Verticillium longisporum induced gene expression in Arabidopsis thaliana

Tappe, Hella

dc.contributor.advisor	Gatz, Christiane Prof. Dr.	de
dc.contributor.author	Tappe, Hella	de
dc.date.accessioned	2012-05-16T12:09:48Z	de
dc.date.available	2013-01-30T23:50:50Z	de
dc.date.issued	2008-09-05	de
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B643-B	de
dc.description.abstract	Verticillium longisporum ist ein bodenbürtiger Pilz, welcher die Rapswelke hervorrufen kann. Das Pathogen dringt über die Wurzeln in die Wirtspflanze ein und wächst in Form eines Myzels im Xylem. Im späteren Infektionsverlauf befällt es schließlich die übrigen Gewebe der Pflanze. Um die Reaktionen infizierter Pflanzen zu charakterisieren wurde die Modelpflanze Arabidopsis thaliana gewählt. Es wurden Transkriptomprofile der Rosetten fünf und 18 Tage nach Infektion (dpi) aufgenommen. Fünf dpi zeigt A. thaliana noch keine Symptome. Es werden jedoch eine Reihe von Genen mit Bezug zur Jasmonsäure (JA) biosynthese oder singnaltransduktion induziert. Durch die Infektion von Pflanzen mit einer Mutation im JA-Biosyntheseweg wurde der Einfluss dieser Gene auf die Symptomentwicklung bei Arabidopsis untersucht. Die Reaktion der Pflanze 5 dpi beeinflusste den Pathophenotyp und die Expression der Verticillium longisporum induzierten Gene (VliGs) 18 Tage nach Infektion nicht. Mehr als ein Viertel (5 dpi) bzw. ein Drittel (18 dpi) der VliGs codiert für apoplastisch lokalisierte Gene, welche an Zellwandmodifikationen und potentiellen Abwehrreaktionen beteiligt sind. Ihre Induktion war Pilzisolat abhängig. Die identifizierten VliGs stellen ein nützliches Mittel zur Aufklärung des	de
dc.format.mimetype	application/pdf	de
dc.language.iso	eng	de
dc.rights.uri	http://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.html	de
dc.title	Verticillium longisporum induced gene expression in Arabidopsis thaliana	de
dc.type	doctoralThesis	de
dc.title.translated	Verticillium longisporum induzierte Genexpression in Arabidopsis thaliana	de
dc.contributor.referee	Dröge-Laser, Wolfgang PD Dr.	de
dc.date.examination	2008-04-28	de
dc.subject.dnb	580 Pflanzen (Botanik)	de
dc.description.abstracteng	Verticillium longisporum is a soil-borne fungal pathogen causing vascular disease predominantly in oilseed rape. The pathogen enters its host through the roots and maintains a parasitic life stage in the xylem before invading other tissues late in the infection cycle. Arabidopsis thaliana was used as a model plant to characterize the response of the aerial parts of the plant to the infection. Whole genome transcriptome profiling experiments of Arabidopsis Col-0 plants were performed at 5 and 18 dpi, respectively. At 5 dpi, no symptoms were detected, but a number of genes related to jasmonic acid (JA) biosynthesis or signal transduction were already expressed. However, this initial defense reaction did not influence the pathophenotype and the expression of Verticillium induced genes (VliGs) at 18 dpi as revealed by analysis of an Arabidopsis mutant deficient in JA biosynthesis. More than one fourth (5 dpi) and one third (18 dpi) of the VliGs encode apoplastically localized proteins involved in cell wall modifications and potential defense responses. Their expression was dependent on the specific fungal isolate. The identified VliGs provide a useful tool to elucidate the contribution of the induced genes to the disease phenotype and the defense response. Moreover, they might help to identify the elicitor(s) as suggested by preliminary experiments. They demonstrated that fractionated extracts from fungal cultures induced expression of a VliG when applied to the petioles of detached leaves.	de
dc.contributor.coReferee	Karlovsky, Petr Prof. Dr.	de
dc.contributor.thirdReferee	Daniel, Rolf PD Dr.	de
dc.subject.topic	Mathematics and Computer Science	de
dc.subject.ger	Arabidopsis thaliana	de
dc.subject.ger	Verticillium	de
dc.subject.ger	Transkriptom	de
dc.subject.ger	Pilzinfektion	de
dc.subject.ger	Rapswelke	de
dc.subject.eng	Arabidopsis thaliana	de
dc.subject.eng	Verticillium	de
dc.subject.eng	whole genome array	de
dc.subject.eng	fungal infection	de
dc.subject.eng	vascular disease	de
dc.subject.bk	42.13	de
dc.subject.bk	42.43	de
dc.identifier.urn	urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-1883-3	de
dc.identifier.purl	webdoc-1883	de
dc.affiliation.institute	Biologische Fakultät inkl. Psychologie	de
dc.subject.gokfull	WVN 000: Pflanzenpathologie {Botanik}	de
dc.identifier.ppn	612188442	de

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Fakultät für Biologie und Psychologie (inkl. GAUSS) [1621]

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