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EPISTATIC KINSHIP - A NEW MEASURE FOR THE ASSESSMENT OF GENETIC DIVERSITY IN LIVESTOCK POPULATIONS

dc.contributor.advisorSimianer, Henner Prof. Dr.de
dc.contributor.authorFlury, Christinede
dc.date.accessioned2006-03-13T14:40:39Zde
dc.date.accessioned2013-01-18T10:09:17Zde
dc.date.available2013-01-30T23:51:16Zde
dc.date.issued2006-03-13de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AB72-9de
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.53846/goediss-1700
dc.description.abstractDas Ziel der vorliegenden Dissertation war die Erweiterung der Betrachtungseinheit des Abstammungskoeffizienten von einzelnen Loci auf Chromosomensegmente der Länge x in Morgan. Das neue Maß mit der Bezeichnung epistatische Kinship beschreibt die Wahrscheinlichkeit, dass zwei zufällig gezogene Chromosomen-segmente herkunftsgleich sind. In einer Simulationsstudie wurden die genetischen Eigenschaften von Chromosomensegmenten theoretisch untersucht. Im Weiteren wurde die markergestützte Schätzung der epistatischen Kinship untersucht, da Abstammungsinformation in kleinen Nutztieropulationen oft nicht verfügbar ist. Abschliessend wurden die Eigenschaften der epistatischen Kinship anhand von praktischen Daten untersucht. Dazu wurden DNA-Proben aus drei Subpopulationen des Göttinger Minischweines für sechs Chromosomensegmente mit Mikrosatelliten typisiert. Die markergestützte epistatische Kinship variierte zwischen den einzelnen Segmenten. Durch die Verwendung eines Korrekturfaktors für zustands- jedoch nicht herkunftsgleiche Segmente wurde die Variabilität zwischen den Segmenten kleiner. Zur Abschätzung der genetischen Diversität wurde ein genetisches Distanzmass hergeleitet, in welchem die genetischen Diversität zwischen wie auch innerhalb Populationen berücksichtigt wird. Die Reihenfolge der genetischen Distanzen für die markergestützten Schätzungen stimmte mit der Reihenfolge der pedigreebasierten Erwartungswerte überein. Basierend auf den Ergebnissen wird die epistatische Kinship als neues Maß zur Bestimmung der genetischen Diversität in Nutztierpopulationen mit kurzem Entwicklungszeitraum vorgeschlagen.de
dc.format.mimetypeapplication/pdfde
dc.language.isoengde
dc.rights.urihttp://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.htmlde
dc.titleEPISTATIC KINSHIP - A NEW MEASURE FOR THE ASSESSMENT OF GENETIC DIVERSITY IN LIVESTOCK POPULATIONSde
dc.typedoctoralThesisde
dc.title.translatedEPISTATISCHE KINSHIP - EIN NEUES MASS ZUR BESTIMMUNG GENETISCHER DIVERSITÄT IN NUTZTIERPOPULATIONENde
dc.contributor.refereeSimianer, Henner Prof. Dr.de
dc.date.examination2006-02-02de
dc.subject.dnb630 Landwirtschaftde
dc.subject.dnbVeterinärmedizinde
dc.description.abstractengThe main goal of this thesis was the extension of the single locus concept of the kinship coefficient to chromosomal segments of length x in Morgan. The metric - called epistatic kinship - describes the probability that two randomly drawn segments are identical by descent. In a simulation study the genetic properties of chromosomal segments were investigated theoretically. Further the use of marker based epistatic kinship was investigated for situations where pedigree information is not available. Finally the marker based epistatic kinship was evaluated on practical data. Therefore DNA-samples from three subpopulations of the Goettingen minipig were genotyped for six chromosomal segments defined with microsatellites. The statistical analysis revealed a remarkable variability of epistatic kinship between segments. The variability decreased applying a correction factor for identity by state. To estimate genetic diversity a genetic distance measure considering the epistatic kinship between and within populations was proposed. The distances for the three subpopulations of the Goettingen minipig resulted in the same order for the pedigree based expectations and the marker based epistatic kinship distances. Based on the results the epistatic kinship is proposed as a new measure for the assessment of genetic diversity for short term phylogenies, which are often found in livestock populations.de
dc.contributor.coRefereeThaller, Georg Prof. Dr.de
dc.contributor.thirdRefereeWollny, Clemens Prof. Dr.de
dc.subject.topicAgricultural Sciencesde
dc.subject.enggenetic diversityde
dc.subject.engchromosome segmentsde
dc.subject.engidentity by descentde
dc.subject.engmicrosatellites. Göttingen minipigde
dc.subject.enggenetische Diversitätde
dc.subject.engChromosomensegmentede
dc.subject.engHerkunftsgleichheitde
dc.subject.engMikrosatellitende
dc.subject.engGöttinger Miniaturschweinde
dc.subject.bk48de
dc.identifier.urnurn:nbn:de:gbv:7-webdoc-680-1de
dc.identifier.purlwebdoc-680de
dc.affiliation.instituteFakultät für Agrarwissenschaftende
dc.subject.gokfullYFde
dc.identifier.ppn51498659Xde


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