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Stability regulation of Gcn4p in Saccharomyces cerevisiae

dc.contributor.advisorBraus, Gerhard Prof. Dr.de
dc.contributor.authorBömeke, Katrinde
dc.date.accessioned2012-05-16T12:12:41Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:20Zde
dc.date.issued2006-05-16de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B6DA-Ade
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-1413
dc.description.abstractDie selektive schnelle Proteindegradation ist ein wichtiger Mechanismus für verschiedene biologische Ereignisse wie Zell-Zyklus-Abläufe, Signal-Transduktion und Differenzierung. Folglich hängt die Stabilität von Proteinen wie Transkriptionsfaktoren, Zyklin-abhängigen Kinasen und Zyklinen, die in diese zellulären Prozesse involviert sind, von verschiedenen Umweltveränderungen ab. Das dem JUN homologe GCN4 aus Saccharomyces cerevisiae kodiert für den globalen Schlüsselregulator eines genetischen Systems, das als die Allgemeine Kontrolle der Aminosäurebiosynthese bezeichnet wird und ist dementsprechend in der Lage, auf Aminosäuremangelbedingungen zu reagieren. Die Menge von Gcn4p wird hauptsächlich über die Kontrolle der Proteinsynthese im Zytoplasma und die Kontrolle der Proteindegradation im Kern reguliert. In gesättigten Zellen ist Gcn4p ein schwach exprimiertes und sehr instabiles Protein, wohingegen dessen Translationsrate und Stabilität als Antwort auf Aminosäuremangel ansteigt.Die Aminosäure-abhängige Gcn4p Degradation wird über dessen Phosphorylierung durch die nukleäre Zyklin-abhängige Kinase Pho85p mit dem Zyklin Pcl5p reguliert. Als initiierender Schritt der Gcn4p Stabilisierung wurde die Dissoziation dieses Kinase/Zyklin Komplexes identifiziert. Des Weiteren konnten der Zyklin-abhängige Kinase Inhibitor Pho81p und ein weiteres Pho85p-Zyklin, Pcl7p, identifiziert werden, die für die Aminosäure-abhängige Stabilisierung von Gcn4p notwendig sind. Beides sind kernlokalisierte und konstitutiv exprimierte Proteine, die nicht für die Dissoziation von Pho85p/Pcl5p unter Aminosäuremangel benötigt werden. Pho81p interagiert mit Pcl5p nur unter Gcn4p-degradierenden Bedingungen, wohingegen die Interaktion zu Pcl7p einen konstitutiven Prozess darstellt. Die Substrat-Spezifität von Pho85p für Gcn4p wird durch das instabile Zyklin Pcl5p vermittelt. Die Kontrolle der Pcl5p Lokalisierung in der Zelle wurde als potentieller, für die funktionelle Spezifität des Kinase/Zyklin Komplexes benötigter Mechanismus untersucht. Die Kernlokalisierung von Pcl5p verläuft unabhängig von Aminosäuremangelbedingungen und den Proteinen Pho85p, Gcn4p und Pho81p. Im Gegensatz dazu ist das β-Importin Kap95p als ein für den Kernimport dieses Zyklins benötigtes Protein identifiziert worden. Deletions- und Transferexperimente von Pcl5p und Pcl5p/Pho80p Chimären wurden durchgeführt, um wichtige Domänen des Zyklins zu ermitteln. Diese Untersuchungen identifizierten eine zentrale Substrat-Spezifitätsdomäne von Pcl5p gefolgt von einem C-terminalen, für die Kernlokalisierung ausreichenden Bereich dieses Zyklins.Die Aminosäuremangel-induzierte Adhäsion ist abhängig von der GCN4 Expression und dem Zelloberflächen-Flokkulin Flo11p. Um die Bedeutung der Degradation von Gcn4p für dessen transkriptionelle Aktivität zu untersuchen, wurde durch den Gcn4p Aminosäureaustausch Leu267Ser oder mittels einer PCL5 Deletion eine stabilisierte Form von Gcn4p hergestellt. In beiden Fällen ist die Aminosäuremangel-induzierte Gcn4p Aktivität beeinträchtigt und die Adhäsion bzw. FLO11 Expression durch Aminosäuremangel nicht mehr induzierbar. Das deutet darauf hin, dass Proteinabbau und transkriptionelle Aktivierung gekoppelte Prozesse in der Zelle sind.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.htmlde
dc.titleStability regulation of Gcn4p in Saccharomyces cerevisiaede
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedStabilitätsregulation von Gcn4p in Saccharomyces cerevisiaede
dc.contributor.refereeBraus, Gerhard Prof. Dr.de
dc.date.examination2006-05-10de
dc.subject.dnb500 Naturwissenschaften allgemeinde
dc.description.abstractengSelective rapid protein degradation is an important mechanism for distinct biological events, including cell cycle progression, signal-transduction, and differentiation. Thus, the stability of proteins involved in these cellular processes such as transcription factors, cyclin-dependent kinases, and cyclins depend on different environmental changes. The JUN homolog GCN4 of Saccharomyces cerevisiae encodes a global key regulator of a genetic network known as the general amino acid control and is therefore able to respond to starvation of amino acids. The amount of Gcn4p is mainly regulated via control of its protein synthesis in the cytoplasm and control of protein degradation in the nucleus. In sated cells, Gcn4p is weakly expressed and highly unstable, whereas its translation rate and protein stability increase upon amino acid limitation conditions.The amino acid-dependent Gcn4p degradation pathway is regulated via the phosphorylation by the nuclear cyclin-dependent kinase Pho85p in complex with the cyclin Pcl5p. As initial step of Gcn4p stabilization upon amino acid starvation the disassembly of the Pho85p/Pcl5p complex was identified. Furthermore, the proteins Pho81p, a cyclin-dependent kinase inhibitor, and Pcl7p, another Pho85p cyclin, were shown to be required for amino acid-dependent Gcn4p stabilization. Both proteins are nuclear and constantly present and not required for dissociation of Pho85p/Pcl5p in response to amino acid starvation conditions. Whereas Pho81p interacts with Pcl5p only when Gcn4p is degraded, binding to Pcl7p is a constitutive process.The Pho85p substrate specificity for Gcn4p is mediated by the unstable cyclin Pcl5p. The control of Pcl5p sub-cellular localization was analyzed as a possible mechanism required for functional specificity of the kinase/cyclin complex. Nuclear localization of Pcl5p is independent of the availability of amino acids, Pho85p, Gcn4p, and Pho81p. In contrast, the β-importin Kap95p has been identified to be required for nuclear import of this cyclin. Deletion and transfer experiments of Pcl5p and Pcl5p/Pho80p chimera were performed to analyse important domains of cyclin Pcl5p. These investigations identified a central substrate specificity domain of Pcl5p followed by a C-terminal domain providing nuclear targeting.Amino acid starvation-induced adherence depends on GCN4 expression and the cell-surface flocculin Flo11p. To analyse the importance of Gcn4p turnover for the transcriptional activity of this protein, a stabilized Gcn4p version was created by the expression of GCN4LEU267SER or deletion of PCL5. In both cases, the amino acid starvation-induced Gcn4p activity is affected, and furthermore, adhesion and FLO11 expression are not inducible in response to amino acid limitation. This suggests a linkage between transcriptional activation and protein degradation.de
dc.contributor.coRefereeHoppert, Michael PD Dr.de
dc.contributor.thirdRefereeIrniger, Stefan PD Dr.de
dc.subject.topicMathematics and Computer Sciencede
dc.subject.gerGcn4pde
dc.subject.gerZyklinede
dc.subject.gerTranskriptionsfaktorde
dc.subject.gerDegradationde
dc.subject.gerLokalisierungde
dc.subject.engGcn4pde
dc.subject.engcyclinsde
dc.subject.engtranscription factorde
dc.subject.engdegradationde
dc.subject.englocalizationde
dc.subject.bk30.03 Methoden und Techniken in der Naturwissenschaftde
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-721-0de
dc.identifier.purlwebdoc-721de
dc.affiliation.instituteBiologische Fakultät inkl. Psychologiede
dc.subject.gokfullRA000 Allgemeine Naturwissenschaftende
dc.identifier.ppn514897635de


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