentwicklung. Mapl-1 ähnliche Gene konnten aufgrund von Sequenzähnlichkeit sowohl im Menschen als auch in Drosophila und der Nematode Caenorhabditis elegans identifiziert werden und stellen daher eine neue Genfamilie dar. Die Analyse der Interaktion zwischen Pax6 und Mapl-1 in vitro identifizierte die Paired-Domäne von Pax6 als Protein-Protein Interaktionsmotiv. Weiterhin konnte die Paired-Domäne von Pax6 in Form eines Komplexes mit Mapl-1 nicht gleichzeitig mit ihrer DNA Erkennungssequenz wechselwirken. Dies spricht für eine potentielle inhibitorische Wirkung von Mapl-1 auf die DNA-Bindung der Paired-Domäne und darüberhinaus auf die Funktion von Pax6. Die Analyse der zellulären Lokalisation ergab, daß Mapl-1 mit den zellulären Mikrotubuli assoziieren kann. Die Überexpression von Mapl-1 in kultivierten Zellen induzierte eine dramatische Reorganisation der Mikrotubuli und ihre Vernetzung zu Bündeln. Diese Assoziation, die direkt und spezifisch ist führt zu erhöhter Stabilität der zellulären Mikrotubuli und beeinflußt nicht die Organisation der anderen Komponenten des Cytoskeletts. Mapl-1 repräsentiert also ein neues Mikrotubuli assoziiertes Protein" (MAP), das keine Sequenzähnlichkeit zu den bekannten MAPs aufweist. Mapl-1 ist auch in der Lage in den Zellkern transportiert zu werden und besitzt transkriptionsstimulierende Aktivität. Die Regulation der zellulären Lokalisation von Mapl-1 steht unter der Kontrolle von Kern-Import und -Export Signalen. Die Fähigkeit von Mapl-1 gleichzeitig mit Mikrotubuli und mit Pax6 zu interagieren führt in kultivierten Zellen zur ektopischen Retention von Pax6, das ein strikt nukleäres Protein ist, an Cytoskelettfilamente. Die hier präsentierten Daten stellen zum ersten Mal eine Verbindung zwischen dem Cytoskelett und der Regulation der Aktivität der Pax-Proteine her und liefern eine Möglichkeit einige Aspekte der vielseitigen Funktion von Pax6 zu erklären.
Schlagwörter: Pax; Pax6; Paired Domäne; Transkriptionsfaktor; Protein-Protein Interaktionen; GST-Pulldown; Mikrotubuli; Mikrotubuli assoziiertes Protein; MAP