Development of Fluorescence Activated Synaptosome Sorting (FASS) and analysis of VGLUT1 synapses from mouse brain
Entwicklung von „Fluorescence Activated Synaptosome Sorting“ (FASS) und die Analyse von VGLUT1-Synapsen des Mäusehirns
by Christoph Biesemann
Date of Examination:2010-11-11
Date of issue:2012-10-05
Advisor:Dr. Etienne Herzog
Referee:Prof. Dr. Nils Brose
Referee:Dr. Dieter Klopfenstein
Referee:Prof. Dr. Reinhard Jahn
Files in this item
Name:biesemann.pdf
Size:10.5Mb
Format:PDF
Abstract
English
Signal propagation between neurons in the brain is mediated by chemical synapses. Depending on the neurotransmitters and their receptors, synapses can transmit excitatory, inhibitory, or modulatory signals. A detailed knowledge about the biochemical composition of different subtypes of synapses is an essential requirement in order to study their function in physiology and pathology of the brain. Synaptosomes are functional nerve-terminals, including pre- and postsynapse, which have routinely been isolated from brain tissue by differential and density gradient centrifugation protocols since 1960. Synaptosome preparations have been utilized widely to analyze the function and protein composition of synapses for several decades. However, the interpretation of corresponding data is confounded by the fact that such synaptosome preparations contain many different types of synaptic particles as well as contaminations by non-synaptic particles from neurons and glia. In the present study, I established a new method, termed Fluorescence Activated Synaptosome Sorting (FASS), which extends traditional synaptosome preparations by selecting only fluorescent synapses using a cell sorter. A recently established fluorescent VGLUT1venus knock-in mouse line was used as a source of fluorescent VGLUT1 synaptosomes. I show here that FASS allows for the isolation of highly pure VGLUT1 synaptosomes containing pre- and post-synaptic elements. Further analysis of FASS purified VGLUT1venus synaptosomes provided insights into the synaptic distribution of neuroligins and into the distribution of glutamate receptors to synaptic and extrasynaptic sites. Using proteomic techniques I identified new proteins enriched at VGLUT1 synapses. For 3 of them (FXYD6, Ly6H and TPD52) I confirmed their expression and localization with independent methods. Taken together, this work shows that FASS is a powerful new tool to purify highly pure synaptic material which can serve to characterize synapses in biochemical, physiological and pathophysiological studies.
Keywords: Vesicular Glutamate Transporter; VGLUT; Fluorescence Activated Synaptosome Sorting; FASS; FACS; flow cytometry; synaptosome; proteomics; subcellular fractionation; synapse; FXYD6; Tpd52
Other Languages
Im Gehirn werden Signale zwischen
Nervenzellen an chemischen Synapsen übermittelt. Ob eine Synapse
dabei erregende, hemmende oder modulatorische Signale überträgt,
hängt von den beteiligten Neurotransmittern und deren
Neurotransmitter-Rezeptoren ab. Um die physiologische Funktion
dieser unterschiedlichen synaptischen Subtypen und deren
Beteiligung an pathologischen Prozessen im Gehirn zu untersuchen,
ist die detaillierte Kenntnis ihrer biochemischen Zusammensetzung
eine notwendige Vorraussetzung. Um die Proteinzusammensetzung und
Funktion von Synapsen zu erforschen, fanden in den letzten
Jahrzehnten Synaptosomenpräparationen breite Anwendung in der
Wissenschaft. Als Synaptosomen bezeichnet man funktionelle
synaptische Einheiten, die sowohl die Prä- als auch die Postsynapse
enthalten und die seit 1960 routinemäßig mittels differentieller
und Dichtegradientenzentrifugation aus Hirngewebe isoliert werden.
Die Interpretation der von Synaptosomenpräparationen gewonnen Daten
wird allerdings dadurch erschwert, dass die konventionelle
Synaptosomenpräparation ein Gemisch von synaptischen Partikel aller
synaptischen Subtypen enthält und durch einen beträchtlichen Anteil
nicht-synaptischer Partikel, die von Glia und Neuronen stammen,
verunreinigt ist. In der vorliegenden Arbeit habe ich zur weiteren
Spezifizierung eine neue Methode entwickelt, welche die
konventionelle Synaptosomenpräparation um die spezifische Selektion
von fluoureszenten Synaptosomen mittels eines FACS-Gerätes
erweitert. Hierbei diente eine vor kurzem in unserer Arbeitsgruppe
entwickelte fluoreszente VGLUT1VENUS knock-in Mauslinie als Quelle
fluoreszenter VGLUT1-Synapsen. Im Folgenden zeige ich, dass durch
die von mir als „Flourescent Activated Synaptosome Sorting“ (FASS)
bezeichnete Methode äußerst reine VGLUT1-Synaptosomen isoliert
werden, die sowohl prä- als auch postsynaptische Bestandteile
enthalten. Die weitere Untersuchung der FASS-aufgereinigten
VGLUT1VENUS-Synaptosomen liefert Erkenntnisse über die synaptische
Verteilung der Neuroligine und zeigt Unterschiede in der Verteilung
von Glutamatrezeptoren zwischen synaptischen und extrasynaptischen
Zonen. Eine Proteomanalyse zeigt die spezifische Anreicherung von
163 Proteinen in VGLUT1-Synapsen. Darunter sind viele bekannte
synaptische Proteine, aber auch eine Vielzahl von Proteinen, für
die noch keine Daten zur Lokalisation an VGLUT1-Synapsen vorliegen.
Für drei dieser Proteine, nämlich FXYD6, Ly6H und TPD52, wird die
Expression und Lokalisation an VGLUT1-Synapsen mit unabhängigen
Methoden bestätigt. Zusammengenommen zeigt die vorliegende Arbeit,
dass FASS ein neues und adäquates Verfahren für die Anreicherung
von höchst reinem synaptischen Material ist, welches verwendet
werden kann, um spezifische synaptische Subtypen in biochemischen,
physiologischen oder pathophysiologischen Studien zu
untersuchen.
Schlagwörter: Vesikulärer Glutamattransporter; VGLUT; Fluorescence Activated Synaptosome Sorting; FASS; FACS; Durchflusszytometrie; Synaptosom; Proteom; Subzelluläre Fraktionierung; Synapse; FXYD6; Tpd52