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dc.contributor.advisor Walter, Lutz Prof. Dr. de
dc.contributor.author Albrecht, Christina de
dc.date.accessioned 2013-01-14T15:06:56Z de
dc.date.available 2013-01-30T23:50:52Z de
dc.date.issued 2013-01-09 de
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-000D-EF91-8 de
dc.description.abstract Zahlreiche epidemiologische Studien im Menschen haben gezeigt, dass ein Zusammenhang zwischen KIR/MHC-Klasse-I Genkombinationen und dem Krankheitsverlauf einer HIV-1 Infektion besteht. Diese Erkenntnisse deuten darauf hin, dass KIR-exprimierende NK Zellen eine entscheidende Rolle bei der Immunabwehr von HIV spielen. Ein wichtiges Tiermodel für die Untersuchung von HIV Erkrankungen sind SIV-Infektionsstudien mit Rhesusaffen. Die Rolle von KIR und MHC-Klasse-I Genen bei einer SIV-Infektion wurde mit Hilfe einer Kohorte von 52 SIV-infizierten Rhesusaffen (SIVmac239 und SIVmac251) retrospektiv untersucht. Dazu wurden cDNA-PCR Amplikons mittels 454-Sequenzierung analysiert. Die Kohorte wurde anhand der unterschiedlichen Viruslasten während des „viralen Setpoints“ klassifiziert. Die Einteilung erfolgte dabei in zwei Gruppen: Tiere mit hoher Viruslast (HVL, „high viral load“) und mit niedriger Viruslast (LVL, „low viral load“). Die Sequenzierung von MHC-Kasse-I Transkripten konnte bestätigen, dass Mamu-A1*004 mit einem schnellen Krankheitsverlauf einer SIV-Infektion assoziiert ist, was bereits aus anderen Untersuchungen hervorgegangen war. Vergleichbar mit den humanen KIR3D Genen, welche mit unterschiedlichen HIV-1 Krankheitsverläufen assoziiert wurden, hat die hier durchgeführte Analyse mehrere inhibitorische (KIR3DL01, KIR3DL02, KIR3DL05, KIR3DL07, KIR3DL08, KIR3DL10) und aktivierende (KIR3DS02) Rhesusaffen-KIR3D Transkripte detektiert, die ebenfalls mit unterschiedlichen SIV-Viruslasten korrelieren. Die Transkripte von KIR3DL05 und KIR3DL10 wurden mit einer hohen viralen Replikationsrate assoziiert, während KIR3DL02 und KIR3DL08 Transkripte häufiger bei Tieren mit niedrigen Viruslasten, bzw. „Elite Controller“-Tieren detektiert wurden. Der Vergleich von KIR-Transkriptionsprofilen einzelner Rhesusaffen, zwischen drei Zeitpunkten während der SIV-Infektion (prä, akute und chronische Infektion), hat gezeigt, dass die relativen Transkriptionslevel von vier inhibitorischen KIR Genen (KIR3DL01, KIR3DL05, KIR3DL07, KIR3DL08) und einem aktivierenden KIR Gen (KIR3DS02), durch experimentelle SIV-Infektion, in der untersuchten Rhesusaffen Kohorte, beeinflusst wurden. Die erhöhten Expressionslevel von KIR3DL05 Transkripten und die zeitgleich schwächeren Expressionslevel von KIR3DL07 Transkripten korrelieren invers in der akuten Phase der Infektion in der HVL Kohorte. Neben den KIR Gen Untersuchungen wurden ebenfalls umfassende “microfluidic-based real-time PCR de
dc.format.mimetype application/pdf de
dc.language.iso eng de
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ de
dc.title Association of killer immunoglobulin-like receptor genes with viral loads in experimental SIV infection of rhesus macaques (Macaca mulatta) de
dc.type doctoralThesis de
dc.title.translated Untersuchung von Killer-Immunoglobulin-ähnlichen-Rezeptorgenen im Zusammenhang mit Viruslasten in experimentell SIV infizierten Rhesusaffen (Macaca mulatta) de
dc.contributor.referee Walter, Lutz Prof. Dr. de
dc.date.examination 2012-09-17 de
dc.subject.dnb 570 Biowissenschaften, Biologie de
dc.subject.gok Molekularbiologie (PPN61946299X) de
dc.description.abstracteng Multiple epidemiological studies in human demonstrated associations between KIR/MHC class I gene combinations and HIV-1 disease progression, implicating important roles of KIR-expressing NK cells in defencing HIV. The nonhuman primate model of HIV is exemplified by SIV-infection of rhesus macaques. The role of KIR and MHC class I genes in SIV infection was studied in a cohort of 52 SIV-infected rhesus macaques (SIVmac239 and SIVmac251) by performing 454 sequencing of respective cDNA-PCR amplicons. The cohort was divided into high (HVL) and low (LVL) viral load according to plasma viral loads at set point. Analysis of MHC class I gene transcription confirmed previous results of Mamu-A1*004 being associated with fast SIV-disease progression. Similar to human KIR3D genes, which are associated with HIV-1 disease progression, the analysis revealed transcribed inhibitory (KIR3DL01, KIR3DL02, KIR3DL05, KIR3DL07, KIR3DL08, KIR3DL10) and activating (KIR3DS02) rhesus macaque KIR3D genes, which are significantly associated with higher or lower viral loads. KIR3DL05 and KIR3DL10 transcripts were associated with high viral replication, whereas KIR3DL02 and KIR3DL08 transcripts were associated with low viral loads and elite controllers, respectively. The KIR transcription profiles of rhesus macaques derived from sampled covering three different time points (pre, acute and chronic infection) showed that the relative transcription levels of four different inhibitory KIR genes (KIR3DL01, KIR3DL05, KIR3DL07, KIR3DL08) and one activating KIR gene (KIR3DS02) were influenced by experimental SIV infection in the cohort of rhesus macaques. The increased expression levels of KIR3DL05 transcripts and the decreased expression levels of KIR3DL07 transcripts in the acute phase of infection are inversely correlated in the HVL cohort. Besides the KIR gene studies, comprehensive microfluidic-based real-time PCR analyses of 46 immune genes and cell markers reflected typical immune activation in response to SIV infection, like activation of NK cells and T cells. Animals with high viral loads showed more vigorous responses than animals of the low viral cohort. The characteristic loss of CD4+ T cells during SIV infection was detected in particular in the HVL cohort. de
dc.contributor.coReferee Reichardt, Holger Prof. Dr. de
dc.contributor.thirdReferee Kessel, Michael Prof. Dr. de
dc.subject.topic Biology (incl. Psychology) de
dc.subject.ger Immunologie de
dc.subject.ger NK Zellen de
dc.subject.ger KIR de
dc.subject.ger SIV de
dc.subject.ger Rhesusaffe de
dc.subject.eng Immunology de
dc.subject.eng NK cells de
dc.subject.eng KIR de
dc.subject.eng SIV de
dc.subject.eng Rhesus macaque de
dc.subject.bk Molekulargenetik de
dc.subject.bk Gentechnologie -> 42.13 (Molekularbiologie) de
dc.identifier.urn urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-3860-6 de
dc.identifier.purl webdoc-3860 de
dc.affiliation.institute Biologische Fakultät de
dc.identifier.ppn 773354786

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