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dc.contributor.advisor Thoms, Kai-Martin Dr. de
dc.contributor.author Vollert, Seike de
dc.date.accessioned 2012-04-16T17:25:40Z de
dc.date.available 2013-01-30T23:50:25Z de
dc.date.issued 2011-05-18 de
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B1E8-5 de
dc.description.abstract Xeroderma-Pigmentosum-Gruppe-C- und G-Gen-Polymorphismen: Alternatives Splicing und funktionelle DNA-Reparatur beim multiplen MelanomK.-M. Thoms1, S. Vollert2, P. Laspe1, A. Rosenberger3, S. Emmert11Klink für Dermatologie und Venerologie, Georg-August-Universität Göttingen 2Klinik für Augenheilkunde, Universitätsklinikum Schleswig-Holstein, Campus Lübeck 3Abteilung für genetische Epidemiologie, Georg-August-Universität GöttingenBei der seltenen Krankheit Xeroderma Pigmentosum führen Defekte in den Genen, die Enzyme der Nukleotidexzisionsreparatur (NER) kodieren, zu einem >1000fach erhöhten Hautkrebsrisiko, Melanome eingeschlossen. Um herauszufinden, ob genetische Variationen in den XPC- und XPG-Genen zur Melanomentwicklung beitragen, untersuchten wir Polymorphismen, alternatives Splicing und funktionelle DNA-Reparatur in einem Hochrisikokollektiv von 30 Patienten mit sporadischen multiplen Melanomen und 30 entsprechenden gesunden Probanden. Wir analysieren 3 XPC-Gen-Polymorphsmen (Intron 11 C-6A, Exon 15 A2920C und Intron 9 poly AT), die im Kopplungsungleichgewicht liegen. Das Intron 11 -6A-Allel in der XPC Intron 11 Splice-Akzeptor-Stelle führt zu einer spontanen Überexpression einer Deletion des Exon 12 in der XPC-mRNA. In Fibroblasten führte dies zu reduzierter DNA-Reparatur, aber Lymphozyten von Probanden mit oder ohne Melanom wurden bisher noch nicht getestet. Bei allen bis auf einen unser 60 Individuen befanden sich die 3 XPC-Polymorphismen im Kopplungsungleichgewicht. Mittels quantitativer Real-time-PCR konnten wir feststellen, dass das Intron 11 -6A-Allel zu einer signifikant erhöhten Expression der mRNA-Isoform mit Deletion des Exon 12 führte. Die Expression dieser Isoform war ungefähr zweimal höher in Personen mit dem Genotyp A/A gegenüber C/C (p<0.0001). Mittels Wirtszellreaktivierungs-Assay in Lymphozyten maßen wir eine relative Nukleotidexzisionsreparatur von 26.1% bei C/C-Trägern und 16.1% in A/A-Trägern. In diesem kleinen Kollektiv konnte leider kein signifikanter Gruppenunterschied in Hinblick auf eine Assoziation mit dem Melanomrisiko herausgearbeitet werden. Wir untersuchten ebenfalls einen XPG-Gen-Polymorphismus (Exon 15 C3507G). Dieser zeigte keine Unterschiede zwischen Patienten und Kontrollen und beeinflusste die funktionelle Nukleotidexzisionsreparatur nicht. Weiterhin untersuchten wir eine spontan alternativ gesplicte XPG-mRNA-Isoform, die ein 109bp großes kryptisches Exon im Intron 1 enthält und zu einer Rasterverschiebung nach der Insertion führt, woraus ein Stopcodon nach zwei weiteren Aminosäuren resultiert. Seine funktionelle Relevanz ist noch unklar. Mittels qantitativer Real-time-PCR konnten wir eine mehr als doppelt so hohe Expression bei den Melanom-Patienten gegenüber den Kontrollen messen (p=0.0401). Diese alternativ gesplicte XPG-mRNA-Isoform könnte also als molekularer Marker für ein erhöhtes Melanomrisiko dienen. de
dc.format.mimetype application/pdf de
dc.language.iso ger de
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ de
dc.title Xeroderma-Pigmentosum-Gruppe-C- und -G-Gen-Polymorphismen: Alternatives Splicing und funktionelle DNA-Reparatur beim multiplen Melanom de
dc.type doctoralThesis de
dc.title.translated Xeroderma-Pigmentosum-group-C and -g-gene-polymorphisms: alternative splicing and functional DNA-repair in multiple melanoma patients de
dc.contributor.referee Emmert, Steffen Prof. Dr. de
dc.date.examination 2011-05-23 de
dc.subject.dnb 610 Medizin, Gesundheit de
dc.description.abstracteng Xeroderma pigmentosum C and G gene polymorphisms, alternative splicing and functional DNA repair in multiple melanoma patientsK.-M. Thoms1, S. Vollert2, P. Laspe1, A. Rosenberger3, S. Emmert11Department of Dermatology, Georg-August-University, Göttingen 2Department of Ophthalmology, University of Schleswig-Holstein, Campus Lübeck 3Department of Genetic Epidemiology, Georg-August-University, GöttingenIn the rare disease xeroderma pigmentosum (XP) defects in nucleotide excision repair (NER) genes lead to an >1000-fold increased skin cancer risk including melanoma. To investigate if genetic variances in XPC and XPG genes might contribute to the development of melanoma we investigated polymorphisms, alternative splicing and functional NER in a high risk group of 30 patients with sporadic multiple melanomas and 30 matched healthy individuals. We analyzed 3 XPC gene polymorphisms (intron 11 C-6A, exon 15 A2920C and intron 9 poly AT) which are in linkage disequilibrium. The intron 11 -6A allele within the XPC intron 11 splice acceptor site leads to a spontaneously increased exon 12 skipping in XPC mRNA. In fibroblast cell lines this resulted in diminished DNA repair but primary lymphocytes from probands with or without melanoma have not yet been tested. In all but one of our 60 individuals the 3 XPC polymorphisms were in linkage disequilibrium. Using quantitative real-time PCR we found that the intron 11 -6A allele led to a significantly increased expression of the exon 12 deleted XPC mRNA isoform. The isoform expression was about 2-fold higher in individuals carrying the A/A genotype compared to C/C carriers (p<0.0001). Using host cell reactivation in probands´ lymphocytes we measured a relative NER of 26.1% in C/C carriers and 16.1% in A/A carriers. Regarding an association with melanoma risk we could not detect significant differences in these factors between patients and controls with this number of probands. We also assessed an XPG gene polymorphism (exon 15 C3507G). This was not distributed differently between patients and controls and did not influence functional NER in the probands´ lymphocytes. In addition, we assessed a spontaneously alternatively spliced XPG mRNA isoform containing a 109 bp cryptic exon in intron 1 and leading to a frameshift after the insert which results in a stop codon two amino acids downstream. Its functional relevance is still unclear. Using quantitative real-time PCR we found that this isoform was >2-fold higher expressed in multiple melanoma patients than in controls (p=0.0401). This alternatively spliced XPG mRNA isoform might serve as a molecular marker for an increased melanoma risk. de
dc.contributor.coReferee Reiss, Jochen Prof. Dr. de
dc.contributor.thirdReferee Virsik-Köpp, Patricia Prof. Dr. de
dc.subject.topic Medicine de
dc.subject.ger Xeroderma Pigmentosum de
dc.subject.ger Melanom de
dc.subject.ger Polymorphismen de
dc.subject.ger XPC de
dc.subject.ger XPG de
dc.subject.ger alternatives Splicing de
dc.subject.ger mRNA de
dc.subject.ger DNA-Reparatur de
dc.subject.ger Nukleotidexzisionsreparatur de
dc.subject.ger Deletion de
dc.subject.ger kryptisches Exon de
dc.subject.eng xeroderma pigmentosum de
dc.subject.eng melanoma de
dc.subject.eng polymorphisms de
dc.subject.eng XPC de
dc.subject.eng XPG de
dc.subject.eng alternative splicing de
dc.subject.eng mRNA de
dc.subject.eng DNA repair de
dc.subject.eng nucleotide excision repair de
dc.subject.eng deletion de
dc.subject.eng kryptic exon de
dc.subject.bk 44.00 de
dc.identifier.urn urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-2969-6 de
dc.identifier.purl webdoc-2969 de
dc.affiliation.institute Medizinische Fakultät de
dc.subject.gokfull MED 283: Molekularbiologie {Medizin} de
dc.identifier.ppn 668299940 de

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