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Entwicklung und Optimierung eines Cytometric Bead Arrays zum Nachweis von afrikanischen hämorrhagischen Fieberviren

dc.contributor.advisorHufert, Frank Torsten Prof. Dr.de
dc.contributor.authorNordmann, Tamarade
dc.date.accessioned2013-01-14T15:16:56Zde
dc.date.available2013-01-30T23:50:28Zde
dc.date.issued2012-04-23de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-000D-EFA5-Bde
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-1511
dc.description.abstractBei Viralen Hämorrhagischen Fiebern (VHF) handelt es sich um akute Infektionen mit hoher Infektiösität und hoher Letalität. Meist ist keine effektive Impfung oder kausale Therapie vorhanden oder sie ist nur begrenzt verfügbar. Aus diesem Grund besitzen viele der hämorrhagischen Fieberviren (HFV) auch ein hohes Risiko als biologische Kampfstoffe verwendet zu werden. Bei einem Ausbruch eines HFV kann es zur schnellen Verbreitung der Infektion kommen, sodass in kurzer Zeit eine große Anzahl an Proben auf mehrere HFV simultan getestet werden muss. Die etablierten Diagnostikmethoden von HFV basieren auf der Kombination von Virusisolation, molekularen (z.B. Real-Time‐PCR) und serologischen Nachweisverfahren (z.B. ELISA). Dennoch gibt es bisher kein diagnostisches Mittel um allen Anforderungen der HFV-Diagnostik gleichzeitig gerecht zu werden. In dieser Dissertation wurde deshalb ein Cytometric Bead Array (CBA) zum Nachweis der acht wichtigsten afrikanischen HFV (Lassa-Virus, Krim-Kongo-Virus, Rift-Valley-Fieber-Virus, Ebola-Zaire-Virus, Ebola-Sudan-Virus, Marburg-Virus, Dengue-Virus und Gelbfieber-Virus) entwickelt. Hierzu wurden aminierte virusspezifische Oligonukleotidsonden generiert und kovalent an carboxylierte, fluoreszenz-codierte Beads gekoppelt. Die verschiedenen afrikanischen HFV wurden simultan eine asymmetrische Reverse-Transkriptase-Multiplex‐PCR amplifiziert, für die zur späteren Detektion im Durchflusszytometer biotinylierte Reverse-Primer verwendet wurden. Anschließend konnten die biotinylierten Produkte der Multiplex‐RT‐PCR an die Bead-gekoppelten Oligonukleotidsonden hybridisiert werden. Die Analyse der erfolgreichen Hybridisierung am Durchflusszytometer basierte auf dem Nachweis eines durch Streptavidin konjugierten Fluoreszenzfarbstoffes, Phycoerythrin. In dem HFV-CBA aus dieser Arbeit war es sowohl im Uniplex-Hybridisierungsverfahren als auch im Multiplex-Hybridisierungsverfahren möglich alle acht HFV zu detektieren und spezifisch zu unterscheiden. Kreuzreaktivitäten wurden nicht beobachtet. Die analytische Sensitivität von 10^4-10^5 Moleküle/ml lag unter der durchschnittlichen Viruslast bei einer VHF-Infektion am Tag 6. der Infektion und war damit vergleichbar mit der Sensitivität quantitativer Real-time-PCR- Verfahren. Somit ist der in dieser Arbeit entwickelte CBA ein ideales Verfahren zur HFV-Diagnostik, das zeitsparend ist, eine hohe Spezifität und Sensitivität sowie eine gute Reproduzierbarkeit aufweist und einen hohen Probendurchlauf mit simultaner Detektion eines ganzen Spektrums verschiedener HFV ermöglicht.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isogerde
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/de
dc.titleEntwicklung und Optimierung eines Cytometric Bead Arrays zum Nachweis von afrikanischen hämorrhagischen Fiebervirende
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedDevelopement and optimization of a cytometric bead array for the detection of african hemorrhagic fever virusesde
dc.contributor.refereeHufert, Frank Torsten Prof. Dr.de
dc.date.examination2012-04-24de
dc.subject.dnb610 Medizin, Gesundheitde
dc.subject.gokMED 332 Medizinische Virologiede
dc.description.abstractengViral hemorrhagic fevers (VHF) are acute infections with high infectivity and high case fatality rates. In most of the cases an effective vaccination or causal therapy does not exist or their availability is limited. Therefore hemorrhagic fever viruses (HFV) have a high risk of being used as biological warfare agents. During an outbreak the infection can spread rapidly so that huge amounts of samples need to be tested for HFV simultaneously. The established diagnostic methods of HFV are based on the combination of virus isolation, molecular (e.g. Real-time-PCR) and serological methods (e.g. ELISA). Nevertheless, a diagnostic tool to meet all requirements of the HFV-diagnostics in one tool does not exist. In this dissertation a Cytometric Bead Array (CBA) was therefore developed for the detection of eight of the most important african HFV: Lassa-Virus (LASV), Rift-Valley-Fever-Virus (RVFV), Crim-Congo-Hemorrhagic-Fever-Virus (CCHFV), Ebola-Zaire-Virus (EBOVZ), Ebola-Sudan-Virus (EBOVS), Marburg-Virus (MARV), Yellow-Fever-Virus (YFV), Dengue-Virus (DENV). For this purpose aminated virus-specific oligonucleotide probes were generated and conjugated to fluorescense-coded carboxy beads. The different african HFV were simultanously amplified by asymmetric reverse-transcription-multiplex-PCR using a biotiniyated reverse primer The biotinylated products of the multiplex-PCR were hybridized to the bead-coupled probes und subjected to subsequent detection in a flow cytometer. The analysis of the successful hybridization in the flow cytometer based on the detection of the streptavidin conjugated fluorescent reporter molecule Phycoerythrin attaching to the biotinylated PCR products. All eight african HFV were detected and specifically distinguished in uniplex-hybridization and in multiplex-hybridization. Cross-reactions were not observed. The determined analytic sensitivity of 10^4-10^5 molecules/ml for the multiplex assay ranged below the average viral load of a VHF-Infection on day 6 post-infection and can be compared with the sensitivity of a quantitative real-time-PCR. Consequently the CBA developed in this dissertation is an ideal method for HFV-diagnostics which is time-saving, highly specific, and shows high sensitivity and good reproducibility making high sample throughput possible while simultaneously detecting a whole spectrum of different HFV.de
dc.contributor.coRefereePöhlmann, Stefan Prof. Dr.de
dc.contributor.thirdRefereeOppermann, Martin Prof. Dr.de
dc.subject.topicMedicinede
dc.subject.gervirale hämorrhagische Fieberde
dc.subject.gerhämorrhagische Fiebervirende
dc.subject.gercytometric bead arrayde
dc.subject.gerDurchflusszytometerde
dc.subject.gerMikrobeadsde
dc.subject.germultiplex-PCRde
dc.subject.engviral hemorrhagic feversde
dc.subject.enghemorragic fever virusesde
dc.subject.engcytometric bead arrayde
dc.subject.engflow cytometerde
dc.subject.engmicrobeadsde
dc.subject.engmultiplex-pcrde
dc.subject.bk44.43 Medizinische Mikrobiologiede
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-3476-4de
dc.identifier.purlwebdoc-3476de
dc.affiliation.instituteMedizinische Fakultätde
dc.identifier.ppn737897953de


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